FuNGI

A0A1B8CC74

Protein Details

Accession

A0A1B8CC74

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
124-144	LLPKSKPKPTPLPEQKPKFKS	Hydrophilic
208-239	KPGKLEKPEKPEKPKKPKKPGKPEKQEKPVFN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
122-144	SRLLPKSKPKPTPLPEQKPKFKS
166-170	KKPAP
173-180	RSPSPVKK
197-233	KPAFKDYGLREKPGKLEKPEKPEKPKKPKKPGKPEKQ

Subcellular Location(s)

cyto 9, cyto_nucl 8.833, cyto_mito 8.333, nucl 7.5, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MSTKEDRRRVGLYPDNRVAPLLKTVGGKSTTRNPTLKTSARAATGDNDSKKRKTDSPQPVDASDSDDSNNGDIKSQFDRGRNTRKTETEPAYIPGSYKGTAFRGTARKIQQGRSYREGPSGSRLLPKSKPKPTPLPEQKPKFKSYAPIAASPSPKKPTFNDYGAGKKPAPTVRSPSPVKKPAFKTYAPSAAIESPPKPAFKDYGLREKPGKLEKPEKPEKPKKPKKPGKPEKQEKPVFNTYGGALKPHDSDSDEEIYLSSQLRDLLDADEVTPPPTHNPDETKCPMCGTYVPLSLLLDFASSFPSVDPFAMRIQVQSRFCGHHRRHTAASSANYPPIAWPELPSRIRAHLPSIRAFLDDPDSTPSQYRDLLAKDIASGRNRTLIQSIMSEAGGRVRVPGYYGPRGARVMQEEILDVLSSELREAAVRDVVVSARGVGVYVTSVLVLEVGLLLVMDDLGVGREDARDVIEKSAAWGTLVNEELDEEVPEDAEESDEFEM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.58
3	0.54
4	0.51
5	0.43
6	0.36
7	0.33
8	0.26
9	0.23
10	0.24
11	0.24
12	0.28
13	0.3
14	0.3
15	0.29
16	0.38
17	0.42
18	0.46
19	0.49
20	0.47
21	0.52
22	0.59
23	0.61
24	0.55
25	0.53
26	0.51
27	0.5
28	0.47
29	0.41
30	0.37
31	0.38
32	0.42
33	0.42
34	0.46
35	0.49
36	0.52
37	0.55
38	0.56
39	0.55
40	0.56
41	0.61
42	0.64
43	0.66
44	0.71
45	0.69
46	0.65
47	0.6
48	0.52
49	0.46
50	0.36
51	0.29
52	0.21
53	0.19
54	0.19
55	0.17
56	0.2
57	0.15
58	0.17
59	0.16
60	0.19
61	0.21
62	0.27
63	0.3
64	0.32
65	0.41
66	0.47
67	0.57
68	0.61
69	0.64
70	0.65
71	0.66
72	0.68
73	0.69
74	0.65
75	0.6
76	0.54
77	0.5
78	0.45
79	0.4
80	0.33
81	0.27
82	0.24
83	0.19
84	0.18
85	0.18
86	0.18
87	0.2
88	0.21
89	0.25
90	0.3
91	0.33
92	0.39
93	0.42
94	0.48
95	0.5
96	0.55
97	0.57
98	0.58
99	0.62
100	0.61
101	0.6
102	0.53
103	0.53
104	0.49
105	0.42
106	0.39
107	0.36
108	0.31
109	0.34
110	0.34
111	0.35
112	0.4
113	0.48
114	0.52
115	0.58
116	0.64
117	0.64
118	0.72
119	0.72
120	0.76
121	0.77
122	0.78
123	0.79
124	0.81
125	0.83
126	0.79
127	0.77
128	0.69
129	0.6
130	0.57
131	0.53
132	0.52
133	0.45
134	0.44
135	0.44
136	0.45
137	0.48
138	0.44
139	0.43
140	0.4
141	0.39
142	0.38
143	0.37
144	0.39
145	0.4
146	0.39
147	0.39
148	0.36
149	0.42
150	0.42
151	0.43
152	0.36
153	0.32
154	0.35
155	0.34
156	0.34
157	0.3
158	0.34
159	0.37
160	0.44
161	0.47
162	0.48
163	0.53
164	0.58
165	0.58
166	0.59
167	0.59
168	0.59
169	0.6
170	0.54
171	0.5
172	0.47
173	0.51
174	0.43
175	0.38
176	0.32
177	0.28
178	0.29
179	0.26
180	0.21
181	0.19
182	0.2
183	0.2
184	0.19
185	0.19
186	0.19
187	0.2
188	0.27
189	0.26
190	0.36
191	0.37
192	0.39
193	0.39
194	0.39
195	0.41
196	0.41
197	0.42
198	0.37
199	0.45
200	0.48
201	0.55
202	0.62
203	0.64
204	0.67
205	0.73
206	0.77
207	0.79
208	0.84
209	0.86
210	0.88
211	0.9
212	0.91
213	0.92
214	0.92
215	0.92
216	0.93
217	0.92
218	0.9
219	0.91
220	0.86
221	0.77
222	0.74
223	0.68
224	0.58
225	0.48
226	0.39
227	0.3
228	0.27
229	0.24
230	0.18
231	0.12
232	0.12
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.1
237	0.12
238	0.13
239	0.15
240	0.14
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.11
245	0.1
246	0.07
247	0.05
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.09
262	0.13
263	0.13
264	0.14
265	0.19
266	0.2
267	0.27
268	0.31
269	0.31
270	0.28
271	0.28
272	0.26
273	0.22
274	0.21
275	0.18
276	0.17
277	0.17
278	0.17
279	0.16
280	0.16
281	0.15
282	0.14
283	0.1
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.13
301	0.2
302	0.2
303	0.21
304	0.23
305	0.24
306	0.27
307	0.36
308	0.35
309	0.39
310	0.44
311	0.46
312	0.47
313	0.46
314	0.47
315	0.42
316	0.42
317	0.37
318	0.33
319	0.29
320	0.26
321	0.24
322	0.21
323	0.18
324	0.18
325	0.13
326	0.14
327	0.17
328	0.25
329	0.26
330	0.28
331	0.27
332	0.28
333	0.31
334	0.3
335	0.32
336	0.29
337	0.32
338	0.32
339	0.32
340	0.3
341	0.28
342	0.27
343	0.22
344	0.22
345	0.18
346	0.16
347	0.18
348	0.19
349	0.19
350	0.2
351	0.2
352	0.18
353	0.19
354	0.19
355	0.18
356	0.19
357	0.21
358	0.2
359	0.19
360	0.18
361	0.22
362	0.25
363	0.24
364	0.25
365	0.23
366	0.28
367	0.28
368	0.28
369	0.25
370	0.22
371	0.2
372	0.19
373	0.2
374	0.15
375	0.15
376	0.13
377	0.12
378	0.12
379	0.12
380	0.11
381	0.11
382	0.1
383	0.1
384	0.12
385	0.17
386	0.22
387	0.25
388	0.29
389	0.29
390	0.32
391	0.34
392	0.33
393	0.32
394	0.29
395	0.28
396	0.26
397	0.25
398	0.22
399	0.21
400	0.2
401	0.15
402	0.11
403	0.08
404	0.08
405	0.07
406	0.07
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.08
411	0.1
412	0.11
413	0.1
414	0.11
415	0.12
416	0.12
417	0.12
418	0.11
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.04
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.02
442	0.02
443	0.03
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.05
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.1
452	0.13
453	0.15
454	0.17
455	0.18
456	0.18
457	0.2
458	0.22
459	0.2
460	0.17
461	0.17
462	0.16
463	0.19
464	0.2
465	0.17
466	0.14
467	0.14
468	0.16
469	0.14
470	0.13
471	0.1
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.09
478	0.08

A0A1B8CC74

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer