Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YKM4

Protein Details
Accession C7YKM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-72SPEQPRSRSRAQSHSQRRKKKKSRKRRNPGLARKLEFIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-67RSRAQSHSQRRKKKKSRKRRNPGLAR
Subcellular Location(s) plas 12, nucl 7, mito 3, golg 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038967  Dsc4-like  
IPR013715  DUF1746  
Gene Ontology GO:0044695  C:Dsc E3 ubiquitin ligase complex  
KEGG nhe:NECHADRAFT_98754  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08508  DUF1746  
Amino Acid Sequences MSHDASPSSTARTDAPPVEPLPASSANRVTRDLLSPEQPRSRSRAQSHSQRRKKKKSRKRRNPGLARKLEFITHLLKSLDTLVFAELSALYYMECSMFRFILRSVGQYMYLTPKDESFPFLTPASRIHVVLVVIPNLICMLLHLFASLPTGPDYHRGYMHGGLVIDFIGQKPPTSRIYYLLADFAILAIQCLMLTAHTERERLRLTLKTFRPLIPDVAQEMGPTLEDLDAEERGVSRDMPGSLPPNETEDIELQPLRPINEAEEGSSQSGEPDPPARESPADEPTRTYLSDVLSSGNAVIGEYHVLHSMRNAAMDLERTAAHSLRTISYGATMAAIEARRRGVTVPARQGQTDRRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.3
4 0.29
5 0.32
6 0.29
7 0.26
8 0.26
9 0.29
10 0.29
11 0.29
12 0.35
13 0.36
14 0.39
15 0.4
16 0.38
17 0.34
18 0.36
19 0.37
20 0.34
21 0.37
22 0.4
23 0.45
24 0.49
25 0.49
26 0.48
27 0.51
28 0.55
29 0.56
30 0.58
31 0.6
32 0.62
33 0.7
34 0.78
35 0.82
36 0.84
37 0.86
38 0.9
39 0.92
40 0.94
41 0.95
42 0.94
43 0.95
44 0.96
45 0.96
46 0.97
47 0.97
48 0.97
49 0.97
50 0.97
51 0.96
52 0.94
53 0.86
54 0.78
55 0.68
56 0.58
57 0.48
58 0.4
59 0.33
60 0.24
61 0.23
62 0.2
63 0.18
64 0.18
65 0.2
66 0.17
67 0.13
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.06
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.17
89 0.17
90 0.18
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.2
104 0.18
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.17
113 0.16
114 0.14
115 0.15
116 0.14
117 0.16
118 0.15
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.04
126 0.03
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.12
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.14
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.11
160 0.14
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.22
165 0.22
166 0.21
167 0.19
168 0.16
169 0.13
170 0.12
171 0.09
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.05
183 0.09
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.17
188 0.19
189 0.19
190 0.21
191 0.21
192 0.25
193 0.32
194 0.34
195 0.35
196 0.36
197 0.36
198 0.37
199 0.34
200 0.33
201 0.26
202 0.25
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.14
207 0.13
208 0.1
209 0.08
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.15
229 0.16
230 0.18
231 0.17
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.18
236 0.16
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.13
241 0.15
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.18
254 0.15
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.13
260 0.14
261 0.17
262 0.19
263 0.2
264 0.2
265 0.23
266 0.26
267 0.3
268 0.32
269 0.29
270 0.3
271 0.31
272 0.33
273 0.3
274 0.27
275 0.21
276 0.19
277 0.2
278 0.18
279 0.17
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.11
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.16
296 0.15
297 0.15
298 0.15
299 0.13
300 0.14
301 0.17
302 0.16
303 0.14
304 0.13
305 0.14
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.16
310 0.18
311 0.17
312 0.19
313 0.18
314 0.15
315 0.16
316 0.16
317 0.13
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.12
322 0.14
323 0.14
324 0.16
325 0.18
326 0.18
327 0.19
328 0.2
329 0.25
330 0.32
331 0.4
332 0.47
333 0.52
334 0.54
335 0.54
336 0.59