Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8F1H1

Protein Details
Accession A0A1B8F1H1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-100SSSAVPKSIRAPKKKKPQIHTPAPRQVQDHydrophilic
477-499KDGEAQTRKKTWRRVQDDYDDNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-88IRAPKKKKP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13.333, cyto 11, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLQQLSKLLPLPEEDLQQVLAYASTLPPQEAVEHFNNLLGESPASIEFISTFNSRRQPAPSSSNNQASSSSSSAVPKSIRAPKKKKPQIHTPAPRQVQDTSYAGQGKAYQKKGNDAYVPPRAGPSQQHNNLSLRDPPKKTQTPPPRPPPSAAGRLISDPRKPSSAPTTRTSSPARPSARPTKVSITGGTPMSSASANLSELDALIYSLENASTSAVSNASRACNCIATKHALLAAAPNCLNCGKVICVKEGFGPCTFCGQPILRAEDRDNIVRELRADRAQEKQAIDRAAHRRVETTKNPYVSRATAVPAGPTPAELSRGDGEGLSAAEKAQAHRDRLLGFQAQNASRTRVYDEAADFATPDVGVSQWAGPMERARMLKQQQKVLREQEWNAKPEYEKKREMVSLDVVGGKLVKTFKRVDVKYQDTVQDKENIDEGEGVNAGGYEQADARTSGGAYSRNPLIGGLIRPVFTPPEGKDGEAQTRKKTWRRVQDDYDDNEEVILDGGVYGSGSMLEGDMREGADEKAGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.21
4 0.21
5 0.19
6 0.17
7 0.13
8 0.1
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.15
18 0.16
19 0.21
20 0.21
21 0.24
22 0.24
23 0.25
24 0.24
25 0.21
26 0.21
27 0.16
28 0.13
29 0.1
30 0.12
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.2
41 0.27
42 0.29
43 0.32
44 0.36
45 0.38
46 0.43
47 0.49
48 0.52
49 0.52
50 0.57
51 0.62
52 0.59
53 0.54
54 0.48
55 0.43
56 0.4
57 0.35
58 0.29
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.26
63 0.24
64 0.22
65 0.28
66 0.37
67 0.44
68 0.52
69 0.61
70 0.67
71 0.77
72 0.84
73 0.86
74 0.83
75 0.86
76 0.85
77 0.87
78 0.88
79 0.86
80 0.87
81 0.82
82 0.77
83 0.68
84 0.6
85 0.51
86 0.44
87 0.37
88 0.28
89 0.28
90 0.27
91 0.24
92 0.23
93 0.27
94 0.3
95 0.36
96 0.39
97 0.39
98 0.38
99 0.46
100 0.49
101 0.49
102 0.45
103 0.42
104 0.44
105 0.48
106 0.47
107 0.4
108 0.38
109 0.34
110 0.32
111 0.33
112 0.34
113 0.37
114 0.42
115 0.45
116 0.46
117 0.48
118 0.47
119 0.44
120 0.43
121 0.4
122 0.42
123 0.43
124 0.44
125 0.51
126 0.56
127 0.58
128 0.61
129 0.65
130 0.68
131 0.74
132 0.8
133 0.79
134 0.75
135 0.73
136 0.69
137 0.64
138 0.61
139 0.53
140 0.44
141 0.37
142 0.37
143 0.4
144 0.38
145 0.35
146 0.3
147 0.3
148 0.31
149 0.3
150 0.31
151 0.35
152 0.4
153 0.4
154 0.41
155 0.45
156 0.44
157 0.48
158 0.49
159 0.44
160 0.41
161 0.44
162 0.45
163 0.41
164 0.47
165 0.53
166 0.55
167 0.52
168 0.51
169 0.48
170 0.48
171 0.47
172 0.41
173 0.33
174 0.3
175 0.28
176 0.24
177 0.18
178 0.13
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.17
219 0.13
220 0.13
221 0.16
222 0.14
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.13
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.16
237 0.2
238 0.2
239 0.21
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.19
244 0.18
245 0.14
246 0.16
247 0.14
248 0.17
249 0.18
250 0.23
251 0.2
252 0.21
253 0.22
254 0.23
255 0.24
256 0.23
257 0.22
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.17
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.17
266 0.17
267 0.21
268 0.23
269 0.25
270 0.25
271 0.24
272 0.25
273 0.24
274 0.23
275 0.26
276 0.29
277 0.31
278 0.32
279 0.3
280 0.29
281 0.32
282 0.39
283 0.38
284 0.4
285 0.4
286 0.42
287 0.42
288 0.41
289 0.39
290 0.33
291 0.29
292 0.22
293 0.18
294 0.17
295 0.17
296 0.16
297 0.13
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.08
303 0.11
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.08
312 0.08
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.16
320 0.2
321 0.22
322 0.24
323 0.26
324 0.25
325 0.26
326 0.29
327 0.24
328 0.2
329 0.2
330 0.23
331 0.22
332 0.24
333 0.25
334 0.25
335 0.22
336 0.22
337 0.22
338 0.19
339 0.19
340 0.2
341 0.19
342 0.17
343 0.17
344 0.16
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.07
349 0.06
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.1
360 0.11
361 0.15
362 0.16
363 0.18
364 0.26
365 0.32
366 0.38
367 0.41
368 0.48
369 0.49
370 0.52
371 0.56
372 0.55
373 0.54
374 0.52
375 0.51
376 0.52
377 0.53
378 0.5
379 0.45
380 0.41
381 0.37
382 0.41
383 0.48
384 0.45
385 0.44
386 0.44
387 0.48
388 0.48
389 0.48
390 0.42
391 0.36
392 0.3
393 0.26
394 0.25
395 0.2
396 0.17
397 0.16
398 0.12
399 0.11
400 0.14
401 0.14
402 0.17
403 0.2
404 0.28
405 0.38
406 0.39
407 0.45
408 0.51
409 0.56
410 0.56
411 0.57
412 0.56
413 0.5
414 0.5
415 0.44
416 0.42
417 0.37
418 0.33
419 0.32
420 0.26
421 0.23
422 0.23
423 0.2
424 0.14
425 0.13
426 0.12
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.12
442 0.14
443 0.14
444 0.18
445 0.19
446 0.19
447 0.19
448 0.18
449 0.18
450 0.19
451 0.19
452 0.2
453 0.2
454 0.2
455 0.2
456 0.22
457 0.21
458 0.18
459 0.22
460 0.19
461 0.25
462 0.26
463 0.27
464 0.3
465 0.33
466 0.42
467 0.45
468 0.47
469 0.46
470 0.53
471 0.61
472 0.65
473 0.71
474 0.7
475 0.73
476 0.78
477 0.81
478 0.81
479 0.82
480 0.82
481 0.77
482 0.74
483 0.64
484 0.54
485 0.45
486 0.36
487 0.26
488 0.19
489 0.13
490 0.06
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.03
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.07
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.1
508 0.1