Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YV54

Protein Details
Accession C7YV54    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-115NDGRGGRGRRRGRGRGRGGGBasic
490-518PQGGKGPSQKWSKRQPPLSQKWRKAMIKHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-124RGGRGRRRGRGRGRGGGSSGGVRGGR
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 7.5, mito 6, extr 4, cyto 2, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG nhe:NECHADRAFT_85156  -  
Amino Acid Sequences MADFTLLQGLPHINLVNITAAAATPPTTTTTTNNNTNSDTENNNMVRGGSNRDGSCHHYGPTNTGQGYGSGNPGPPQSDGDLSSLFDTPPPTAPSNDGRGGRGRRRGRGRGRGGGSSGGVRGGRGGGSFHGSTQTPPAPVAPIAQGQQSTGNMSLAPLNAGGYQFGGLTLLWPPPDSTHGYSPAVEASQGSGHGQQAQNFRGQDERLQVVEELGVKTQPAETPGQVDLSLSNASKRGGAQENIVSKVSFTPGAVVSYSNARDAKRAIDEIAGHDDDNTAVNLTIWLQPKKRRIEKDTKLTVSQWVALSCNDMGIEVPEGDVPEVDAETVDAADAEGIAKCPNCKVEGHGIVECMMPRRDGYVHGCIHCSTAEHQTAKCDKHPRDTAKLVDLLVKQRPNMPPLKATPWYPALHEYMEVASLEAIESFPWRAQFGIEVIQDPLLRRRAVESIEKGRDFRPVDPKMTDWVTIRERDGKPKSAMDGFPKLGTQPQGGKGPSQKWSKRQPPLSQKWRKAMIKHGQADPNNLPCGDGFQFVPGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.11
5 0.11
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.08
13 0.11
14 0.13
15 0.16
16 0.19
17 0.27
18 0.33
19 0.4
20 0.43
21 0.43
22 0.43
23 0.43
24 0.44
25 0.39
26 0.35
27 0.3
28 0.34
29 0.32
30 0.3
31 0.28
32 0.25
33 0.24
34 0.23
35 0.28
36 0.24
37 0.3
38 0.29
39 0.31
40 0.33
41 0.37
42 0.41
43 0.36
44 0.32
45 0.32
46 0.33
47 0.37
48 0.4
49 0.4
50 0.33
51 0.32
52 0.32
53 0.27
54 0.29
55 0.24
56 0.21
57 0.17
58 0.18
59 0.18
60 0.19
61 0.19
62 0.17
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.19
70 0.19
71 0.17
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.16
77 0.2
78 0.2
79 0.21
80 0.25
81 0.28
82 0.33
83 0.37
84 0.34
85 0.32
86 0.39
87 0.46
88 0.49
89 0.55
90 0.55
91 0.59
92 0.67
93 0.75
94 0.77
95 0.8
96 0.8
97 0.79
98 0.77
99 0.7
100 0.63
101 0.54
102 0.45
103 0.36
104 0.28
105 0.21
106 0.17
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.19
121 0.2
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.12
163 0.15
164 0.17
165 0.19
166 0.23
167 0.24
168 0.23
169 0.23
170 0.21
171 0.17
172 0.13
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.13
181 0.14
182 0.18
183 0.22
184 0.23
185 0.26
186 0.25
187 0.25
188 0.23
189 0.23
190 0.21
191 0.2
192 0.21
193 0.17
194 0.18
195 0.17
196 0.14
197 0.15
198 0.13
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.09
215 0.09
216 0.11
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.15
225 0.16
226 0.17
227 0.2
228 0.22
229 0.23
230 0.23
231 0.19
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.13
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.16
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.06
270 0.1
271 0.13
272 0.16
273 0.2
274 0.26
275 0.34
276 0.43
277 0.49
278 0.52
279 0.56
280 0.64
281 0.69
282 0.73
283 0.74
284 0.67
285 0.61
286 0.55
287 0.5
288 0.4
289 0.34
290 0.25
291 0.17
292 0.15
293 0.14
294 0.15
295 0.11
296 0.1
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.14
332 0.21
333 0.26
334 0.28
335 0.28
336 0.27
337 0.26
338 0.26
339 0.23
340 0.18
341 0.14
342 0.11
343 0.1
344 0.12
345 0.12
346 0.15
347 0.19
348 0.24
349 0.27
350 0.27
351 0.29
352 0.27
353 0.27
354 0.23
355 0.2
356 0.15
357 0.18
358 0.23
359 0.24
360 0.24
361 0.3
362 0.36
363 0.37
364 0.41
365 0.44
366 0.41
367 0.48
368 0.57
369 0.56
370 0.58
371 0.61
372 0.57
373 0.52
374 0.51
375 0.42
376 0.39
377 0.35
378 0.32
379 0.33
380 0.32
381 0.28
382 0.33
383 0.35
384 0.35
385 0.38
386 0.36
387 0.36
388 0.38
389 0.44
390 0.4
391 0.39
392 0.38
393 0.38
394 0.36
395 0.33
396 0.31
397 0.27
398 0.25
399 0.24
400 0.2
401 0.15
402 0.15
403 0.13
404 0.1
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.06
412 0.06
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.16
421 0.15
422 0.16
423 0.16
424 0.17
425 0.18
426 0.18
427 0.22
428 0.22
429 0.21
430 0.2
431 0.23
432 0.25
433 0.28
434 0.34
435 0.36
436 0.41
437 0.49
438 0.5
439 0.49
440 0.46
441 0.5
442 0.44
443 0.43
444 0.44
445 0.42
446 0.45
447 0.46
448 0.46
449 0.44
450 0.44
451 0.4
452 0.32
453 0.34
454 0.34
455 0.34
456 0.36
457 0.4
458 0.4
459 0.48
460 0.51
461 0.51
462 0.51
463 0.51
464 0.53
465 0.5
466 0.51
467 0.48
468 0.49
469 0.44
470 0.41
471 0.38
472 0.34
473 0.33
474 0.31
475 0.29
476 0.27
477 0.3
478 0.35
479 0.36
480 0.4
481 0.43
482 0.45
483 0.49
484 0.54
485 0.56
486 0.59
487 0.69
488 0.74
489 0.77
490 0.81
491 0.84
492 0.85
493 0.89
494 0.91
495 0.91
496 0.89
497 0.88
498 0.88
499 0.84
500 0.78
501 0.78
502 0.77
503 0.77
504 0.74
505 0.73
506 0.72
507 0.68
508 0.7
509 0.66
510 0.61
511 0.54
512 0.47
513 0.4
514 0.31
515 0.34
516 0.28
517 0.24
518 0.18