Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8CM42

Protein Details
Accession A0A1B8CM42    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-144LEAAEDKAPRKRKRDNKEEDLEGKBasic
556-583KLGGKNVKGKGKPKTRSSQRASDWKKTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-137KAPRKRKRDNK
150-169AKEEEKEEAERKAERKLKRQ
551-590KPKDLKLGGKNVKGKGKPKTRSSQRASDWKKTGGKKAPKA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 12.833, mito 5, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKKSRESNGASKESKPAKAPKSLVAVEAAVDPTLAALFASSAGPVQAPPKSRYEEAPPPSKKRAAVEQDEESDLEEDEEDEGDDQELSSVDGDLDDEDLEGLSENEEESSDDGGAPLNPLEAAEDKAPRKRKRDNKEEDLEGKYLSKLAKEEEKEEAERKAERKLKRQKLLVEQGEQSSEDEDEEMADAEDADSDEEKPKNRQTPKDVPMHESLTVDKETSELEKAARTVFLANVSTDAITDKKAKKTLMDHMGSFIDDLPPPLDGRPKPKVESIRFRSTAYESTLPKKASFATKALMAATTKSTNAYVVYTSSFAAREAAKRLNATVVLDRHLRVDGVAHPAKTDHRRCVFVGNLGFVDDESMMDEGDENQRKRSKIPSDIEEGLWRQFGKAGEVESVRVVRDEKTRVGKGFAYVQFKDANAVEAALLFNEKKFPPMLPRVLRVTRAKAMKKTANAQKRESAPRPTIKGSNNPNNVVIYNPKMSAQQQSLQGRAGKLLGRAGAAQFRKREEGGKSQERAGGVGQAVAAGIKGPEAFIFEGYRASSNSGKPKDLKLGGKNVKGKGKPKTRSSQRASDWKKTGGKKAPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.57
4 0.57
5 0.55
6 0.61
7 0.62
8 0.59
9 0.6
10 0.57
11 0.51
12 0.44
13 0.38
14 0.29
15 0.28
16 0.22
17 0.13
18 0.12
19 0.1
20 0.08
21 0.07
22 0.06
23 0.04
24 0.03
25 0.04
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.11
34 0.15
35 0.2
36 0.23
37 0.29
38 0.34
39 0.36
40 0.39
41 0.44
42 0.49
43 0.52
44 0.59
45 0.61
46 0.63
47 0.68
48 0.68
49 0.63
50 0.59
51 0.62
52 0.6
53 0.61
54 0.6
55 0.58
56 0.56
57 0.53
58 0.48
59 0.39
60 0.31
61 0.23
62 0.17
63 0.12
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.12
112 0.18
113 0.21
114 0.29
115 0.39
116 0.44
117 0.51
118 0.6
119 0.67
120 0.72
121 0.8
122 0.83
123 0.83
124 0.83
125 0.82
126 0.76
127 0.7
128 0.6
129 0.5
130 0.41
131 0.31
132 0.27
133 0.2
134 0.16
135 0.14
136 0.16
137 0.23
138 0.25
139 0.27
140 0.3
141 0.33
142 0.35
143 0.36
144 0.35
145 0.3
146 0.32
147 0.31
148 0.35
149 0.38
150 0.41
151 0.5
152 0.58
153 0.66
154 0.69
155 0.74
156 0.72
157 0.75
158 0.79
159 0.73
160 0.66
161 0.58
162 0.51
163 0.45
164 0.38
165 0.29
166 0.19
167 0.14
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.1
184 0.12
185 0.15
186 0.19
187 0.25
188 0.34
189 0.4
190 0.46
191 0.51
192 0.6
193 0.64
194 0.68
195 0.64
196 0.6
197 0.57
198 0.52
199 0.44
200 0.34
201 0.29
202 0.23
203 0.21
204 0.17
205 0.13
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.15
230 0.18
231 0.22
232 0.25
233 0.26
234 0.29
235 0.32
236 0.39
237 0.41
238 0.39
239 0.35
240 0.34
241 0.33
242 0.3
243 0.26
244 0.17
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.13
253 0.14
254 0.2
255 0.26
256 0.29
257 0.31
258 0.35
259 0.44
260 0.45
261 0.53
262 0.54
263 0.56
264 0.54
265 0.53
266 0.5
267 0.44
268 0.39
269 0.32
270 0.3
271 0.23
272 0.26
273 0.29
274 0.28
275 0.26
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.23
280 0.21
281 0.17
282 0.18
283 0.18
284 0.17
285 0.16
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.13
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.15
315 0.16
316 0.14
317 0.15
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.15
322 0.13
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.16
327 0.18
328 0.17
329 0.17
330 0.18
331 0.23
332 0.3
333 0.32
334 0.33
335 0.34
336 0.37
337 0.38
338 0.41
339 0.38
340 0.34
341 0.31
342 0.24
343 0.21
344 0.18
345 0.18
346 0.13
347 0.12
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.13
357 0.19
358 0.19
359 0.24
360 0.28
361 0.29
362 0.31
363 0.39
364 0.38
365 0.42
366 0.47
367 0.45
368 0.48
369 0.49
370 0.47
371 0.42
372 0.36
373 0.27
374 0.24
375 0.2
376 0.13
377 0.15
378 0.14
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.15
383 0.16
384 0.16
385 0.14
386 0.15
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.17
392 0.2
393 0.24
394 0.31
395 0.34
396 0.34
397 0.36
398 0.34
399 0.31
400 0.36
401 0.35
402 0.35
403 0.31
404 0.32
405 0.31
406 0.3
407 0.3
408 0.22
409 0.18
410 0.12
411 0.12
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.07
416 0.08
417 0.06
418 0.06
419 0.1
420 0.1
421 0.12
422 0.13
423 0.14
424 0.21
425 0.28
426 0.37
427 0.37
428 0.41
429 0.47
430 0.49
431 0.54
432 0.51
433 0.49
434 0.47
435 0.51
436 0.53
437 0.51
438 0.57
439 0.56
440 0.56
441 0.6
442 0.63
443 0.64
444 0.63
445 0.62
446 0.61
447 0.62
448 0.67
449 0.63
450 0.61
451 0.6
452 0.62
453 0.62
454 0.6
455 0.59
456 0.54
457 0.58
458 0.6
459 0.62
460 0.61
461 0.58
462 0.55
463 0.5
464 0.45
465 0.39
466 0.33
467 0.28
468 0.24
469 0.22
470 0.22
471 0.23
472 0.24
473 0.29
474 0.28
475 0.29
476 0.35
477 0.38
478 0.39
479 0.4
480 0.41
481 0.35
482 0.32
483 0.3
484 0.24
485 0.22
486 0.22
487 0.19
488 0.17
489 0.18
490 0.19
491 0.24
492 0.26
493 0.3
494 0.31
495 0.33
496 0.36
497 0.37
498 0.4
499 0.38
500 0.44
501 0.49
502 0.54
503 0.53
504 0.52
505 0.53
506 0.48
507 0.44
508 0.34
509 0.28
510 0.19
511 0.18
512 0.14
513 0.11
514 0.11
515 0.09
516 0.08
517 0.05
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.08
524 0.09
525 0.11
526 0.12
527 0.12
528 0.14
529 0.15
530 0.16
531 0.15
532 0.18
533 0.21
534 0.26
535 0.36
536 0.38
537 0.43
538 0.45
539 0.49
540 0.54
541 0.57
542 0.59
543 0.57
544 0.64
545 0.66
546 0.71
547 0.73
548 0.71
549 0.73
550 0.71
551 0.72
552 0.71
553 0.74
554 0.74
555 0.77
556 0.81
557 0.82
558 0.86
559 0.86
560 0.85
561 0.84
562 0.86
563 0.85
564 0.83
565 0.78
566 0.76
567 0.77
568 0.74
569 0.76
570 0.75