Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YMN9

Protein Details
Accession C7YMN9    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-350EERIRRYKEFKEFKKRICVABasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, cyto 12, nucl 11, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0000346  C:transcription export complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0031509  P:subtelomeric heterochromatin formation  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
KEGG nhe:NECHADRAFT_59311  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17950  DEADc_DDX39  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSHEEDLIDYSDEEIGGNETAATTSNGKKGELAAGNNVDKKGSYVGIHSTGFRDFLLKAELLRAIADCGFEHPSEVQQTCIPQALLGGDIICQAKSGLGKTAVFVLATLQQVEPVNGEVSVVVMCHTRELAYQIRDEYNRFSKYMPDIKTGVFYGGTPIKTDVETLKNKETCPHIIVGTPGRLKALVRDKALRLGSVRIFVLDECDKMLDQPDMRTDVQDVFRATPQQKQVMMFSATLSEEVKPICRKFMQNPTEHYVDEDTKLTLHGLQQYYIKLEEKEKNRKLNELLDDLQFNQVIIFVRSTVRATELDKLLRECNFPSIAVHSGVSQEERIRRYKEFKEFKKRICVATDVFGRGIDIERINLAINYDLSNDASSYLHRVGRAGRFGTKGLAISFVSTDQDQEVLKEIEKRFEVALPEFPKEGVDASTYMAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.09
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.09
9 0.1
10 0.12
11 0.16
12 0.21
13 0.22
14 0.22
15 0.23
16 0.24
17 0.29
18 0.3
19 0.29
20 0.31
21 0.36
22 0.4
23 0.42
24 0.4
25 0.33
26 0.28
27 0.27
28 0.24
29 0.2
30 0.17
31 0.16
32 0.2
33 0.24
34 0.25
35 0.24
36 0.24
37 0.22
38 0.22
39 0.19
40 0.17
41 0.13
42 0.14
43 0.17
44 0.15
45 0.14
46 0.16
47 0.17
48 0.15
49 0.16
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.11
55 0.12
56 0.14
57 0.13
58 0.15
59 0.14
60 0.16
61 0.21
62 0.21
63 0.2
64 0.19
65 0.21
66 0.21
67 0.22
68 0.19
69 0.13
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.08
75 0.06
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.13
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.19
89 0.17
90 0.15
91 0.14
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.11
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.11
117 0.17
118 0.17
119 0.19
120 0.21
121 0.24
122 0.25
123 0.26
124 0.28
125 0.29
126 0.3
127 0.29
128 0.27
129 0.27
130 0.33
131 0.39
132 0.36
133 0.33
134 0.33
135 0.32
136 0.34
137 0.3
138 0.24
139 0.16
140 0.13
141 0.13
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.18
151 0.23
152 0.26
153 0.32
154 0.33
155 0.33
156 0.35
157 0.36
158 0.32
159 0.3
160 0.27
161 0.21
162 0.19
163 0.22
164 0.21
165 0.21
166 0.19
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.19
172 0.26
173 0.26
174 0.28
175 0.31
176 0.32
177 0.37
178 0.37
179 0.32
180 0.24
181 0.22
182 0.21
183 0.19
184 0.18
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.14
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.19
211 0.18
212 0.2
213 0.22
214 0.23
215 0.24
216 0.24
217 0.24
218 0.23
219 0.23
220 0.19
221 0.16
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.11
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.2
234 0.23
235 0.28
236 0.39
237 0.42
238 0.42
239 0.47
240 0.48
241 0.47
242 0.44
243 0.38
244 0.31
245 0.25
246 0.22
247 0.18
248 0.13
249 0.11
250 0.12
251 0.11
252 0.09
253 0.1
254 0.14
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.19
262 0.14
263 0.2
264 0.26
265 0.33
266 0.43
267 0.48
268 0.55
269 0.55
270 0.58
271 0.56
272 0.55
273 0.51
274 0.45
275 0.41
276 0.34
277 0.33
278 0.29
279 0.27
280 0.2
281 0.16
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.09
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.12
293 0.12
294 0.14
295 0.18
296 0.21
297 0.22
298 0.24
299 0.25
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.22
304 0.22
305 0.21
306 0.19
307 0.18
308 0.18
309 0.19
310 0.18
311 0.17
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.15
316 0.13
317 0.15
318 0.2
319 0.23
320 0.28
321 0.31
322 0.35
323 0.42
324 0.48
325 0.55
326 0.6
327 0.67
328 0.72
329 0.77
330 0.79
331 0.82
332 0.78
333 0.71
334 0.64
335 0.59
336 0.5
337 0.49
338 0.47
339 0.38
340 0.34
341 0.3
342 0.26
343 0.22
344 0.21
345 0.17
346 0.13
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.14
365 0.17
366 0.18
367 0.18
368 0.2
369 0.25
370 0.31
371 0.36
372 0.34
373 0.35
374 0.36
375 0.36
376 0.37
377 0.32
378 0.28
379 0.22
380 0.22
381 0.18
382 0.17
383 0.17
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.12
389 0.14
390 0.13
391 0.13
392 0.16
393 0.16
394 0.18
395 0.25
396 0.26
397 0.3
398 0.31
399 0.32
400 0.29
401 0.31
402 0.33
403 0.29
404 0.36
405 0.33
406 0.35
407 0.34
408 0.32
409 0.29
410 0.25
411 0.24
412 0.16
413 0.15
414 0.13