FuNGI

A0A1B8C1U7

Protein Details

Accession

A0A1B8C1U7

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
430-449	MKKRLGKSLRKSLRKREKNY	Basic
537-562	ETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
426-447	KEKEMKKRLGKSLRKSLRKREK
489-489	K
519-523	HKKHN
545-551	RKKHKKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPAGITPNGTPTPNSGGQPRKIIRRAKADPFATYKKPVARPQAAPRSRQQQNQNGLTALNKPPPAPRPLPRYPGNNAGAAAAGPSASNAPPQPQLDFTRKSNIGEYEDYALTTTKRAMREGLRYHIARFASKKPVDPTNSDDFIKPVSLHRRDPRQPPAGKIAKDEDTVMGEPIDDKEREKQEIARAAKEAQRAADLAQIAPSGNNASALAAKKVQSFKNEKTTQVHRTAQTEEEMKESDLRYEEALPWHLEDAENKQTWVGNYEAALSDTNVIFVIDGTNFRMVPIEKWYKFTPKNQFKTLTIEEAEAEMNKKSKANRWVMHADQQNQEAAERQRGIQAMAGLYSKVKGERPMPKSEARDHDDLDITDDLFQDDDEQATVEPENDEDTKFAAEKIKREQLGANLFGDADEEEVEEEFKEEAKEKEMKKRLGKSLRKSLRKREKNYTYESDSSNPYSSSSGDETTDDEKQAEEDRKKDEEAKLKEKEKLGVPKIASGASTKGTTTPIGRPRSTDPHKKHNHLKRAGSPNLSASETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGTATPRSGSPHPSSSAPAGGVSPRKSSIVKLHVNSSRLSDIQANSPHPAMSDSEMSDGAGGKRKSGIKLRLGTSASPSRAGSPTNGSRAGSPAQAQGMAPLSLSPTSQIPFRPTSPPKPRGGSPASARVTNSSAGAASPIRPIMADEIAAAIPAEGIAIGMLLKIFSGRIKGNGKDKEDREKFIKLVKENSVFSQEDKLLRPRAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.3
3	0.32
4	0.33
5	0.35
6	0.41
7	0.44
8	0.54
9	0.56
10	0.59
11	0.63
12	0.69
13	0.69
14	0.71
15	0.75
16	0.75
17	0.78
18	0.71
19	0.68
20	0.68
21	0.67
22	0.61
23	0.59
24	0.55
25	0.55
26	0.6
27	0.62
28	0.64
29	0.65
30	0.68
31	0.73
32	0.79
33	0.75
34	0.72
35	0.72
36	0.72
37	0.7
38	0.7
39	0.69
40	0.68
41	0.72
42	0.73
43	0.67
44	0.58
45	0.52
46	0.46
47	0.42
48	0.37
49	0.34
50	0.3
51	0.29
52	0.34
53	0.39
54	0.45
55	0.47
56	0.5
57	0.53
58	0.6
59	0.66
60	0.66
61	0.67
62	0.64
63	0.66
64	0.6
65	0.53
66	0.46
67	0.38
68	0.32
69	0.25
70	0.2
71	0.11
72	0.08
73	0.05
74	0.06
75	0.07
76	0.07
77	0.1
78	0.11
79	0.14
80	0.19
81	0.21
82	0.23
83	0.26
84	0.31
85	0.36
86	0.4
87	0.4
88	0.44
89	0.44
90	0.44
91	0.44
92	0.42
93	0.4
94	0.37
95	0.36
96	0.31
97	0.3
98	0.28
99	0.23
100	0.21
101	0.16
102	0.15
103	0.17
104	0.18
105	0.19
106	0.21
107	0.26
108	0.3
109	0.39
110	0.43
111	0.45
112	0.48
113	0.47
114	0.47
115	0.47
116	0.43
117	0.38
118	0.37
119	0.37
120	0.4
121	0.41
122	0.45
123	0.45
124	0.52
125	0.51
126	0.51
127	0.51
128	0.48
129	0.5
130	0.45
131	0.41
132	0.34
133	0.31
134	0.28
135	0.23
136	0.22
137	0.28
138	0.32
139	0.4
140	0.47
141	0.56
142	0.61
143	0.69
144	0.72
145	0.71
146	0.7
147	0.66
148	0.69
149	0.66
150	0.6
151	0.55
152	0.51
153	0.45
154	0.42
155	0.38
156	0.29
157	0.25
158	0.24
159	0.21
160	0.15
161	0.12
162	0.12
163	0.13
164	0.15
165	0.12
166	0.14
167	0.21
168	0.25
169	0.28
170	0.29
171	0.31
172	0.34
173	0.43
174	0.44
175	0.39
176	0.37
177	0.37
178	0.39
179	0.38
180	0.33
181	0.24
182	0.23
183	0.21
184	0.2
185	0.19
186	0.16
187	0.13
188	0.12
189	0.12
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.1
199	0.12
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.19
204	0.24
205	0.27
206	0.31
207	0.37
208	0.41
209	0.5
210	0.52
211	0.51
212	0.52
213	0.56
214	0.55
215	0.55
216	0.55
217	0.47
218	0.47
219	0.46
220	0.41
221	0.37
222	0.33
223	0.26
224	0.23
225	0.22
226	0.19
227	0.2
228	0.18
229	0.17
230	0.15
231	0.15
232	0.14
233	0.14
234	0.16
235	0.15
236	0.17
237	0.15
238	0.15
239	0.14
240	0.13
241	0.12
242	0.12
243	0.15
244	0.2
245	0.2
246	0.19
247	0.19
248	0.2
249	0.2
250	0.21
251	0.16
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.08
259	0.09
260	0.08
261	0.08
262	0.07
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.1
274	0.1
275	0.11
276	0.18
277	0.25
278	0.25
279	0.29
280	0.31
281	0.38
282	0.41
283	0.48
284	0.52
285	0.53
286	0.58
287	0.6
288	0.62
289	0.55
290	0.58
291	0.52
292	0.44
293	0.34
294	0.29
295	0.24
296	0.21
297	0.19
298	0.13
299	0.12
300	0.09
301	0.1
302	0.1
303	0.12
304	0.13
305	0.2
306	0.28
307	0.36
308	0.38
309	0.42
310	0.48
311	0.47
312	0.53
313	0.51
314	0.46
315	0.39
316	0.38
317	0.32
318	0.26
319	0.24
320	0.21
321	0.17
322	0.17
323	0.16
324	0.15
325	0.17
326	0.17
327	0.17
328	0.14
329	0.14
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.08
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.1
340	0.17
341	0.26
342	0.3
343	0.36
344	0.39
345	0.43
346	0.45
347	0.48
348	0.49
349	0.44
350	0.42
351	0.37
352	0.34
353	0.3
354	0.26
355	0.23
356	0.16
357	0.12
358	0.11
359	0.1
360	0.08
361	0.07
362	0.07
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.05
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.13
383	0.14
384	0.17
385	0.22
386	0.27
387	0.27
388	0.28
389	0.29
390	0.28
391	0.3
392	0.28
393	0.23
394	0.17
395	0.17
396	0.16
397	0.14
398	0.09
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.05
407	0.04
408	0.05
409	0.06
410	0.07
411	0.08
412	0.12
413	0.18
414	0.2
415	0.3
416	0.37
417	0.43
418	0.48
419	0.55
420	0.6
421	0.65
422	0.71
423	0.69
424	0.72
425	0.75
426	0.78
427	0.77
428	0.79
429	0.79
430	0.81
431	0.8
432	0.8
433	0.8
434	0.76
435	0.77
436	0.71
437	0.66
438	0.59
439	0.54
440	0.46
441	0.38
442	0.35
443	0.28
444	0.23
445	0.18
446	0.16
447	0.14
448	0.15
449	0.14
450	0.13
451	0.12
452	0.13
453	0.14
454	0.16
455	0.16
456	0.14
457	0.12
458	0.11
459	0.12
460	0.16
461	0.21
462	0.21
463	0.23
464	0.27
465	0.29
466	0.3
467	0.34
468	0.36
469	0.38
470	0.42
471	0.48
472	0.51
473	0.52
474	0.56
475	0.52
476	0.5
477	0.47
478	0.49
479	0.44
480	0.42
481	0.39
482	0.37
483	0.36
484	0.33
485	0.27
486	0.19
487	0.17
488	0.14
489	0.14
490	0.11
491	0.11
492	0.12
493	0.13
494	0.14
495	0.2
496	0.27
497	0.32
498	0.32
499	0.34
500	0.38
501	0.47
502	0.53
503	0.56
504	0.54
505	0.59
506	0.67
507	0.71
508	0.76
509	0.76
510	0.78
511	0.76
512	0.76
513	0.75
514	0.76
515	0.73
516	0.66
517	0.58
518	0.5
519	0.45
520	0.39
521	0.3
522	0.22
523	0.2
524	0.17
525	0.18
526	0.17
527	0.15
528	0.18
529	0.21
530	0.26
531	0.33
532	0.44
533	0.5
534	0.58
535	0.68
536	0.76
537	0.83
538	0.88
539	0.88
540	0.87
541	0.86
542	0.86
543	0.82
544	0.71
545	0.61
546	0.51
547	0.43
548	0.36
549	0.31
550	0.22
551	0.17
552	0.19
553	0.24
554	0.25
555	0.28
556	0.3
557	0.31
558	0.32
559	0.33
560	0.33
561	0.29
562	0.28
563	0.23
564	0.19
565	0.15
566	0.17
567	0.21
568	0.21
569	0.21
570	0.21
571	0.23
572	0.23
573	0.26
574	0.31
575	0.34
576	0.39
577	0.39
578	0.46
579	0.48
580	0.49
581	0.46
582	0.41
583	0.35
584	0.28
585	0.28
586	0.25
587	0.22
588	0.27
589	0.31
590	0.29
591	0.28
592	0.28
593	0.26
594	0.22
595	0.22
596	0.17
597	0.15
598	0.16
599	0.15
600	0.16
601	0.16
602	0.15
603	0.14
604	0.14
605	0.13
606	0.18
607	0.18
608	0.17
609	0.22
610	0.26
611	0.31
612	0.39
613	0.44
614	0.45
615	0.52
616	0.53
617	0.55
618	0.54
619	0.49
620	0.47
621	0.46
622	0.39
623	0.35
624	0.33
625	0.29
626	0.29
627	0.29
628	0.25
629	0.26
630	0.3
631	0.33
632	0.34
633	0.31
634	0.3
635	0.33
636	0.32
637	0.26
638	0.22
639	0.2
640	0.19
641	0.2
642	0.19
643	0.17
644	0.17
645	0.15
646	0.13
647	0.11
648	0.11
649	0.11
650	0.11
651	0.1
652	0.1
653	0.12
654	0.14
655	0.17
656	0.2
657	0.24
658	0.27
659	0.36
660	0.41
661	0.51
662	0.59
663	0.64
664	0.65
665	0.66
666	0.67
667	0.66
668	0.64
669	0.61
670	0.57
671	0.59
672	0.55
673	0.52
674	0.49
675	0.44
676	0.4
677	0.33
678	0.28
679	0.19
680	0.16
681	0.14
682	0.16
683	0.14
684	0.13
685	0.14
686	0.14
687	0.13
688	0.13
689	0.14
690	0.15
691	0.15
692	0.14
693	0.11
694	0.13
695	0.13
696	0.13
697	0.11
698	0.07
699	0.06
700	0.05
701	0.05
702	0.03
703	0.03
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.03
710	0.04
711	0.04
712	0.05
713	0.07
714	0.11
715	0.13
716	0.21
717	0.28
718	0.34
719	0.43
720	0.51
721	0.56
722	0.61
723	0.65
724	0.68
725	0.68
726	0.68
727	0.64
728	0.61
729	0.57
730	0.55
731	0.58
732	0.52
733	0.54
734	0.56
735	0.57
736	0.53
737	0.54
738	0.53
739	0.46
740	0.43
741	0.42
742	0.38
743	0.36
744	0.39
745	0.42

A0A1B8C1U7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer