Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8CPJ1

Protein Details
Accession A0A1B8CPJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-85IEKANTKTLKRRRPSKKLVATLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-79KANTKTLKRRRPSKK
109-133KIKHRSLKSRPGATKRREKLEKMER
Subcellular Location(s) nucl 13, mito_nucl 12.333, mito 10.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPVAPKKRSSIRAKVSRAGSGMMTRPANYQPSSSFGAGVSDDFLNTKKDKRTIKHSAFVNRIEKANTKTLKRRRPSKKLVATLESLADALPDFDDDGNGGERIVGDAKIKHRSLKSRPGATKRREKLEKMERERFGKNMAQLSATAETAPAMEGQPHAAAAAATSNKWAALRGFISQTLEQKPEFVKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.77
3 0.72
4 0.66
5 0.58
6 0.49
7 0.41
8 0.34
9 0.31
10 0.29
11 0.27
12 0.24
13 0.25
14 0.27
15 0.3
16 0.27
17 0.27
18 0.22
19 0.25
20 0.29
21 0.26
22 0.23
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.16
27 0.13
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.12
33 0.14
34 0.18
35 0.22
36 0.29
37 0.37
38 0.41
39 0.5
40 0.57
41 0.61
42 0.63
43 0.64
44 0.65
45 0.62
46 0.63
47 0.58
48 0.49
49 0.45
50 0.4
51 0.38
52 0.33
53 0.37
54 0.35
55 0.36
56 0.44
57 0.52
58 0.59
59 0.63
60 0.7
61 0.72
62 0.78
63 0.82
64 0.83
65 0.83
66 0.81
67 0.78
68 0.7
69 0.61
70 0.51
71 0.42
72 0.31
73 0.22
74 0.14
75 0.09
76 0.06
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.09
95 0.12
96 0.19
97 0.19
98 0.23
99 0.27
100 0.34
101 0.4
102 0.48
103 0.52
104 0.55
105 0.62
106 0.67
107 0.72
108 0.72
109 0.76
110 0.71
111 0.73
112 0.7
113 0.66
114 0.66
115 0.68
116 0.7
117 0.69
118 0.72
119 0.67
120 0.66
121 0.65
122 0.56
123 0.5
124 0.43
125 0.38
126 0.34
127 0.3
128 0.26
129 0.24
130 0.26
131 0.23
132 0.19
133 0.15
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.07
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.14
157 0.1
158 0.14
159 0.16
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.26
164 0.27
165 0.32
166 0.32
167 0.33
168 0.3
169 0.31