Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YKK3

Protein Details
Accession C7YKK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MENGQVPKPKKINHPRTSRPKPPPPGNEEASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-22KPKKINHPRTSRPKP
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR006590  RNA_pol_Rpb4/RPC9_core  
IPR045222  Rpb4-like  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG nhe:NECHADRAFT_74640  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MENGQVPKPKKINHPRTSRPKPPPPGNEEASTVLNLGEFQEVDTLTLSEAALVLNALVAKRRNDRKNVNETEMLNQTLTYLDHFARFTQKENVEAVERLLSAHKNLAKFERAQLGSLCCENADEAKTLIPSLADKIKDEDLQDLLDEISKLQNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.87
4 0.91
5 0.9
6 0.89
7 0.88
8 0.89
9 0.88
10 0.87
11 0.83
12 0.81
13 0.74
14 0.66
15 0.59
16 0.51
17 0.42
18 0.34
19 0.26
20 0.18
21 0.14
22 0.12
23 0.09
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.06
33 0.07
34 0.06
35 0.05
36 0.05
37 0.04
38 0.04
39 0.03
40 0.03
41 0.03
42 0.04
43 0.04
44 0.06
45 0.09
46 0.12
47 0.19
48 0.29
49 0.33
50 0.41
51 0.49
52 0.55
53 0.63
54 0.64
55 0.61
56 0.56
57 0.51
58 0.47
59 0.4
60 0.33
61 0.22
62 0.18
63 0.14
64 0.11
65 0.1
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.22
76 0.23
77 0.24
78 0.24
79 0.25
80 0.21
81 0.2
82 0.18
83 0.12
84 0.12
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.18
93 0.21
94 0.22
95 0.23
96 0.25
97 0.29
98 0.27
99 0.27
100 0.28
101 0.26
102 0.25
103 0.25
104 0.22
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.09
118 0.12
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.22
123 0.25
124 0.27
125 0.27
126 0.26
127 0.22
128 0.21
129 0.2
130 0.17
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.1