Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YQF0

Protein Details
Accession C7YQF0    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-42IIAETRSNRPRNQRGQGRRREPRQDYPRDGVHydrophilic
64-86ENNSRRGPAPRRRRESPDQESKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-31GQGRRR
69-77RGPAPRRRR
223-277GGDRGDRRSPMPRRRGQGGRRPGARRDGGGRDSGREGGRDQEGGRGGRGNPRAKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG nhe:NECHADRAFT_104111  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MADKMDRGLDEIIAETRSNRPRNQRGQGRRREPRQDYPRDGVRKSFRDESRNLDSEWVHDRYEENNSRRGPAPRRRRESPDQESKGSKLRVDNIHYDLTEDDLDELFRRIGPVVRLQLRYDRAGRSEGTAYVTYELKEDAQEAVRQFDGANANGQPIRLTLLPSGPARNPFDTAVMPSRPLAERISAPGDRARSHSPHRRYDEDEAARKGIDRYVPGQGGDRGGDRGDRRSPMPRRRGQGGRRPGARRDGGGRDSGREGGRDQEGGRGGRGNPRAKKTQEELDAEMADYFGGGNAQPTEPSNGTEAAPAQAQAQAQAPAAAVDDIDMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.21
4 0.3
5 0.35
6 0.4
7 0.49
8 0.58
9 0.68
10 0.77
11 0.79
12 0.82
13 0.87
14 0.91
15 0.91
16 0.91
17 0.91
18 0.91
19 0.88
20 0.87
21 0.87
22 0.86
23 0.83
24 0.8
25 0.8
26 0.76
27 0.7
28 0.68
29 0.67
30 0.62
31 0.61
32 0.63
33 0.6
34 0.6
35 0.61
36 0.6
37 0.59
38 0.56
39 0.5
40 0.45
41 0.39
42 0.35
43 0.38
44 0.33
45 0.24
46 0.22
47 0.23
48 0.22
49 0.32
50 0.37
51 0.34
52 0.39
53 0.39
54 0.42
55 0.46
56 0.51
57 0.51
58 0.53
59 0.61
60 0.65
61 0.72
62 0.75
63 0.79
64 0.81
65 0.81
66 0.81
67 0.81
68 0.75
69 0.71
70 0.68
71 0.62
72 0.59
73 0.5
74 0.43
75 0.36
76 0.38
77 0.39
78 0.41
79 0.43
80 0.39
81 0.4
82 0.37
83 0.34
84 0.27
85 0.22
86 0.18
87 0.13
88 0.1
89 0.08
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.1
98 0.12
99 0.16
100 0.22
101 0.27
102 0.28
103 0.29
104 0.34
105 0.34
106 0.36
107 0.34
108 0.3
109 0.26
110 0.27
111 0.26
112 0.22
113 0.21
114 0.18
115 0.18
116 0.17
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.12
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.09
143 0.07
144 0.09
145 0.07
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.13
153 0.17
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.17
158 0.18
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.15
166 0.13
167 0.15
168 0.13
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.18
173 0.16
174 0.17
175 0.18
176 0.19
177 0.18
178 0.22
179 0.23
180 0.23
181 0.3
182 0.39
183 0.43
184 0.5
185 0.55
186 0.55
187 0.56
188 0.58
189 0.59
190 0.56
191 0.55
192 0.48
193 0.43
194 0.39
195 0.34
196 0.29
197 0.22
198 0.18
199 0.14
200 0.15
201 0.19
202 0.2
203 0.19
204 0.21
205 0.2
206 0.19
207 0.18
208 0.16
209 0.12
210 0.12
211 0.15
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.22
216 0.24
217 0.33
218 0.43
219 0.49
220 0.58
221 0.6
222 0.61
223 0.67
224 0.74
225 0.73
226 0.73
227 0.74
228 0.72
229 0.74
230 0.73
231 0.69
232 0.67
233 0.6
234 0.53
235 0.49
236 0.47
237 0.41
238 0.43
239 0.4
240 0.34
241 0.34
242 0.35
243 0.3
244 0.25
245 0.24
246 0.21
247 0.22
248 0.21
249 0.2
250 0.21
251 0.24
252 0.23
253 0.24
254 0.23
255 0.22
256 0.28
257 0.36
258 0.4
259 0.43
260 0.48
261 0.56
262 0.56
263 0.62
264 0.59
265 0.6
266 0.58
267 0.56
268 0.53
269 0.48
270 0.46
271 0.39
272 0.33
273 0.24
274 0.17
275 0.12
276 0.08
277 0.04
278 0.05
279 0.04
280 0.06
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.17
286 0.17
287 0.19
288 0.19
289 0.19
290 0.19
291 0.2
292 0.2
293 0.16
294 0.15
295 0.14
296 0.13
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.12
306 0.13
307 0.11
308 0.08
309 0.07