FuNGI

A0A1B8CBX6

Protein Details

Accession

A0A1B8CBX6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-52	ILDQQGPRKRVKQHPDDLKRELDR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
526-592	KIKALPPAEASGRGRGDSRGGRGDRGGRGGNQRGGAQRGGAQQRGRGGPPRASHNPGHMGRGGRPGG

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 11, nucl 7.5, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MAEALAESLQKVHISSTADSRDDAWIDSILDQQGPRKRVKQHPDDLKRELDRKFLTPSTSFSTEWLNKLQQRWDCPTDYTDLFKIAPTQTRTITRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPGNRAEFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEQAAALEEQMMRVEGKGVAGAAKLERVINFGAGDGLLEVAPGFKRGVSFKPKKGRGEEVEAEEVEKVLDQEPVEDEGLERGQEESPGRGLEEEEEDEEEEDIDSILPVEFAAFEPRSALATSAAKRGAREWAHMVDIKRGITNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQIFDEVGILTGDVQIAPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPIPLEHYLWANKEIHKIVDSDKKFIEKGWKAANDAMSGRDKIKALPPAEASGRGRGDSRGGRGDRGGRGGNQRGGAQRGGAQQRGRGGPPRASHNPGHMGRGGRPGGRTSAAQDKTLWVHLVQFLKKESLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTAIEKSAIHMTIEKSIARLKPEDRVLPQIVRLRDLLGRGIAVHHGGLLPIVKEVVEMLFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTIGTVIIVAPGGDEAPPVTELRQMILGEPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKQVKISEADLAKIKREPCDICDVDLEACHQAGQEYMQLTLDLHLGVLGTPVGRRMFAPRKLVVYMKDGVRTPGILLREGATSGPNPTIHVLEIRTRRDVRDSTDLLPFLPQYREMMTKLPQAKKHISTKTLWVPVTDLICVTKTTLKGIVPEIFQGGDGYLAAVAELSRLCQSWTLPEWDELDWSKIKDMTTRELLEKRRQVAEAAQQGACISCPEFLKHYAMRQDEWVIKENIHQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLRDLSFIDDTSRVELKGKVACEIHSADELVLTELILDNVLAAYEPAEIVALLSAFVFQEKTDTVPTLTPNLKAGMATIIEISEKVNAVQTLHQVILSTEDSNDFVSRPRFGLVEVVYEWARGMSFRNITDLTDVLEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIVGDPELFLKMQKCQEMIKRDITAVASLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.19
3	0.26
4	0.3
5	0.3
6	0.3
7	0.31
8	0.31
9	0.28
10	0.27
11	0.21
12	0.17
13	0.17
14	0.18
15	0.19
16	0.17
17	0.18
18	0.18
19	0.23
20	0.3
21	0.33
22	0.39
23	0.43
24	0.51
25	0.59
26	0.69
27	0.72
28	0.75
29	0.82
30	0.86
31	0.87
32	0.82
33	0.81
34	0.78
35	0.74
36	0.66
37	0.63
38	0.56
39	0.52
40	0.54
41	0.48
42	0.46
43	0.42
44	0.44
45	0.42
46	0.43
47	0.39
48	0.33
49	0.4
50	0.38
51	0.39
52	0.4
53	0.41
54	0.41
55	0.46
56	0.53
57	0.49
58	0.53
59	0.58
60	0.57
61	0.52
62	0.5
63	0.48
64	0.46
65	0.42
66	0.39
67	0.32
68	0.3
69	0.27
70	0.25
71	0.27
72	0.26
73	0.31
74	0.31
75	0.33
76	0.36
77	0.44
78	0.45
79	0.47
80	0.49
81	0.48
82	0.47
83	0.45
84	0.46
85	0.41
86	0.42
87	0.4
88	0.38
89	0.32
90	0.31
91	0.33
92	0.29
93	0.26
94	0.24
95	0.21
96	0.17
97	0.19
98	0.2
99	0.16
100	0.17
101	0.16
102	0.2
103	0.2
104	0.2
105	0.2
106	0.2
107	0.19
108	0.19
109	0.2
110	0.21
111	0.26
112	0.29
113	0.35
114	0.4
115	0.44
116	0.51
117	0.58
118	0.6
119	0.59
120	0.59
121	0.58
122	0.54
123	0.5
124	0.46
125	0.37
126	0.32
127	0.27
128	0.24
129	0.17
130	0.14
131	0.14
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.07
140	0.08
141	0.07
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.05
149	0.06
150	0.06
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.09
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.1
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.11
166	0.11
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.13
171	0.12
172	0.11
173	0.09
174	0.09
175	0.07
176	0.06
177	0.05
178	0.05
179	0.04
180	0.05
181	0.06
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.1
186	0.13
187	0.22
188	0.31
189	0.39
190	0.48
191	0.58
192	0.65
193	0.71
194	0.73
195	0.75
196	0.7
197	0.7
198	0.66
199	0.61
200	0.57
201	0.49
202	0.44
203	0.35
204	0.28
205	0.19
206	0.14
207	0.1
208	0.07
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.12
213	0.14
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.13
219	0.12
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.13
224	0.13
225	0.13
226	0.14
227	0.15
228	0.15
229	0.14
230	0.14
231	0.13
232	0.15
233	0.14
234	0.14
235	0.14
236	0.14
237	0.15
238	0.14
239	0.12
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.11
253	0.1
254	0.1
255	0.12
256	0.12
257	0.14
258	0.13
259	0.13
260	0.11
261	0.17
262	0.19
263	0.22
264	0.25
265	0.24
266	0.25
267	0.26
268	0.31
269	0.27
270	0.29
271	0.29
272	0.28
273	0.31
274	0.34
275	0.34
276	0.3
277	0.31
278	0.28
279	0.26
280	0.24
281	0.24
282	0.22
283	0.26
284	0.22
285	0.21
286	0.23
287	0.22
288	0.25
289	0.24
290	0.23
291	0.18
292	0.23
293	0.22
294	0.2
295	0.21
296	0.19
297	0.18
298	0.17
299	0.17
300	0.15
301	0.17
302	0.19
303	0.18
304	0.17
305	0.17
306	0.18
307	0.19
308	0.19
309	0.17
310	0.15
311	0.15
312	0.14
313	0.15
314	0.14
315	0.1
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.05
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.1
345	0.11
346	0.18
347	0.19
348	0.21
349	0.23
350	0.26
351	0.26
352	0.3
353	0.38
354	0.38
355	0.47
356	0.47
357	0.52
358	0.53
359	0.55
360	0.61
361	0.52
362	0.45
363	0.42
364	0.41
365	0.34
366	0.3
367	0.29
368	0.17
369	0.17
370	0.15
371	0.08
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.08
395	0.11
396	0.1
397	0.09
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.09
410	0.07
411	0.06
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.07
418	0.09
419	0.09
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.04
440	0.03
441	0.03
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.09
453	0.1
454	0.1
455	0.16
456	0.22
457	0.26
458	0.29
459	0.34
460	0.38
461	0.4
462	0.45
463	0.41
464	0.41
465	0.44
466	0.47
467	0.44
468	0.43
469	0.41
470	0.37
471	0.37
472	0.31
473	0.25
474	0.25
475	0.27
476	0.25
477	0.25
478	0.28
479	0.27
480	0.28
481	0.28
482	0.25
483	0.22
484	0.24
485	0.23
486	0.19
487	0.19
488	0.19
489	0.21
490	0.28
491	0.27
492	0.26
493	0.26
494	0.27
495	0.26
496	0.27
497	0.32
498	0.26
499	0.29
500	0.33
501	0.34
502	0.33
503	0.36
504	0.35
505	0.27
506	0.25
507	0.23
508	0.19
509	0.18
510	0.17
511	0.17
512	0.16
513	0.15
514	0.2
515	0.23
516	0.22
517	0.24
518	0.24
519	0.24
520	0.25
521	0.27
522	0.23
523	0.21
524	0.21
525	0.18
526	0.18
527	0.16
528	0.2
529	0.19
530	0.2
531	0.23
532	0.23
533	0.24
534	0.25
535	0.28
536	0.25
537	0.26
538	0.25
539	0.2
540	0.25
541	0.28
542	0.28
543	0.25
544	0.26
545	0.25
546	0.26
547	0.23
548	0.18
549	0.17
550	0.21
551	0.23
552	0.24
553	0.23
554	0.22
555	0.26
556	0.27
557	0.25
558	0.25
559	0.25
560	0.27
561	0.28
562	0.34
563	0.35
564	0.37
565	0.37
566	0.35
567	0.4
568	0.36
569	0.36
570	0.31
571	0.28
572	0.25
573	0.3
574	0.28
575	0.21
576	0.21
577	0.2
578	0.19
579	0.19
580	0.18
581	0.14
582	0.22
583	0.22
584	0.22
585	0.21
586	0.21
587	0.21
588	0.22
589	0.19
590	0.1
591	0.1
592	0.13
593	0.17
594	0.16
595	0.16
596	0.16
597	0.16
598	0.16
599	0.16
600	0.14
601	0.12
602	0.13
603	0.12
604	0.13
605	0.12
606	0.12
607	0.12
608	0.12
609	0.17
610	0.17
611	0.24
612	0.24
613	0.26
614	0.27
615	0.32
616	0.34
617	0.34
618	0.38
619	0.33
620	0.31
621	0.29
622	0.28
623	0.23
624	0.19
625	0.12
626	0.07
627	0.05
628	0.09
629	0.09
630	0.08
631	0.1
632	0.1
633	0.1
634	0.12
635	0.12
636	0.09
637	0.11
638	0.11
639	0.12
640	0.14
641	0.12
642	0.11
643	0.15
644	0.16
645	0.16
646	0.18
647	0.16
648	0.2
649	0.23
650	0.25
651	0.23
652	0.27
653	0.27
654	0.25
655	0.29
656	0.28
657	0.26
658	0.24
659	0.23
660	0.19
661	0.18
662	0.19
663	0.15
664	0.1
665	0.1
666	0.08
667	0.08
668	0.07
669	0.06
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.04
674	0.05
675	0.05
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.05
691	0.04
692	0.05
693	0.04
694	0.04
695	0.04
696	0.04
697	0.06
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.07
705	0.07
706	0.07
707	0.06
708	0.06
709	0.07
710	0.07
711	0.07
712	0.08
713	0.1
714	0.13
715	0.19
716	0.23
717	0.28
718	0.28
719	0.29
720	0.34
721	0.36
722	0.38
723	0.41
724	0.41
725	0.36
726	0.41
727	0.4
728	0.34
729	0.29
730	0.25
731	0.19
732	0.15
733	0.15
734	0.09
735	0.1
736	0.1
737	0.1
738	0.11
739	0.11
740	0.11
741	0.12
742	0.12
743	0.12
744	0.12
745	0.12
746	0.11
747	0.09
748	0.09
749	0.07
750	0.07
751	0.06
752	0.05
753	0.04
754	0.03
755	0.03
756	0.03
757	0.03
758	0.03
759	0.03
760	0.03
761	0.04
762	0.05
763	0.05
764	0.06
765	0.08
766	0.08
767	0.09
768	0.11
769	0.1
770	0.1
771	0.14
772	0.15
773	0.14
774	0.15
775	0.16
776	0.17
777	0.19
778	0.2
779	0.19
780	0.24
781	0.29
782	0.32
783	0.37
784	0.35
785	0.38
786	0.38
787	0.36
788	0.32
789	0.25
790	0.22
791	0.15
792	0.13
793	0.09
794	0.07
795	0.06
796	0.05
797	0.06
798	0.06
799	0.07
800	0.09
801	0.11
802	0.13
803	0.14
804	0.14
805	0.14
806	0.15
807	0.17
808	0.17
809	0.19
810	0.19
811	0.23
812	0.25
813	0.25
814	0.24
815	0.26
816	0.26
817	0.25
818	0.25
819	0.24
820	0.25
821	0.25
822	0.25
823	0.24
824	0.24
825	0.22
826	0.2
827	0.21
828	0.18
829	0.19
830	0.23
831	0.21
832	0.2
833	0.23
834	0.24
835	0.21
836	0.26
837	0.26
838	0.23
839	0.32
840	0.31
841	0.29
842	0.28
843	0.26
844	0.22
845	0.21
846	0.19
847	0.1
848	0.1
849	0.08
850	0.07
851	0.06
852	0.06
853	0.07
854	0.08
855	0.08
856	0.08
857	0.08
858	0.08
859	0.08
860	0.09
861	0.09
862	0.06
863	0.05
864	0.05
865	0.05
866	0.05
867	0.05
868	0.04
869	0.04
870	0.04
871	0.07
872	0.07
873	0.08
874	0.08
875	0.17
876	0.25
877	0.3
878	0.36
879	0.36
880	0.38
881	0.4
882	0.42
883	0.36
884	0.32
885	0.31
886	0.27
887	0.28
888	0.25
889	0.25
890	0.23
891	0.21
892	0.17
893	0.17
894	0.16
895	0.13
896	0.13
897	0.13
898	0.13
899	0.13
900	0.12
901	0.1
902	0.09
903	0.1
904	0.12
905	0.11
906	0.12
907	0.13
908	0.13
909	0.12
910	0.14
911	0.14
912	0.19
913	0.25
914	0.27
915	0.32
916	0.33
917	0.34
918	0.38
919	0.39
920	0.37
921	0.39
922	0.4
923	0.36
924	0.38
925	0.37
926	0.31
927	0.3
928	0.25
929	0.19
930	0.17
931	0.15
932	0.13
933	0.15
934	0.18
935	0.18
936	0.21
937	0.21
938	0.28
939	0.35
940	0.4
941	0.42
942	0.46
943	0.52
944	0.55
945	0.61
946	0.6
947	0.55
948	0.52
949	0.55
950	0.56
951	0.55
952	0.49
953	0.4
954	0.36
955	0.35
956	0.33
957	0.26
958	0.18
959	0.13
960	0.13
961	0.13
962	0.13
963	0.14
964	0.13
965	0.15
966	0.18
967	0.18
968	0.19
969	0.23
970	0.24
971	0.21
972	0.21
973	0.2
974	0.16
975	0.16
976	0.14
977	0.1
978	0.07
979	0.06
980	0.05
981	0.04
982	0.04
983	0.04
984	0.03
985	0.03
986	0.04
987	0.04
988	0.05
989	0.06
990	0.07
991	0.07
992	0.09
993	0.1
994	0.14
995	0.17
996	0.21
997	0.22
998	0.23
999	0.25
1000	0.24
1001	0.26
1002	0.22
1003	0.23
1004	0.2
1005	0.19
1006	0.2
1007	0.2
1008	0.2
1009	0.22
1010	0.24
1011	0.27
1012	0.31
1013	0.33
1014	0.36
1015	0.41
1016	0.46
1017	0.51
1018	0.53
1019	0.51
1020	0.49
1021	0.47
1022	0.43
1023	0.42
1024	0.45
1025	0.42
1026	0.4
1027	0.35
1028	0.32
1029	0.31
1030	0.29
1031	0.24
1032	0.16
1033	0.1
1034	0.09
1035	0.11
1036	0.13
1037	0.16
1038	0.18
1039	0.24
1040	0.25
1041	0.3
1042	0.34
1043	0.36
1044	0.35
1045	0.35
1046	0.38
1047	0.37
1048	0.38
1049	0.37
1050	0.31
1051	0.29
1052	0.31
1053	0.37
1054	0.37
1055	0.34
1056	0.33
1057	0.29
1058	0.31
1059	0.32
1060	0.31
1061	0.27
1062	0.24
1063	0.28
1064	0.27
1065	0.29
1066	0.26
1067	0.24
1068	0.22
1069	0.19
1070	0.19
1071	0.19
1072	0.23
1073	0.21
1074	0.23
1075	0.24
1076	0.25
1077	0.25
1078	0.26
1079	0.24
1080	0.2
1081	0.2
1082	0.2
1083	0.2
1084	0.19
1085	0.18
1086	0.17
1087	0.15
1088	0.15
1089	0.18
1090	0.18
1091	0.17
1092	0.18
1093	0.19
1094	0.21
1095	0.24
1096	0.24
1097	0.25
1098	0.25
1099	0.25
1100	0.27
1101	0.27
1102	0.25
1103	0.22
1104	0.22
1105	0.17
1106	0.17
1107	0.16
1108	0.13
1109	0.11
1110	0.09
1111	0.07
1112	0.07
1113	0.07
1114	0.06
1115	0.05
1116	0.04
1117	0.04
1118	0.04
1119	0.04
1120	0.03
1121	0.04
1122	0.04
1123	0.04
1124	0.04
1125	0.04
1126	0.04
1127	0.04
1128	0.05
1129	0.04
1130	0.04
1131	0.04
1132	0.05
1133	0.05
1134	0.06
1135	0.06
1136	0.05
1137	0.08
1138	0.08
1139	0.11
1140	0.13
1141	0.15
1142	0.16
1143	0.18
1144	0.2
1145	0.25
1146	0.26
1147	0.25
1148	0.25
1149	0.25
1150	0.24
1151	0.21
1152	0.2
1153	0.16
1154	0.14
1155	0.13
1156	0.12
1157	0.1
1158	0.1
1159	0.11
1160	0.1
1161	0.09
1162	0.09
1163	0.09
1164	0.12
1165	0.12
1166	0.14
1167	0.17
1168	0.2
1169	0.21
1170	0.21
1171	0.2
1172	0.17
1173	0.17
1174	0.19
1175	0.18
1176	0.15
1177	0.13
1178	0.14
1179	0.15
1180	0.16
1181	0.17
1182	0.13
1183	0.16
1184	0.19
1185	0.2
1186	0.2
1187	0.21
1188	0.2
1189	0.2
1190	0.26
1191	0.22
1192	0.23
1193	0.21
1194	0.23
1195	0.21
1196	0.21
1197	0.2
1198	0.14
1199	0.13
1200	0.1
1201	0.13
1202	0.17
1203	0.21
1204	0.21
1205	0.26
1206	0.26
1207	0.27
1208	0.29
1209	0.26
1210	0.21
1211	0.18
1212	0.18
1213	0.13
1214	0.14
1215	0.12
1216	0.11
1217	0.13
1218	0.1
1219	0.09
1220	0.1
1221	0.1
1222	0.11
1223	0.16
1224	0.17
1225	0.19
1226	0.24
1227	0.29
1228	0.35
1229	0.38
1230	0.38
1231	0.36
1232	0.39
1233	0.43
1234	0.44
1235	0.42
1236	0.37
1237	0.36
1238	0.38
1239	0.41
1240	0.37
1241	0.28
1242	0.24
1243	0.24
1244	0.22
1245	0.24
1246	0.21
1247	0.22
1248	0.27
1249	0.31
1250	0.31
1251	0.36
1252	0.44
1253	0.5
1254	0.53
1255	0.54
1256	0.51
1257	0.48
1258	0.48
1259	0.43
1260	0.36

A0A1B8CBX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer