Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0W7P4

Protein Details
Accession G0W7P4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-379NSKVKQEQARRLRSKRDSNPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027267  AH/BAR_dom_sf  
IPR001683  PX_dom  
IPR036871  PX_dom_sf  
IPR014461  Retromer_complex_Vps17  
IPR015404  Vps5_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030904  C:retromer complex  
GO:0032266  F:phosphatidylinositol-3-phosphate binding  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG ndi:NDAI_0C01440  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00787  PX  
PF09325  Vps5  
CDD cd07625  BAR_Vps17p  
Amino Acid Sequences MTSTVPYDEFDSPDNNPFAEPPLEHTDTEQPHESNVASTPATTAEQEVVASTQVSPPSASTLAEETSTQPHDNQHENKETNILPERSDNKLHAIIKVLNVERKGALMEKKENPIIIFDITTNVPTFRKTSYKNIKKTYQEFTELFKYLNGSLPECFIPSLPLSYTNYGIQNKEDQVQLLKCFQNWFNRITMDPFVLRNNEFAFFIECDTGSYLPLNKNNISQTTGLKRKTLKQLAPPYDEVMELAEFRPMVKSIYLLVQGIQEKLLKCSKLRKLMVQEENAVGQGFVKLGDLNTSRGSKLYKRFGKILNAIGDVDSIIATMDMGTLYDGLSWIVRDSYVVKETLTDRHLVMRELSQAQQNSKVKQEQARRLRSKRDSNPLKVDDALRSLKQATRTEQELTLKLQKITANMLIEQKEWLEWYESWLITSIKEYTIRRIEYERKKLTLLERVRQDVRKADVKGGLSRLGREMTSSNGQDVSQSIEGDSWTGENRHRTSGEIDFLSHTEFDHTLGLDIQEEANDGSSDEEEKLKLRLIDLNC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.25
3 0.24
4 0.22
5 0.24
6 0.25
7 0.22
8 0.22
9 0.29
10 0.32
11 0.31
12 0.34
13 0.38
14 0.38
15 0.42
16 0.4
17 0.32
18 0.3
19 0.32
20 0.29
21 0.23
22 0.21
23 0.2
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.09
39 0.11
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.15
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.14
53 0.18
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.24
58 0.29
59 0.36
60 0.41
61 0.43
62 0.5
63 0.5
64 0.49
65 0.49
66 0.44
67 0.42
68 0.44
69 0.37
70 0.3
71 0.36
72 0.39
73 0.39
74 0.41
75 0.36
76 0.33
77 0.39
78 0.38
79 0.32
80 0.33
81 0.31
82 0.31
83 0.36
84 0.34
85 0.32
86 0.31
87 0.31
88 0.27
89 0.25
90 0.23
91 0.22
92 0.24
93 0.26
94 0.33
95 0.36
96 0.41
97 0.42
98 0.42
99 0.37
100 0.34
101 0.3
102 0.23
103 0.19
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.23
115 0.26
116 0.36
117 0.46
118 0.56
119 0.63
120 0.69
121 0.73
122 0.74
123 0.76
124 0.72
125 0.65
126 0.62
127 0.54
128 0.51
129 0.49
130 0.41
131 0.36
132 0.29
133 0.26
134 0.2
135 0.24
136 0.21
137 0.16
138 0.16
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.12
147 0.1
148 0.13
149 0.15
150 0.16
151 0.18
152 0.18
153 0.23
154 0.23
155 0.24
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.18
162 0.2
163 0.22
164 0.22
165 0.23
166 0.22
167 0.21
168 0.24
169 0.27
170 0.31
171 0.31
172 0.32
173 0.28
174 0.29
175 0.29
176 0.29
177 0.27
178 0.19
179 0.18
180 0.17
181 0.17
182 0.19
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.13
201 0.16
202 0.19
203 0.18
204 0.21
205 0.23
206 0.23
207 0.23
208 0.22
209 0.23
210 0.28
211 0.33
212 0.32
213 0.34
214 0.35
215 0.39
216 0.47
217 0.51
218 0.47
219 0.5
220 0.58
221 0.6
222 0.61
223 0.56
224 0.47
225 0.4
226 0.36
227 0.26
228 0.17
229 0.12
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.14
252 0.17
253 0.15
254 0.16
255 0.25
256 0.3
257 0.36
258 0.38
259 0.4
260 0.44
261 0.52
262 0.56
263 0.49
264 0.45
265 0.36
266 0.35
267 0.3
268 0.22
269 0.13
270 0.08
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.17
285 0.19
286 0.25
287 0.33
288 0.37
289 0.39
290 0.43
291 0.46
292 0.5
293 0.48
294 0.46
295 0.38
296 0.33
297 0.31
298 0.26
299 0.22
300 0.16
301 0.12
302 0.07
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.02
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.07
324 0.09
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.12
329 0.14
330 0.18
331 0.17
332 0.16
333 0.15
334 0.19
335 0.2
336 0.19
337 0.19
338 0.16
339 0.19
340 0.19
341 0.2
342 0.2
343 0.21
344 0.22
345 0.29
346 0.32
347 0.3
348 0.33
349 0.35
350 0.35
351 0.41
352 0.49
353 0.5
354 0.57
355 0.65
356 0.7
357 0.72
358 0.77
359 0.79
360 0.8
361 0.78
362 0.79
363 0.78
364 0.76
365 0.79
366 0.72
367 0.65
368 0.57
369 0.5
370 0.41
371 0.36
372 0.33
373 0.24
374 0.23
375 0.23
376 0.23
377 0.28
378 0.3
379 0.3
380 0.31
381 0.33
382 0.34
383 0.36
384 0.37
385 0.32
386 0.33
387 0.36
388 0.34
389 0.32
390 0.32
391 0.3
392 0.28
393 0.3
394 0.29
395 0.23
396 0.22
397 0.26
398 0.24
399 0.23
400 0.22
401 0.19
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.16
408 0.2
409 0.19
410 0.19
411 0.21
412 0.2
413 0.17
414 0.19
415 0.16
416 0.13
417 0.19
418 0.2
419 0.26
420 0.32
421 0.33
422 0.34
423 0.4
424 0.48
425 0.52
426 0.62
427 0.6
428 0.55
429 0.55
430 0.57
431 0.56
432 0.56
433 0.53
434 0.5
435 0.5
436 0.54
437 0.59
438 0.59
439 0.57
440 0.53
441 0.51
442 0.51
443 0.47
444 0.46
445 0.44
446 0.43
447 0.44
448 0.41
449 0.41
450 0.34
451 0.34
452 0.32
453 0.29
454 0.26
455 0.23
456 0.22
457 0.21
458 0.26
459 0.26
460 0.24
461 0.23
462 0.23
463 0.22
464 0.21
465 0.22
466 0.17
467 0.16
468 0.15
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.1
474 0.1
475 0.13
476 0.17
477 0.25
478 0.27
479 0.32
480 0.33
481 0.34
482 0.36
483 0.38
484 0.39
485 0.32
486 0.31
487 0.28
488 0.28
489 0.27
490 0.23
491 0.18
492 0.16
493 0.15
494 0.15
495 0.15
496 0.14
497 0.13
498 0.14
499 0.14
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.09
504 0.1
505 0.09
506 0.1
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.1
511 0.12
512 0.12
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.17
517 0.2
518 0.2
519 0.21