Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8CHZ8

Protein Details
Accession A0A1B8CHZ8    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-130VEEKMDRRRKIRRFVPPSPSPTPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 8.5, cyto_mito 8, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLNQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGAAAPSAYGVTEKKEEEDDDERFQDPENEVGLFAGGTYDREDDEADRIYQDVEEKMDRRRKIRRFVPPSPSPTPTLHSRWFIKDEQNTDQAYREAREKAEREEYERNNPKIQQQFADLKRALGTVTDEDWANLPEVGDLTGKNRRSKQALRNKFYAVPDSVLAAAGTTGQMGTTVMEDGMASTTEQGDGTMTNFADIGAARDKVLQVRLDQASAGNGGDSVAGSATNIDPKGYLTSLAKSQIGEGDAQVGDIKRARVLLESVIRTNPKHAPGWIAAARLEELAGKMVAARNVIARGCEHCPKSEDVWVENIRLNDNHNAKIIAANAIKNNDHSITLWIEAMNLEAEPRAKKRVIRHALDHIPQSVLLWKEAVNLEEDPNDAKLLLAKATEIIPLSVELWLALARLETAENAQKVLNKARKAVPTSHEIWIAAARLQEQQEVASGVPSKINVMKRAVQALAKESAMLKREDWITEAEKCEDEGAVLTCGNIIREILGWGLDEDDDRKDIWMDDAKSSIGRGKFETARAIYAYALRVFVNSKTLWLAAADLEKNHGTRETLSHLLEKAVEACPQSEVLWMMLAKEKWQAGEIQEARMVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVRLEADNGEPDQARNLLKVARQEAPTNRVWMKSVSFERQLGNVDAALDLVNEALQLFPAADKLWMMKGQIYEGEGKLPQAREAYSTGTKACPRSVPLWLLYSRLEEKAGMVVKARSVLDRARLAVAKSPELWVESIRVERRANNISQAKVLMAKALQEVPKSGLLWSESIWHLEPRTQRKPRSLEAIKKVDDDPILFVTVARIFWGERKLEKAQNWFERGIALDPDLGDTWAWYHKFLVQHGTDEKRADVEAKCILSEPRHGEIWQSVAKDPKNASKKTIEILKTVVTRLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.29
3 0.24
4 0.22
5 0.18
6 0.16
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.21
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.31
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.26
43 0.22
44 0.21
45 0.2
46 0.18
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.12
54 0.16
55 0.17
56 0.19
57 0.21
58 0.23
59 0.27
60 0.32
61 0.32
62 0.33
63 0.35
64 0.33
65 0.31
66 0.31
67 0.29
68 0.25
69 0.23
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.16
75 0.11
76 0.09
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.17
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.19
97 0.21
98 0.31
99 0.38
100 0.42
101 0.48
102 0.57
103 0.63
104 0.68
105 0.75
106 0.77
107 0.79
108 0.83
109 0.85
110 0.83
111 0.82
112 0.78
113 0.71
114 0.64
115 0.56
116 0.52
117 0.49
118 0.47
119 0.44
120 0.45
121 0.46
122 0.48
123 0.5
124 0.5
125 0.52
126 0.52
127 0.51
128 0.5
129 0.52
130 0.48
131 0.44
132 0.42
133 0.36
134 0.32
135 0.28
136 0.27
137 0.25
138 0.26
139 0.33
140 0.34
141 0.37
142 0.44
143 0.44
144 0.47
145 0.53
146 0.54
147 0.57
148 0.64
149 0.62
150 0.58
151 0.58
152 0.59
153 0.57
154 0.56
155 0.48
156 0.45
157 0.51
158 0.48
159 0.54
160 0.46
161 0.39
162 0.37
163 0.34
164 0.28
165 0.2
166 0.2
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.12
183 0.19
184 0.23
185 0.29
186 0.34
187 0.39
188 0.46
189 0.55
190 0.62
191 0.66
192 0.72
193 0.72
194 0.72
195 0.7
196 0.67
197 0.6
198 0.54
199 0.45
200 0.36
201 0.3
202 0.27
203 0.23
204 0.17
205 0.15
206 0.1
