Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0W7S8

Protein Details
Accession G0W7S8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-148LPKPKVVGPPKPKSKKKKGTGAPAGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-22GRGGFRGGRGGGR
123-211PKPKVVGPPKPKSKKKKGTGAPAGRGGSRGGFSRGGRGGSRGGFSARGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGSRGGSRGGFGGRR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ndi:NDAI_0C01780  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSFRGGNRGGRGGFRGGRGGGRMGGRPIQQGPPDSVLEMGSFLHECENDIVCRSINTKIPYFNAPIYLENKTQIGKVDEILGPLNEVYFTIKCSEGVQAKSFKEGDKFYIGPDKLLPIERFLPKPKVVGPPKPKSKKKKGTGAPAGRGGSRGGFSRGGRGGSRGGFSARGGSRGGFGGRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGSRGGSRGGFGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.28
4 0.29
5 0.28
6 0.27
7 0.24
8 0.24
9 0.24
10 0.24
11 0.27
12 0.26
13 0.28
14 0.29
15 0.31
16 0.32
17 0.32
18 0.32
19 0.31
20 0.3
21 0.27
22 0.24
23 0.19
24 0.16
25 0.14
26 0.11
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.09
31 0.08
32 0.09
33 0.11
34 0.13
35 0.12
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.2
43 0.23
44 0.24
45 0.25
46 0.28
47 0.29
48 0.31
49 0.28
50 0.26
51 0.24
52 0.24
53 0.25
54 0.25
55 0.23
56 0.21
57 0.21
58 0.18
59 0.18
60 0.17
61 0.16
62 0.14
63 0.13
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.12
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.13
82 0.15
83 0.17
84 0.19
85 0.22
86 0.22
87 0.24
88 0.24
89 0.21
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.18
94 0.18
95 0.16
96 0.23
97 0.22
98 0.19
99 0.19
100 0.17
101 0.15
102 0.19
103 0.18
104 0.13
105 0.18
106 0.2
107 0.23
108 0.25
109 0.29
110 0.26
111 0.28
112 0.29
113 0.34
114 0.37
115 0.44
116 0.5
117 0.55
118 0.65
119 0.73
120 0.79
121 0.8
122 0.85
123 0.86
124 0.85
125 0.86
126 0.83
127 0.84
128 0.86
129 0.83
130 0.76
131 0.71
132 0.63
133 0.53
134 0.46
135 0.36
136 0.26
137 0.19
138 0.16
139 0.14
140 0.17
141 0.17
142 0.21
143 0.22
144 0.24
145 0.23
146 0.23
147 0.24
148 0.21
149 0.22
150 0.18
151 0.17
152 0.16
153 0.16
154 0.21
155 0.18
156 0.19
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.19
162 0.12
163 0.12
164 0.16
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.1
173 0.1
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.1
183 0.1
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.18
189 0.16
190 0.17
191 0.19