Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8CHA0

Protein Details
Accession A0A1B8CHA0    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MASSKPSKKESKKAVAVKPAKVHydrophilic
305-327VEEGEKEKERREKKERKEKKVKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-32KPSKKESKKAVAVKPAKVSKTAAKKKEA
297-327KKHKKSGEVEEGEKEKERREKKERKEKKVKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MASSKPSKKESKKAVAVKPAKVSKTAAKKKEAEKSTERIADSDIDMDDATSEEGSDSNEEAGSAAGPDEETSSSGSESEGGSGSESESESDEELPVKVTAPTTTLPKRSKNPSPAPTPAPTPAVTQHTSTRPTPFAPPKGYTPLPASSSTNKLLTPAALANKQIWHITAPASLSLASLKNLSLPAGTGGADEEDAPTISLPGGEYSVALAAATADTMRVLLPGRGGYRVVEAPVGRTLHLQRVNVVGGEQYVERKKEARKQPGGLRMRFRPIGFGEEGECGEIGEAEGEEVERPVFKKHKKSGEVEEGEKEKERREKKERKEKKVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.85
3 0.83
4 0.79
5 0.77
6 0.74
7 0.66
8 0.59
9 0.55
10 0.53
11 0.57
12 0.61
13 0.59
14 0.6
15 0.65
16 0.71
17 0.76
18 0.73
19 0.69
20 0.66
21 0.65
22 0.65
23 0.63
24 0.55
25 0.46
26 0.42
27 0.37
28 0.31
29 0.27
30 0.19
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.06
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.05
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.17
90 0.21
91 0.28
92 0.32
93 0.38
94 0.44
95 0.5
96 0.57
97 0.6
98 0.65
99 0.64
100 0.65
101 0.64
102 0.62
103 0.56
104 0.51
105 0.43
106 0.36
107 0.31
108 0.26
109 0.24
110 0.25
111 0.24
112 0.23
113 0.25
114 0.26
115 0.29
116 0.29
117 0.29
118 0.25
119 0.25
120 0.31
121 0.34
122 0.36
123 0.36
124 0.37
125 0.37
126 0.41
127 0.4
128 0.34
129 0.31
130 0.28
131 0.26
132 0.26
133 0.25
134 0.22
135 0.25
136 0.25
137 0.22
138 0.2
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.13
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.13
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.14
220 0.17
221 0.17
222 0.15
223 0.18
224 0.19
225 0.24
226 0.28
227 0.27
228 0.24
229 0.26
230 0.26
231 0.23
232 0.22
233 0.14
234 0.1
235 0.11
236 0.1
237 0.12
238 0.16
239 0.17
240 0.18
241 0.23
242 0.29
243 0.38
244 0.48
245 0.53
246 0.57
247 0.64
248 0.7
249 0.76
250 0.78
251 0.74
252 0.71
253 0.66
254 0.65
255 0.62
256 0.54
257 0.49
258 0.42
259 0.41
260 0.35
261 0.31
262 0.26
263 0.23
264 0.23
265 0.19
266 0.16
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.08
280 0.09
281 0.16
282 0.25
283 0.33
284 0.43
285 0.52
286 0.62
287 0.68
288 0.73
289 0.76
290 0.78
291 0.76
292 0.69
293 0.67
294 0.6
295 0.56
296 0.55
297 0.47
298 0.43
299 0.47
300 0.51
301 0.54
302 0.62
303 0.7
304 0.75
305 0.85
306 0.89
307 0.9