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.21
251 0.21
252 0.21
253 0.2
254 0.18
255 0.15
256 0.15
257 0.13
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.05
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.13
279 0.15
280 0.17
281 0.17
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.13
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.15
302 0.19
303 0.2
304 0.21
305 0.23
306 0.25
307 0.24
308 0.27
309 0.26
310 0.24
311 0.24
312 0.23
313 0.24
314 0.24
315 0.29
316 0.27
317 0.24
318 0.21
319 0.2
320 0.19
321 0.15
322 0.14
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.13
339 0.16
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.24
344 0.27
345 0.28
346 0.29
347 0.27
348 0.22
349 0.28
350 0.27
351 0.26
352 0.25
353 0.24
354 0.21
355 0.19
356 0.21
357 0.21
358 0.23
359 0.22
360 0.21
361 0.21
362 0.19
363 0.2
364 0.18
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.16
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.18
373 0.14
374 0.13
375 0.12
376 0.13
377 0.11
378 0.12
379 0.12
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.06
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.06
389 0.08
390 0.1
391 0.14
392 0.15
393 0.2
394 0.27
395 0.37
396 0.44
397 0.45
398 0.48
399 0.52
400 0.56
401 0.54
402 0.48
403 0.38
404 0.3
405 0.26
406 0.22
407 0.18
408 0.13
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.08
452 0.08
453 0.09
454 0.1
455 0.11
456 0.13
457 0.21
458 0.24
459 0.22
460 0.26
461 0.3
462 0.34
463 0.35
464 0.37
465 0.32
466 0.32
467 0.34
468 0.32
469 0.28
470 0.23
471 0.21
472 0.18
473 0.15
474 0.12
475 0.09
476 0.08
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.08
483 0.09
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.11
492 0.14
493 0.15
494 0.17
495 0.22
496 0.22
497 0.25
498 0.25
499 0.21
500 0.2
501 0.2
502 0.19
503 0.14
504 0.13
505 0.12
506 0.14
507 0.14
508 0.14
509 0.12
510 0.13
511 0.14
512 0.14
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.17
517 0.18
518 0.16
519 0.15
520 0.15
521 0.14
522 0.11
523 0.09
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.05
534 0.04
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.14
553 0.14
554 0.15
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.15
559 0.17
560 0.14
561 0.13
562 0.14
563 0.18
564 0.2
565 0.21
566 0.25
567 0.21
568 0.21
569 0.2
570 0.19
571 0.15
572 0.15
573 0.15
574 0.11
575 0.11
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.12
581 0.11
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.09
587 0.09
588 0.07
589 0.1
590 0.09
591 0.09
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.12
596 0.11
597 0.1
598 0.11
599 0.13
600 0.15
601 0.18
602 0.19
603 0.2
604 0.19
605 0.19
606 0.18
607 0.16
608 0.13
609 0.11
610 0.12
611 0.1
612 0.1
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.1
617 0.1
618 0.08
619 0.09
620 0.08
621 0.09
622 0.12
623 0.12
