Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YU49

Protein Details
Accession C7YU49    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-29SSFFTVPGSQKKRKRTEAPGPPKKRLAAHydrophilic
191-220LPQNQYPQTTRRKPKKPPAPPRKQPKLETWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-43KKRKRTEAPGPPKKRLAASKSSGKAPSKVPGP
201-216RRKPKKPPAPPRKQPK
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031428  C:box C/D RNP complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG nhe:NECHADRAFT_96228  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSSFFTVPGSQKKRKRTEAPGPPKKRLAASKSSGKAPSKVPGPTKNRVERDDDESISGSDSDEDDESYDSVSKDRDAEEQDESDDEGETAAERRLRLAERYLENVKEHVDEAGFDAADIDRDLIAERLQEDVAETKGRVYRQLASELAIDKATRTFFRSNTNAVTSIAACAPYIYTTTKDLYVQKWKTQDLPQNQYPQTTRRKPKKPPAPPRKQPKLETWLKGTTAKSKDKNYQRHTDRILAIAASSDGKFVATGGADHKLIIYDAPTLKPLKVFTHHRDAVTGLAFRRGTNQLYSCSKDRTVKVWSLDELAYVETLFGHQDEVLDIDALAQERCVSVGARDRTARLWKVAEETQLVFRGGAVDKKSRPAVNPRSLLHEGSMDRVAMIDDDLFVTGSDNGSLALWSVQKKKPVYIEPIAHGIEKPLDPKEASAEQDPDPQVVPPPTPRWITAIKTIPYSDVILTGSWDGHIRVWQLSSDKRKIEFRGVLSAPGEEEEDGAPGPITGVVNDISLFERGDRGKDGLCVVVAVGREHRLGRWNPPVKVGRNGGVVFEIPRIQRQADEEEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.83
3 0.83
4 0.85
5 0.87
6 0.9
7 0.91
8 0.89
9 0.87
10 0.83
11 0.77
12 0.74
13 0.72
14 0.68
15 0.67
16 0.66
17 0.68
18 0.66
19 0.69
20 0.68
21 0.63
22 0.59
23 0.53
24 0.53
25 0.49
26 0.52
27 0.53
28 0.56
29 0.59
30 0.65
31 0.71
32 0.73
33 0.74
34 0.71
35 0.71
36 0.65
37 0.65
38 0.62
39 0.53
40 0.45
41 0.4
42 0.36
43 0.3
44 0.25
45 0.18
46 0.13
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.14
61 0.15
62 0.19
63 0.22
64 0.25
65 0.27
66 0.26
67 0.26
68 0.25
69 0.24
70 0.19
71 0.15
72 0.12
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.1
78 0.12
79 0.11
80 0.13
81 0.18
82 0.2
83 0.23
84 0.27
85 0.32
86 0.32
87 0.38
88 0.41
89 0.4
90 0.38
91 0.36
92 0.32
93 0.26
94 0.23
95 0.19
96 0.14
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.05
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.17
124 0.17
125 0.2
126 0.21
127 0.25
128 0.26
129 0.3
130 0.27
131 0.26
132 0.28
133 0.25
134 0.23
135 0.18
136 0.15
137 0.12
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.17
142 0.19
143 0.21
144 0.28
145 0.31
146 0.33
147 0.34
148 0.36
149 0.32
150 0.29
151 0.28
152 0.21
153 0.18
154 0.16
155 0.12
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.11
164 0.13
165 0.14
166 0.17
167 0.2
168 0.23
169 0.32
170 0.34
171 0.36
172 0.39
173 0.4
174 0.41
175 0.46
176 0.49
177 0.48
178 0.52
179 0.53
180 0.57
181 0.56
182 0.54
183 0.49
184 0.48
185 0.5
186 0.52
187 0.57
188 0.59
189 0.68
190 0.74
191 0.83
192 0.86
193 0.87
194 0.89
195 0.9
196 0.91
197 0.91
198 0.92
199 0.92
200 0.88
201 0.81
202 0.78
203 0.76
204 0.73
205 0.67
206 0.62
207 0.54
208 0.48
209 0.48
210 0.41
211 0.4
212 0.39
213 0.43
214 0.42
215 0.45
216 0.52
217 0.57
218 0.66
219 0.64
220 0.67
221 0.65
222 0.67
223 0.65
224 0.62
225 0.53
226 0.45
227 0.39
228 0.28
229 0.23
230 0.16
231 0.13
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.18
261 0.25
262 0.27
263 0.35
264 0.37
265 0.36
266 0.35
267 0.33
268 0.29
269 0.24
270 0.21
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.17
279 0.19
280 0.19
281 0.22
282 0.25
283 0.24
284 0.24
285 0.26
286 0.28
287 0.28
288 0.28
289 0.29
290 0.29
291 0.3
292 0.29
293 0.27
294 0.24
295 0.23
296 0.19
297 0.15
298 0.12
299 0.09
300 0.07
301 0.06
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.06
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.14
326 0.16
327 0.19
328 0.2
329 0.21
330 0.24
331 0.3
332 0.29
333 0.24
334 0.24
335 0.22
336 0.25
337 0.26
338 0.25
339 0.21
340 0.2
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.15
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.14
349 0.15
350 0.19
351 0.2
352 0.24
353 0.28
354 0.27
355 0.3
356 0.37
357 0.44
358 0.47
359 0.51
360 0.48
361 0.52
362 0.52
363 0.49
364 0.39
365 0.34
366 0.26
367 0.23
368 0.23
369 0.15
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.08
374 0.08
375 0.05
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.09
392 0.12
393 0.19
394 0.22
395 0.29
396 0.3
397 0.34
398 0.39
399 0.42
400 0.46
401 0.46
402 0.47
403 0.43
404 0.46
405 0.43
406 0.37
407 0.31
408 0.25
409 0.2
410 0.18
411 0.18
412 0.15
413 0.17
414 0.16
415 0.17
416 0.21
417 0.21
418 0.23
419 0.23
420 0.25
421 0.24
422 0.3
423 0.3
424 0.26
425 0.23
426 0.21
427 0.22
428 0.21
429 0.22
430 0.2
431 0.23
432 0.27
433 0.28
434 0.29
435 0.29
436 0.32
437 0.33
438 0.36
439 0.4
440 0.37
441 0.38
442 0.38
443 0.34
444 0.31
445 0.3
446 0.22
447 0.15
448 0.15
449 0.12
450 0.13
451 0.12
452 0.1
453 0.09
454 0.1
455 0.09
456 0.1
457 0.12
458 0.13
459 0.13
460 0.14
461 0.16
462 0.2
463 0.28
464 0.36
465 0.4
466 0.43
467 0.45
468 0.51
469 0.52
470 0.57
471 0.55
472 0.49
473 0.51
474 0.47
475 0.46
476 0.41
477 0.37
478 0.28
479 0.23
480 0.21
481 0.12
482 0.12
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.08
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.11
501 0.1
502 0.15
503 0.16
504 0.18
505 0.2
506 0.21
507 0.21
508 0.23
509 0.24
510 0.2
511 0.19
512 0.16
513 0.14
514 0.14
515 0.13
516 0.13
517 0.14
518 0.15
519 0.17
520 0.18
521 0.2
522 0.26
523 0.29
524 0.36
525 0.45
526 0.51
527 0.5
528 0.58
529 0.64
530 0.6
531 0.65
532 0.61
533 0.55
534 0.53
535 0.52
536 0.44
537 0.38
538 0.35
539 0.28
540 0.25
541 0.25
542 0.2
543 0.24
544 0.27
545 0.25
546 0.27
547 0.3
548 0.34