FuNGI

A0A1B8EKK1

Protein Details

Accession

A0A1B8EKK1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
383-406	DSSSADKKTKSKDKKAAAKAKEAS	Hydrophilic
456-483	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
143-166	AAPAKKEVVPKKAEAKKTKEKSKP
389-406	KKTKSKDKKAAAKAKEAS
462-475	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MNPNLVPVAKRKPKAPVGEKPDWLFGNGASKPAATPQVSLSQPKAGKKTTVKGSKATTTEKSTKTPPSPELLDLVGDFLTEFGFDNTGNLFASERKDRTKSEGWQGRPAAAVKTTSVTLGNIYEKFREITNGNTGDKPKDTPAAPAKKEVVPKKAEAKKTKEKSKPVAAKESSSDSDVEMGDAKAITTKASKKSSSSSSSGSSSSESSDSDADDEKEVPAAKAAAPKAKVNALKRKASSDSSSSSSSDSDSSSDSSSEDEAPKRKKSKTTPAAAESTSSSDSDSDSSDSDSSSSESDSTSKKSAKSSSDSSSSDSDSSSSDSDSSSDSDSSTQSAAAKVPLPDSGSDSSSSDSDSDSSSDEEMGDATAKSDSTATLASSDSDDSSSADKKTKSKDKKAAAKAKEASPPLPPLPHMPVPKKTNVPFSRIPKDIVVDERLRSNAFVPYDYAQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDVEGKKGIRFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.71
3	0.7
4	0.71
5	0.76
6	0.77
7	0.7
8	0.68
9	0.58
10	0.5
11	0.4
12	0.32
13	0.32
14	0.27
15	0.26
16	0.21
17	0.2
18	0.19
19	0.22
20	0.28
21	0.2
22	0.21
23	0.22
24	0.29
25	0.32
26	0.35
27	0.33
28	0.35
29	0.38
30	0.43
31	0.46
32	0.41
33	0.48
34	0.51
35	0.57
36	0.6
37	0.65
38	0.62
39	0.62
40	0.64
41	0.63
42	0.61
43	0.59
44	0.54
45	0.52
46	0.57
47	0.55
48	0.54
49	0.53
50	0.56
51	0.56
52	0.57
53	0.52
54	0.5
55	0.5
56	0.46
57	0.43
58	0.34
59	0.29
60	0.23
61	0.21
62	0.14
63	0.1
64	0.09
65	0.06
66	0.06
67	0.05
68	0.06
69	0.05
70	0.06
71	0.06
72	0.07
73	0.08
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.1
79	0.15
80	0.21
81	0.24
82	0.29
83	0.33
84	0.34
85	0.41
86	0.47
87	0.48
88	0.53
89	0.58
90	0.56
91	0.6
92	0.59
93	0.52
94	0.47
95	0.42
96	0.34
97	0.27
98	0.24
99	0.17
100	0.17
101	0.16
102	0.14
103	0.14
104	0.12
105	0.11
106	0.12
107	0.15
108	0.16
109	0.17
110	0.17
111	0.18
112	0.18
113	0.17
114	0.19
115	0.16
116	0.18
117	0.24
118	0.27
119	0.28
120	0.3
121	0.32
122	0.31
123	0.32
124	0.3
125	0.25
126	0.25
127	0.24
128	0.28
129	0.36
130	0.42
131	0.42
132	0.44
133	0.45
134	0.45
135	0.52
136	0.5
137	0.48
138	0.42
139	0.44
140	0.5
141	0.54
142	0.59
143	0.59
144	0.63
145	0.66
146	0.72
147	0.78
148	0.76
149	0.77
150	0.76
151	0.78
152	0.78
153	0.72
154	0.73
155	0.64
156	0.58
157	0.52
158	0.49
159	0.4
160	0.32
161	0.28
162	0.18
163	0.18
164	0.15
165	0.13
166	0.1
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.1
175	0.15
176	0.22
177	0.26
178	0.28
179	0.28
180	0.33
181	0.38
182	0.39
183	0.37
184	0.32
185	0.3
186	0.31
187	0.29
188	0.26
189	0.21
190	0.17
191	0.15
192	0.13
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.12
210	0.13
211	0.15
212	0.17
213	0.17
214	0.18
215	0.23
216	0.27
217	0.29
218	0.38
219	0.39
220	0.43
221	0.43
222	0.45
223	0.44
224	0.42
225	0.38
226	0.31
227	0.29
228	0.27
229	0.27
230	0.24
231	0.22
232	0.19
233	0.17
234	0.14
235	0.12
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.1
245	0.11
246	0.13
247	0.19
248	0.24
249	0.3
250	0.35
251	0.37
252	0.43
253	0.49
254	0.57
255	0.59
256	0.63
257	0.62
258	0.6
259	0.6
260	0.52
261	0.45
262	0.34
263	0.28
264	0.21
265	0.15
266	0.12
267	0.09
268	0.1
269	0.09
270	0.1
271	0.08
272	0.08
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.09
284	0.11
285	0.13
286	0.17
287	0.19
288	0.21
289	0.24
290	0.29
291	0.31
292	0.34
293	0.36
294	0.36
295	0.39
296	0.38
297	0.37
298	0.34
299	0.31
300	0.26
301	0.21
302	0.18
303	0.13
304	0.14
305	0.12
306	0.1
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.11
316	0.11
317	0.11
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.13
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.16
331	0.17
332	0.15
333	0.16
334	0.16
335	0.16
336	0.15
337	0.15
338	0.11
339	0.1
340	0.1
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.1
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.12
372	0.15
373	0.15
374	0.2
375	0.23
376	0.28
377	0.37
378	0.47
379	0.54
380	0.62
381	0.7
382	0.75
383	0.82
384	0.87
385	0.88
386	0.82
387	0.81
388	0.75
389	0.71
390	0.68
391	0.61
392	0.52
393	0.46
394	0.46
395	0.39
396	0.36
397	0.32
398	0.3
399	0.34
400	0.39
401	0.43
402	0.44
403	0.5
404	0.54
405	0.59
406	0.62
407	0.59
408	0.63
409	0.58
410	0.59
411	0.59
412	0.62
413	0.64
414	0.58
415	0.57
416	0.48
417	0.48
418	0.45
419	0.41
420	0.39
421	0.34
422	0.33
423	0.34
424	0.33
425	0.31
426	0.28
427	0.25
428	0.24
429	0.22
430	0.22
431	0.21
432	0.22
433	0.27
434	0.27
435	0.26
436	0.22
437	0.23
438	0.23
439	0.21
440	0.22
441	0.18
442	0.18
443	0.25
444	0.29
445	0.27
446	0.27
447	0.3
448	0.31
449	0.36
450	0.4
451	0.43
452	0.49
453	0.59
454	0.68
455	0.75
456	0.82
457	0.84
458	0.9
459	0.91
460	0.9
461	0.91
462	0.88
463	0.86
464	0.84
465	0.79
466	0.68
467	0.58
468	0.57
469	0.46
470	0.42
471	0.34
472	0.27
473	0.23

A0A1B8EKK1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer