Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YZW4

Protein Details
Accession C7YZW4    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-32IDHAAAKAEKKSKKEKKRAREEDAPVDTEBasic
51-77VVNGDLKAEKKKKKSKKDKHAEEAVVPBasic
82-108SAAVEEPKSEKKHKKKKHHDDEVAAPVBasic
113-141TSVVADGEKKKKHKKKHKKGQPEPEPEAEBasic
405-433AETAKMRKGKKGGQRRQRRRAPEFSMTRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-39KAEKKSKKEKKRAREEDAPVDTERKHKKSK
57-70KAEKKKKKSKKDKH
89-99KSEKKHKKKKH
121-132KKKKHKKKHKKG
409-425KMRKGKKGGQRRQRRRA
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.833, cyto 9.5, mito_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG nhe:NECHADRAFT_71413  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAPIDHAAAKAEKKSKKEKKRAREEDAPVDTERKHKKSKSVAPADLPAPEVVNGDLKAEKKKKKSKKDKHAEEAVVPAESESAAVEEPKSEKKHKKKKHHDDEVAAPVEEADTSVVADGEKKKKHKKKHKKGQPEPEPEAEPEAEPEKDASPDPDAMDVDFAIPARPKSKPNIHQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLYPIGWAQPVTNCQYQHLRHLQNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGEKPGRNGAAMDDETPTTVMSKDEAAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGSGEKIKGKIRFRIRNFDVGTSGETSYLSLEGTMLDKQGEKAVVAEEAETAKMRKGKKGGQRRQRRRAPEFSMTRFAVDEEEQTQDNEEEKREVLAVSED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.65
3 0.72
4 0.8
5 0.83
6 0.86
7 0.91
8 0.94
9 0.92
10 0.91
11 0.88
12 0.87
13 0.81
14 0.74
15 0.64
16 0.58
17 0.5
18 0.49
19 0.51
20 0.48
21 0.52
22 0.54
23 0.62
24 0.69
25 0.78
26 0.79
27 0.8
28 0.78
29 0.73
30 0.73
31 0.65
32 0.55
33 0.46
34 0.36
35 0.26
36 0.21
37 0.17
38 0.13
39 0.15
40 0.14
41 0.14
42 0.17
43 0.18
44 0.28
45 0.36
46 0.44
47 0.51
48 0.61
49 0.7
50 0.78
51 0.88
52 0.89
53 0.91
54 0.94
55 0.94
56 0.93
57 0.92
58 0.85
59 0.75
60 0.68
61 0.58
62 0.47
63 0.36
64 0.26
65 0.17
66 0.13
67 0.11
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.08
74 0.11
75 0.18
76 0.24
77 0.32
78 0.42
79 0.53
80 0.64
81 0.72
82 0.81
83 0.86
84 0.92
85 0.94
86 0.95
87 0.92
88 0.87
89 0.84
90 0.8
91 0.7
92 0.59
93 0.47
94 0.36
95 0.27
96 0.21
97 0.14
98 0.06
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.04
104 0.09
105 0.15
106 0.22
107 0.29
108 0.37
109 0.48
110 0.57
111 0.68
112 0.76
113 0.81
114 0.85
115 0.9
116 0.93
117 0.94
118 0.96
119 0.96
120 0.95
121 0.93
122 0.86
123 0.79
124 0.7
125 0.59
126 0.51
127 0.4
128 0.3
129 0.22
130 0.19
131 0.15
132 0.13
133 0.14
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.13
154 0.16
155 0.23
156 0.33
157 0.4
158 0.49
159 0.6
160 0.61
161 0.65
162 0.63
163 0.62
164 0.58
165 0.51
166 0.43
167 0.35
168 0.36
169 0.3
170 0.3
171 0.25
172 0.19
173 0.22
174 0.19
175 0.17
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.11
194 0.15
195 0.18
196 0.17
197 0.18
198 0.24
199 0.25
200 0.3
201 0.36
202 0.38
203 0.4
204 0.44
205 0.46
206 0.45
207 0.46
208 0.42
209 0.38
210 0.32
211 0.28
212 0.26
213 0.22
214 0.18
215 0.17
216 0.19
217 0.16
218 0.16
219 0.15
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.07
225 0.08
226 0.16
227 0.17
228 0.18
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.19
233 0.17
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.07
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.14
295 0.16
296 0.19
297 0.23
298 0.23
299 0.25
300 0.26
301 0.23
302 0.23
303 0.32
304 0.33
305 0.35
306 0.38
307 0.41
308 0.42
309 0.44
310 0.47
311 0.39
312 0.38
313 0.33
314 0.31
315 0.26
316 0.23
317 0.19
318 0.14
319 0.13
320 0.09
321 0.08
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.18
350 0.23
351 0.3
352 0.33
353 0.39
354 0.47
355 0.56
356 0.61
357 0.69
358 0.68
359 0.7
360 0.67
361 0.6
362 0.52
363 0.43
364 0.4
365 0.31
366 0.27
367 0.18
368 0.16
369 0.14
370 0.12
371 0.11
372 0.09
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.11
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.13
389 0.13
390 0.1
391 0.11
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.15
396 0.2
397 0.22
398 0.28
399 0.35
400 0.43
401 0.52
402 0.63
403 0.69
404 0.75
405 0.84
406 0.88
407 0.91
408 0.92
409 0.92
410 0.9
411 0.89
412 0.86
413 0.86
414 0.83
415 0.79
416 0.77
417 0.67
418 0.6
419 0.5
420 0.42
421 0.35
422 0.27
423 0.24
424 0.18
425 0.2
426 0.2
427 0.2
428 0.21
429 0.19
430 0.21
431 0.2
432 0.21
433 0.2
434 0.2
435 0.21
436 0.2
437 0.19