Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YZS4

Protein Details
Accession C7YZS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-42VTTPVKPKFKRAFSHKQTHAVHRIRRVKCDEEKPICRRCIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-65RRKNAKAKAK
Subcellular Location(s) nucl 9, plas 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021858  Fun_TF  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG nhe:NECHADRAFT_84128  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11951  Fungal_trans_2  
PF00172  Zn_clus  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MTVTTPVKPKFKRAFSHKQTHAVHRIRRVKCDEEKPICRRCINEKFKCDGYAMPPRRKNAKAKAKAESVAARQSELPLTISEAMFSTNWEKLYFHHFLHWTAKQLLSSPDSSNFWLRYALPLAHHCEAVRYSMVAVGASHRLSMARSVAHLKPFELERIAIHQYNKAISVIMPSMSVDSVYNRHCILICCLLFVSVEGLMGRYDDLLRHLRSGNQLLTSSLKDSTPDEYAVNEKLVEVFSRLSTETSNFCQKNVASGVSQWYQTNANPNITPTQPFRDLDEASYELQRLSVRRIDNAWYSRVECEDDDTDEVESAKRLAMIHENFSAWNSRFEAMPCVNQTSLLDESSSQLRNLRLAQQFWKLTSAVLVPDESISGPISDPTFFYDFMAAATSAAGPLIAMNQPTFSLDGDLISGLNFVAASAIHPSVAGVKIQALDLLRRLDRREGVWDSGDIVRLYELMAAADEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.87
4 0.83
5 0.83
6 0.8
7 0.8
8 0.81
9 0.78
10 0.76
11 0.75
12 0.79
13 0.73
14 0.76
15 0.73
16 0.72
17 0.72
18 0.75
19 0.75
20 0.75
21 0.81
22 0.8
23 0.82
24 0.79
25 0.73
26 0.69
27 0.68
28 0.69
29 0.7
30 0.72
31 0.7
32 0.7
33 0.69
34 0.66
35 0.58
36 0.5
37 0.47
38 0.48
39 0.5
40 0.54
41 0.56
42 0.61
43 0.68
44 0.71
45 0.73
46 0.73
47 0.75
48 0.75
49 0.77
50 0.78
51 0.75
52 0.7
53 0.65
54 0.6
55 0.53
56 0.5
57 0.43
58 0.37
59 0.32
60 0.31
61 0.28
62 0.23
63 0.19
64 0.13
65 0.15
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.23
80 0.25
81 0.23
82 0.27
83 0.27
84 0.3
85 0.37
86 0.37
87 0.35
88 0.34
89 0.34
90 0.28
91 0.29
92 0.29
93 0.25
94 0.26
95 0.23
96 0.24
97 0.24
98 0.26
99 0.28
100 0.25
101 0.23
102 0.22
103 0.2
104 0.2
105 0.21
106 0.21
107 0.19
108 0.22
109 0.27
110 0.26
111 0.27
112 0.23
113 0.23
114 0.22
115 0.21
116 0.18
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.09
133 0.11
134 0.16
135 0.18
136 0.22
137 0.22
138 0.21
139 0.21
140 0.22
141 0.22
142 0.18
143 0.16
144 0.13
145 0.17
146 0.2
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.16
154 0.13
155 0.11
156 0.12
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.06
165 0.07
166 0.1
167 0.11
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.2
175 0.18
176 0.17
177 0.17
178 0.17
179 0.15
180 0.14
181 0.12
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.08
193 0.12
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.17
198 0.2
199 0.23
200 0.21
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.18
205 0.16
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.21
235 0.2
236 0.2
237 0.22
238 0.21
239 0.23
240 0.23
241 0.21
242 0.13
243 0.14
244 0.18
245 0.16
246 0.17
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.21
252 0.19
253 0.2
254 0.19
255 0.21
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.18
260 0.21
261 0.22
262 0.22
263 0.24
264 0.25
265 0.25
266 0.23
267 0.24
268 0.2
269 0.18
270 0.18
271 0.16
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.11
276 0.13
277 0.17
278 0.17
279 0.19
280 0.2
281 0.23
282 0.28
283 0.29
284 0.28
285 0.25
286 0.25
287 0.25
288 0.24
289 0.23
290 0.16
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.1
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.16
307 0.18
308 0.2
309 0.21
310 0.22
311 0.2
312 0.21
313 0.25
314 0.18
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.17
319 0.18
320 0.23
321 0.2
322 0.23
323 0.22
324 0.23
325 0.23
326 0.22
327 0.22
328 0.19
329 0.19
330 0.15
331 0.14
332 0.11
333 0.13
334 0.17
335 0.18
336 0.14
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.21
341 0.28
342 0.28
343 0.3
344 0.34
345 0.38
346 0.39
347 0.38
348 0.38
349 0.3
350 0.25
351 0.23
352 0.2
353 0.14
354 0.13
355 0.12
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.13
369 0.15
370 0.14
371 0.15
372 0.14
373 0.13
374 0.13
375 0.15
376 0.1
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.04
384 0.04
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.12
393 0.1
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.07
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.12
415 0.13
416 0.12
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.15
422 0.13
423 0.14
424 0.18
425 0.23
426 0.25
427 0.28
428 0.31
429 0.35
430 0.37
431 0.38
432 0.42
433 0.42
434 0.42
435 0.41
436 0.38
437 0.35
438 0.33
439 0.33
440 0.25
441 0.21
442 0.17
443 0.15
444 0.14
445 0.12
446 0.11
447 0.08
448 0.08