Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C4R4M7

Protein Details
Accession C4R4M7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-370SKLSPEEQRKIEKKRQEKKQRKQMKQQRVRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-304KK
330-370VEEQRKERERISKLSPEEQRKIEKKRQEKKQRKQMKQQRVR
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 8, mito 6, nucl 4.5, pero 3, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG ppa:PAS_chr3_0464  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MLAILSLLAVASAQQVSQPYYEHTYEELKEMGLLQRLITYNWKLELVTVSFTLAYLLTHFLGASYNARLVGKWVSSAEEVLDKQFASLGCSVKEKVVKDDNEHYTYFATGRKNIESLTVRFTLKPRHNLLLLVTETILSFFISSIEKSIDSVNIIVKYNDEAESNIDDFIWAIVNKDGMNQARIENYFLSLTKTSESSKLPTEYVFMSETADITEEVYNDAENSGLTSSPTLLKYVAFTDQSIVKPTTLEEAASSKKAILFTNFPSTASELKANQDLLTSFLSLVDNVVENVKFRPETLKRVKKTREAEIQKIKKALDEVQKEELESKRVEEQRKERERISKLSPEEQRKIEKKRQEKKQRKQMKQQRVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.12
4 0.13
5 0.14
6 0.16
7 0.22
8 0.23
9 0.23
10 0.24
11 0.27
12 0.27
13 0.28
14 0.25
15 0.19
16 0.19
17 0.19
18 0.2
19 0.19
20 0.18
21 0.16
22 0.2
23 0.2
24 0.22
25 0.26
26 0.26
27 0.24
28 0.25
29 0.26
30 0.21
31 0.22
32 0.25
33 0.2
34 0.19
35 0.17
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.1
41 0.08
42 0.07
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.16
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.12
70 0.11
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.15
75 0.16
76 0.16
77 0.19
78 0.19
79 0.21
80 0.25
81 0.23
82 0.26
83 0.33
84 0.34
85 0.37
86 0.44
87 0.46
88 0.45
89 0.44
90 0.39
91 0.31
92 0.3
93 0.26
94 0.22
95 0.19
96 0.19
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.22
101 0.27
102 0.27
103 0.26
104 0.27
105 0.27
106 0.26
107 0.27
108 0.3
109 0.33
110 0.35
111 0.41
112 0.4
113 0.41
114 0.41
115 0.4
116 0.38
117 0.35
118 0.29
119 0.22
120 0.18
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.09
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.1
165 0.09
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.12
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.14
183 0.15
184 0.14
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.17
189 0.17
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.15
228 0.16
229 0.18
230 0.18
231 0.15
232 0.14
233 0.15
234 0.17
235 0.13
236 0.13
237 0.1
238 0.13
239 0.15
240 0.16
241 0.16
242 0.13
243 0.14
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.18
248 0.2
249 0.28
250 0.28
251 0.27
252 0.26
253 0.27
254 0.26
255 0.24
256 0.24
257 0.17
258 0.19
259 0.21
260 0.2
261 0.18
262 0.17
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.13
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.09
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.22
283 0.25
284 0.35
285 0.45
286 0.54
287 0.57
288 0.67
289 0.74
290 0.74
291 0.75
292 0.74
293 0.74
294 0.72
295 0.76
296 0.77
297 0.77
298 0.73
299 0.71
300 0.62
301 0.53
302 0.49
303 0.46
304 0.45
305 0.44
306 0.43
307 0.46
308 0.47
309 0.45
310 0.46
311 0.41
312 0.35
313 0.29
314 0.28
315 0.3
316 0.36
317 0.43
318 0.48
319 0.55
320 0.62
321 0.71
322 0.73
323 0.7
324 0.73
325 0.72
326 0.69
327 0.68
328 0.66
329 0.61
330 0.65
331 0.68
332 0.68
333 0.69
334 0.68
335 0.71
336 0.71
337 0.75
338 0.75
339 0.76
340 0.78
341 0.81
342 0.86
343 0.87
344 0.9
345 0.92
346 0.93
347 0.94
348 0.94
349 0.95
350 0.95