Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8EX80

Protein Details
Accession A0A1B8EX80    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-155LPNNKPKPTPLPEQKPKFKTHydrophilic
216-243LRGKPEEPKKPLKPKKPEKPEKPVFNTYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-180KKPA
212-237KDYGLRGKPEEPKKPLKPKKPEKPEK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9, mito 8, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSTKEDRRRVGLYPDNRVAPLLKTVGGKSTARNPTQKNTRTSTATAGNDSKKRKTESLPPVDASDSDDSNNGDIKSQFNRGRYKSESNAVNTRKTAEDAEPAYVPGSYKGSAFRGTSRKIQQGRGYKEGPSGSRLLPNNKPKPTPLPEQKPKFKTYAPVAASPSPKKPAFNDYGAGKKPAPTARSPSPVKKAVFKTYAPSTAVERPPKPTFKDYGLRGKPEEPKKPLKPKKPEKPEKPVFNTYGGALKPHPRDSDSDEQIYLSSQLRDLLDADEVTPPPTHNPDETKCPMCGTYVPLSLLLDFASSFPSVDPFAMRIQVQSRFCSHHRRHTAASSANYPPIAWPELPSRIRAHLPSIRAFLDDPDSAPSHYRDLLANDIAAGRNRTLMQSIMSDAGARVRAPGYYGPRGARVMQEEILDVLSNELREAAVRDVVVSARGVGVYVASVLVLEVGLRLVMDDLGVDKEDARGIMEKSGAWGTLVNEELEEEVPEVVEESDGFDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.54
4 0.51
5 0.43
6 0.36
7 0.33
8 0.26
9 0.23
10 0.24
11 0.24
12 0.27
13 0.3
14 0.29
15 0.28
16 0.36
17 0.42
18 0.45
19 0.53
20 0.53
21 0.59
22 0.69
23 0.72
24 0.69
25 0.67
26 0.67
27 0.64
28 0.61
29 0.57
30 0.54
31 0.49
32 0.48
33 0.48
34 0.49
35 0.51
36 0.54
37 0.56
38 0.54
39 0.58
40 0.58
41 0.57
42 0.6
43 0.64
44 0.69
45 0.67
46 0.62
47 0.58
48 0.54
49 0.48
50 0.42
51 0.33
52 0.24
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.21
58 0.17
59 0.16
60 0.16
61 0.19
62 0.22
63 0.3
64 0.33
65 0.36
66 0.45
67 0.45
68 0.52
69 0.55
70 0.58
71 0.55
72 0.58
73 0.57
74 0.54
75 0.6
76 0.57
77 0.55
78 0.48
79 0.46
80 0.39
81 0.36
82 0.33
83 0.26
84 0.28
85 0.25
86 0.27
87 0.24
88 0.23
89 0.22
90 0.19
91 0.17
92 0.12
93 0.13
94 0.11
95 0.12
96 0.14
97 0.16
98 0.19
99 0.2
100 0.25
101 0.3
102 0.33
103 0.4
104 0.44
105 0.51
106 0.52
107 0.57
108 0.58
109 0.61
110 0.64
111 0.63
112 0.58
113 0.51
114 0.51
115 0.48
116 0.41
117 0.34
118 0.3
119 0.25
120 0.3
121 0.32
122 0.34
123 0.39
124 0.48
125 0.54
126 0.56
127 0.56
128 0.54
129 0.59
130 0.58
131 0.6
132 0.6
133 0.62
134 0.67
135 0.75
136 0.81
137 0.77
138 0.74
139 0.68
140 0.59
141 0.56
142 0.52
143 0.51
144 0.44
145 0.43
146 0.43
147 0.44
148 0.47
149 0.43
150 0.4
151 0.38
152 0.36
153 0.34
154 0.33
155 0.36
156 0.36
157 0.35
158 0.35
159 0.32
160 0.37
161 0.37
162 0.37
163 0.3
164 0.27
165 0.3
166 0.31
167 0.31
168 0.27
169 0.33
170 0.36
171 0.43
172 0.46
173 0.46
174 0.49
175 0.52
176 0.5
177 0.51
178 0.5
179 0.49
180 0.49
181 0.44
182 0.42
183 0.39
184 0.41
185 0.34
186 0.31
187 0.27
188 0.3
189 0.35
190 0.36
191 0.33
192 0.36
193 0.4
194 0.43
195 0.44
196 0.4
197 0.38
198 0.38
199 0.43
200 0.42
201 0.47
202 0.47
203 0.45
204 0.43
205 0.45
206 0.48
207 0.49
208 0.52
209 0.47
210 0.53
211 0.59
212 0.69
213 0.73
214 0.74
215 0.78
216 0.81
217 0.85
218 0.87
219 0.89
220 0.87
221 0.89
222 0.87
223 0.85
224 0.81
225 0.76
226 0.67
227 0.58
228 0.5
229 0.39
230 0.35
231 0.26
232 0.2
233 0.16
234 0.2
235 0.2
236 0.23
237 0.23
238 0.2
239 0.23
240 0.28
241 0.35
242 0.32
243 0.3
244 0.27
245 0.26
246 0.25
247 0.23
248 0.18
249 0.11
250 0.08
251 0.07
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.19
270 0.2
271 0.27
272 0.31
273 0.31
274 0.29
275 0.28
276 0.26
277 0.22
278 0.21
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.15
286 0.14
287 0.1
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.14
305 0.2
306 0.21
307 0.22
308 0.24
309 0.26
310 0.29
311 0.39
312 0.4
313 0.44
314 0.49
315 0.52
316 0.52
317 0.52
318 0.56
319 0.5
320 0.49
321 0.43
322 0.38
323 0.35
324 0.31
325 0.27
326 0.21
327 0.18
328 0.18
329 0.13
330 0.14
331 0.17
332 0.25
333 0.26
334 0.28
335 0.28
336 0.28
337 0.31
338 0.3
339 0.32
340 0.29
341 0.32
342 0.32
343 0.32
344 0.3
345 0.28
346 0.27
347 0.22
348 0.21
349 0.18
350 0.16
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.18
355 0.18
356 0.16
357 0.17
358 0.17
359 0.16
360 0.17
361 0.2
362 0.19
363 0.17
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.16
368 0.15
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.12
389 0.17
390 0.22
391 0.25
392 0.29
393 0.29
394 0.32
395 0.34
396 0.33
397 0.32
398 0.29
399 0.28
400 0.26
401 0.25
402 0.22
403 0.21
404 0.2
405 0.16
406 0.12
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.1
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.12
421 0.13
422 0.11
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.14
457 0.14
458 0.16
459 0.17
460 0.16
461 0.18
462 0.19
463 0.17
464 0.14
465 0.15
466 0.14
467 0.17
468 0.18
469 0.16
470 0.14
471 0.14
472 0.16
473 0.14
474 0.13
475 0.1
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.07