624 0.12
625 0.14
626 0.14
627 0.13
628 0.14
629 0.15
630 0.12
631 0.22
632 0.22
633 0.2
634 0.21
635 0.2
636 0.2
637 0.2
638 0.19
639 0.1
640 0.11
641 0.12
642 0.15
643 0.18
644 0.23
645 0.25
646 0.28
647 0.29
648 0.31
649 0.3
650 0.25
651 0.23
652 0.18
653 0.16
654 0.14
655 0.12
656 0.08
657 0.07
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.06
662 0.06
663 0.08
664 0.08
665 0.09
666 0.09
667 0.09
668 0.1
669 0.12
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.14
674 0.16
675 0.21
676 0.23
677 0.25
678 0.27
679 0.32
680 0.35
681 0.37
682 0.37
683 0.37
684 0.35
685 0.31
686 0.31
687 0.27
688 0.25
689 0.27
690 0.3
691 0.3
692 0.32
693 0.33
694 0.32
695 0.32
696 0.33
697 0.27
698 0.23
699 0.17
700 0.14
701 0.12
702 0.11
703 0.09
704 0.06
705 0.05
706 0.04
707 0.04
708 0.03
709 0.03
710 0.03
711 0.03
712 0.03
713 0.03
714 0.04
715 0.04
716 0.05
717 0.05
718 0.06
719 0.07
720 0.09
721 0.11
722 0.11
723 0.13
724 0.14
725 0.15
726 0.16
727 0.16
728 0.17
729 0.16
730 0.17
731 0.15
732 0.16
733 0.19
734 0.18
735 0.19
736 0.17
737 0.18
738 0.18
739 0.19
740 0.23
741 0.22
742 0.23
743 0.22
744 0.25
745 0.28
746 0.28
747 0.29
748 0.26
749 0.27
750 0.29
751 0.33
752 0.32
753 0.3
754 0.33
755 0.31
756 0.3
757 0.27
758 0.29
759 0.26
760 0.24
761 0.22
762 0.17
763 0.17
764 0.21
765 0.22
766 0.18
767 0.18
768 0.17
769 0.17
770 0.21
771 0.21
772 0.16
773 0.17
774 0.2
775 0.24
776 0.25
777 0.26
778 0.27
779 0.28
780 0.28
781 0.31
782 0.31
783 0.27
784 0.26
785 0.25
786 0.22
787 0.22
788 0.22
789 0.16
790 0.16
791 0.16
792 0.21
793 0.23
794 0.27
795 0.27
796 0.3
797 0.36
798 0.39
799 0.38
800 0.41
801 0.44
802 0.41
803 0.41
804 0.38
805 0.32
806 0.3
807 0.28
808 0.21
809 0.16
810 0.16
811 0.16
812 0.21
813 0.22
814 0.2
815 0.21
816 0.22
817 0.24
818 0.23
819 0.21
820 0.18
821 0.18
822 0.18
823 0.16
824 0.18
825 0.16
826 0.18
827 0.2
828 0.19
829 0.19
830 0.23
831 0.31
832 0.36
833 0.46
834 0.52
835 0.57
836 0.64
837 0.7
838 0.71
839 0.73
840 0.74
841 0.73
842 0.74
843 0.76
844 0.69
845 0.65
846 0.6
847 0.53
848 0.45
849 0.36
850 0.3
851 0.23
852 0.22
853 0.19
854 0.18
855 0.17
856 0.16
857 0.15
858 0.13
859 0.12
860 0.11
861 0.16
862 0.21
863 0.22
864 0.23
865 0.3
866 0.36
867 0.42
868 0.47
869 0.52
870 0.56
871 0.61
872 0.63
873 0.57
874 0.51
875 0.45
876 0.42
877 0.35
878 0.27
879 0.19
880 0.16
881 0.15
882 0.17
883 0.16
884 0.15
885 0.12
886 0.1
887 0.11
888 0.16
889 0.17
890 0.16
891 0.16
892 0.2
893 0.24
894 0.26
895 0.33
896 0.28
897 0.34
898 0.4
899 0.44
900 0.44
901 0.42
902 0.4
903 0.33
904 0.33
905 0.31
906 0.25
907 0.25
908 0.26
909 0.26
910 0.25
911 0.25
912 0.28
913 0.26
914 0.32
915 0.34
916 0.32
917 0.33
918 0.33
919 0.34
920 0.34
921 0.37
922 0.33
923 0.3
924 0.3
925 0.35
926 0.37
927 0.4
928 0.41
929 0.45
930 0.5
931 0.51
932 0.53
933 0.53
934 0.55
935 0.56
936 0.61
937 0.54
938 0.47
939 0.48
940 0.48
941 0.44