Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8AMD8

Protein Details
Accession A0A1B8AMD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-119PSDERITKRAPRKKGQRKSKRPIHSAISBasic
283-310RIRGPKEVTKLLKKPRRTKKAIAAEAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-113TKRAPRKKGQRKSKRP
286-302GPKEVTKLLKKPRRTKK
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 10, cyto 4.5, plas 2, extr 2, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
Amino Acid Sequences MSQLPGPIPALYTVYVLRSSVRHASFYIGSTPAPPRRLKQHNGVATGGAVRTAKDKLRPWEAVIVISGFPSLIAALKFEWALTNPHLTSSIPSDERITKRAPRKKGQRKSKRPIHSAISIVSNLHLLTGVPTFARWPLTLHFFAEEIKKKWDTWLESKDAKLREGLRIETDYKPEGDSAESWGIHALPLNYAPLKPYVEKAHNIVSFEREGDCVHCHEPLQSGSGLHPICPHQGCEAMGHLECWGKYALQGEDEGVVVPLSCRCPSCDGNINWIDMMKELTLRIRGPKEVTKLLKKPRRTKKAIAAEAEAEEDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.14
6 0.18
7 0.25
8 0.26
9 0.25
10 0.25
11 0.3
12 0.3
13 0.3
14 0.29
15 0.22
16 0.21
17 0.22
18 0.29
19 0.31
20 0.35
21 0.36
22 0.38
23 0.47
24 0.56
25 0.58
26 0.6
27 0.64
28 0.65
29 0.66
30 0.62
31 0.52
32 0.44
33 0.39
34 0.29
35 0.21
36 0.14
37 0.11
38 0.12
39 0.15
40 0.18
41 0.24
42 0.3
43 0.35
44 0.43
45 0.45
46 0.45
47 0.48
48 0.45
49 0.39
50 0.33
51 0.28
52 0.2
53 0.18
54 0.15
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.11
69 0.12
70 0.16
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.2
78 0.17
79 0.18
80 0.2
81 0.26
82 0.28
83 0.3
84 0.3
85 0.33
86 0.43
87 0.5
88 0.55
89 0.59
90 0.68
91 0.76
92 0.82
93 0.86
94 0.87
95 0.9
96 0.92
97 0.92
98 0.91
99 0.85
100 0.8
101 0.74
102 0.67
103 0.58
104 0.49
105 0.41
106 0.31
107 0.26
108 0.2
109 0.15
110 0.11
111 0.08
112 0.07
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.15
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.15
131 0.19
132 0.22
133 0.19
134 0.22
135 0.23
136 0.22
137 0.24
138 0.28
139 0.27
140 0.3
141 0.32
142 0.33
143 0.34
144 0.35
145 0.37
146 0.33
147 0.29
148 0.26
149 0.23
150 0.22
151 0.23
152 0.23
153 0.2
154 0.21
155 0.24
156 0.22
157 0.22
158 0.18
159 0.17
160 0.17
161 0.15
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.07
174 0.05
175 0.06
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.15
184 0.19
185 0.22
186 0.24
187 0.25
188 0.31
189 0.3
190 0.31
191 0.28
192 0.25
193 0.22
194 0.22
195 0.2
196 0.13
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.16
206 0.15
207 0.16
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.19
212 0.18
213 0.15
214 0.17
215 0.16
216 0.21
217 0.21
218 0.22
219 0.17
220 0.2
221 0.2
222 0.19
223 0.2
224 0.17
225 0.16
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.1
233 0.11
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.21
252 0.23
253 0.29
254 0.36
255 0.35
256 0.42
257 0.43
258 0.42
259 0.36
260 0.35
261 0.29
262 0.2
263 0.2
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.14
268 0.17
269 0.19
270 0.26
271 0.27
272 0.31
273 0.36
274 0.42
275 0.45
276 0.5
277 0.57
278 0.59
279 0.65
280 0.72
281 0.75
282 0.78
283 0.82
284 0.85
285 0.87
286 0.85
287 0.86
288 0.86
289 0.89
290 0.86
291 0.81
292 0.74
293 0.66
294 0.58