FuNGI

A0A1B8C2M2

Protein Details

Accession

A0A1B8C2M2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
384-406	SSSEVKKTKSKDKKAAAKPKEAS	Hydrophilic
456-483	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
147-167	AKKEVVPKKAEAKKTKEKSKP
389-409	KKTKSKDKKAAAKPKEASPPL
462-475	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MNPNLVPVAKRKPKAPVGEKPDWLFGNGASKPAAATPQVSLSQPKAGKKTTVKGAKATTTEKSTKTPPSPELLDLVGDFLTEFGFNNTGNLFASERKDRSKSEGWQGRPAAAVKTTSVTLGNIYEKFRETTNDNTGDKQKDTQAAPAKKEVVPKKAEAKKTKEKSKPVAAKESSSDSDVEMGDTKAITTTASKKSSSSGSSSSGSSSSESSDSDADDEKEVPAPKAAAPKAKVNALKRKASSDSSSSSSSDSSSDSDSSSEDEAPKRKKTKTTPAAAESTSSSDSDSSSDSDSSSSESDSAPKKSAKSSSDSSSSDSDSSSSDSDSSSDSDSSTQSAAAKVPLPDSGSDSSSDSDSDSSSDEEMADATAKSDSTATLASSDSDSSSEVKKTKSKDKKAAAKPKEASPPLPPLPPNPVPKKTNVPFSRIPKDIVVDERLKSNAFVPYDYAQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDVEGKKGIRFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.71
3	0.7
4	0.71
5	0.76
6	0.77
7	0.7
8	0.68
9	0.58
10	0.5
11	0.4
12	0.32
13	0.32
14	0.27
15	0.26
16	0.21
17	0.2
18	0.19
19	0.19
20	0.21
21	0.14
22	0.15
23	0.15
24	0.19
25	0.21
26	0.22
27	0.24
28	0.23
29	0.3
30	0.33
31	0.38
32	0.39
33	0.4
34	0.47
35	0.51
36	0.56
37	0.58
38	0.63
39	0.6
40	0.6
41	0.62
42	0.59
43	0.57
44	0.54
45	0.48
46	0.46
47	0.48
48	0.45
49	0.44
50	0.45
51	0.49
52	0.5
53	0.52
54	0.48
55	0.49
56	0.5
57	0.46
58	0.42
59	0.34
60	0.29
61	0.23
62	0.2
63	0.14
64	0.1
65	0.09
66	0.06
67	0.06
68	0.05
69	0.06
70	0.06
71	0.08
72	0.08
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.11
78	0.11
79	0.13
80	0.18
81	0.23
82	0.27
83	0.32
84	0.35
85	0.36
86	0.42
87	0.47
88	0.48
89	0.53
90	0.58
91	0.56
92	0.6
93	0.59
94	0.52
95	0.47
96	0.42
97	0.34
98	0.27
99	0.24
100	0.17
101	0.17
102	0.16
103	0.14
104	0.14
105	0.12
106	0.11
107	0.12
108	0.15
109	0.16
110	0.17
111	0.18
112	0.18
113	0.19
114	0.19
115	0.2
116	0.2
117	0.24
118	0.3
119	0.35
120	0.34
121	0.37
122	0.43
123	0.43
124	0.4
125	0.36
126	0.33
127	0.32
128	0.32
129	0.36
130	0.4
131	0.42
132	0.43
133	0.44
134	0.44
135	0.41
136	0.48
137	0.46
138	0.44
139	0.42
140	0.43
141	0.49
142	0.53
143	0.59
144	0.59
145	0.63
146	0.66
147	0.72
148	0.78
149	0.76
150	0.77
151	0.76
152	0.78
153	0.78
154	0.72
155	0.73
156	0.64
157	0.58
158	0.52
159	0.49
160	0.4
161	0.32
162	0.27
163	0.18
164	0.18
165	0.15
166	0.14
167	0.1
168	0.09
169	0.08
170	0.07
171	0.07
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.07
176	0.13
177	0.19
178	0.22
179	0.22
180	0.22
181	0.24
182	0.27
183	0.27
184	0.24
185	0.2
186	0.21
187	0.22
188	0.22
189	0.21
190	0.18
191	0.17
192	0.14
193	0.12
194	0.1
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.1
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.12
207	0.13
208	0.12
209	0.11
210	0.11
211	0.12
212	0.18
213	0.19
214	0.21
215	0.22
216	0.26
217	0.27
218	0.31
219	0.35
220	0.35
221	0.43
222	0.43
223	0.47
224	0.43
225	0.45
226	0.43
227	0.42
228	0.38
229	0.31
230	0.29
231	0.27
232	0.27
233	0.24
234	0.22
235	0.19
236	0.17
237	0.14
238	0.12
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.11
249	0.13
250	0.19
251	0.24
252	0.3
253	0.34
254	0.36
255	0.43
256	0.49
257	0.57
258	0.6
259	0.63
260	0.62
261	0.61
262	0.6
263	0.52
264	0.45
265	0.35
266	0.28
267	0.21
268	0.16
269	0.12
270	0.09
271	0.1
272	0.09
273	0.1
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.09
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.12
286	0.15
287	0.17
288	0.19
289	0.21
290	0.22
291	0.25
292	0.31
293	0.29
294	0.31
295	0.33
296	0.33
297	0.37
298	0.36
299	0.35
300	0.31
301	0.3
302	0.25
303	0.21
304	0.18
305	0.13
306	0.14
307	0.12
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.09
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.11
320	0.1
321	0.1
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.11
326	0.13
327	0.12
328	0.13
329	0.13
330	0.14
331	0.13
332	0.16
333	0.17
334	0.15
335	0.16
336	0.16
337	0.16
338	0.15
339	0.15
340	0.11
341	0.1
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.11
372	0.13
373	0.17
374	0.18
375	0.22
376	0.27
377	0.33
378	0.43
379	0.52
380	0.59
381	0.65
382	0.73
383	0.79
384	0.85
385	0.9
386	0.86
387	0.85
388	0.79
389	0.76
390	0.76
391	0.68
392	0.61
393	0.55
394	0.56
395	0.49
396	0.5
397	0.44
398	0.38
399	0.43
400	0.48
401	0.52
402	0.52
403	0.56
404	0.54
405	0.59
406	0.66
407	0.62
408	0.65
409	0.59
410	0.58
411	0.59
412	0.64
413	0.67
414	0.59
415	0.57
416	0.48
417	0.48
418	0.45
419	0.41
420	0.38
421	0.35
422	0.33
423	0.34
424	0.33
425	0.3
426	0.27
427	0.25
428	0.25
429	0.23
430	0.22
431	0.23
432	0.24
433	0.3
434	0.3
435	0.27
436	0.23
437	0.24
438	0.25
439	0.22
440	0.22
441	0.18
442	0.18
443	0.25
444	0.29
445	0.27
446	0.27
447	0.3
448	0.31
449	0.36
450	0.4
451	0.43
452	0.49
453	0.59
454	0.68
455	0.75
456	0.82
457	0.84
458	0.9
459	0.91
460	0.9
461	0.91
462	0.88
463	0.86
464	0.84
465	0.79
466	0.68
467	0.58
468	0.57
469	0.46
470	0.42
471	0.34
472	0.27
473	0.23

A0A1B8C2M2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer