Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8CN18

Protein Details
Accession A0A1B8CN18    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-198SEPPAKRGRGRPPKNKAPVANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-135RKRGRP
180-194PPAKRGRGRPPKNKA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 15, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MAVGPFSEYEQRFLLSEILKTSNTPINALLGVLREQNFDPIWEEVGLPAGRSVNSCAAELAKLNSSVSGDSNPDITKATSRGIKRTLSASAFYGPATPATKAREIKPKPAAASNGADKPITSTPATGSARKRGRPSNAELAQRAKEASERGEAEKGVHATKRKSISDQSVGEASAPGSEPPAKRGRGRPPKNKAPVANPGGVDVEESKPSEADTDVAAPADPEPEPVVNDTTPQDDAATKETRENLEVVARAASATVSEALAPQPPIAPSNIPAPTSAFKKIFGLGGQTPTTQAPPPEQAIGAAAH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.19
3 0.21
4 0.21
5 0.23
6 0.22
7 0.22
8 0.25
9 0.26
10 0.24
11 0.24
12 0.21
13 0.2
14 0.2
15 0.19
16 0.16
17 0.13
18 0.13
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.16
23 0.19
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.15
31 0.12
32 0.17
33 0.16
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.13
39 0.17
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.18
66 0.21
67 0.23
68 0.28
69 0.31
70 0.32
71 0.31
72 0.32
73 0.34
74 0.29
75 0.29
76 0.25
77 0.22
78 0.21
79 0.19
80 0.17
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.14
86 0.17
87 0.23
88 0.25
89 0.29
90 0.37
91 0.39
92 0.46
93 0.5
94 0.5
95 0.46
96 0.47
97 0.45
98 0.38
99 0.39
100 0.34
101 0.3
102 0.27
103 0.25
104 0.21
105 0.22
106 0.19
107 0.18
108 0.15
109 0.12
110 0.12
111 0.21
112 0.23
113 0.24
114 0.25
115 0.32
116 0.37
117 0.4
118 0.44
119 0.42
120 0.47
121 0.48
122 0.51
123 0.52
124 0.52
125 0.52
126 0.48
127 0.46
128 0.4
129 0.35
130 0.29
131 0.19
132 0.15
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.13
144 0.14
145 0.16
146 0.16
147 0.21
148 0.26
149 0.25
150 0.27
151 0.29
152 0.32
153 0.36
154 0.35
155 0.31
156 0.27
157 0.26
158 0.23
159 0.19
160 0.13
161 0.08
162 0.07
163 0.05
164 0.06
165 0.1
166 0.1
167 0.14
168 0.2
169 0.22
170 0.26
171 0.34
172 0.44
173 0.51
174 0.61
175 0.67
176 0.71
177 0.78
178 0.82
179 0.81
180 0.74
181 0.68
182 0.68
183 0.62
184 0.55
185 0.45
186 0.38
187 0.32
188 0.28
189 0.23
190 0.16
191 0.13
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.14
224 0.17
225 0.19
226 0.17
227 0.2
228 0.23
229 0.24
230 0.24
231 0.23
232 0.2
233 0.2
234 0.2
235 0.18
236 0.15
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.15
257 0.22
258 0.24
259 0.23
260 0.23
261 0.25
262 0.28
263 0.3
264 0.35
265 0.29
266 0.27
267 0.29
268 0.3
269 0.28
270 0.25
271 0.27
272 0.24
273 0.28
274 0.28
275 0.27
276 0.27
277 0.26
278 0.27
279 0.24
280 0.22
281 0.22
282 0.25
283 0.28
284 0.28
285 0.27
286 0.25