Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YRX6

Protein Details
Accession C7YRX6    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-80LRFQPIRRPQAKQAKPKTAFPKHydrophilic
114-143LYGTGEKRQRGGRKKKKKRQQQAEIETNWDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-75KQAKPK
120-132KRQRGGRKKKKKR
346-373KRRKKADADGGGWAEPGGKGKIIGGKRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG nhe:NECHADRAFT_41503  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAAPPPPPPRGGLSLYENLLDPKDASSASTTISSAPVLYNQSDNNSSENTVKKAIDPALRFQPIRRPQAKQAKPKTAFPKPTAPKTTAPSAPPAPAQPKSTLADWAATEEDEWLYGTGEKRQRGGRKKKKKRQQQAEIETNWDDIYDPTRPTNVEEYLHSDEKVMEVREWKALLYRHRRKRDESDLSDDEEDARHVTSTQFAPPASYAAVPPPPRSPPAPPPDDATGDDAFARRSAMSQGQASQPPPPPSPPPASNSATISRAPVRYTQSEAPKDEGEDDAYSPPPALGGGSAVDDLERDSLPRSSRPGQAGFAHRLMSKYGWTKGTGLGADESGIVNPLRVQVEKRRKKADADGGGWAEPGGKGKIIGGKRKVEDTGKFGLMSDVIVLHNMLENMANLEEEIAEGLGQEIGEECGEKYGRVERLYIDQGSRKVFIKFTNQVSALRAVNELDGRVFNGNAIVPKFFSTEKFEKGLYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.39
3 0.38
4 0.33
5 0.29
6 0.26
7 0.22
8 0.16
9 0.13
10 0.14
11 0.13
12 0.13
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.14
19 0.16
20 0.14
21 0.12
22 0.12
23 0.14
24 0.15
25 0.17
26 0.18
27 0.19
28 0.23
29 0.26
30 0.26
31 0.25
32 0.24
33 0.25
34 0.27
35 0.3
36 0.28
37 0.3
38 0.29
39 0.28
40 0.32
41 0.36
42 0.37
43 0.36
44 0.39
45 0.44
46 0.48
47 0.47
48 0.44
49 0.49
50 0.5
51 0.58
52 0.58
53 0.56
54 0.61
55 0.71
56 0.78
57 0.78
58 0.8
59 0.8
60 0.78
61 0.81
62 0.8
63 0.79
64 0.78
65 0.72
66 0.72
67 0.69
68 0.75
69 0.71
70 0.66
71 0.61
72 0.58
73 0.6
74 0.54
75 0.48
76 0.45
77 0.42
78 0.4
79 0.36
80 0.37
81 0.36
82 0.34
83 0.36
84 0.32
85 0.34
86 0.34
87 0.33
88 0.31
89 0.26
90 0.25
91 0.22
92 0.21
93 0.18
94 0.15
95 0.14
96 0.12
97 0.11
98 0.08
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.09
103 0.1
104 0.16
105 0.22
106 0.23
107 0.27
108 0.34
109 0.42
110 0.51
111 0.62
112 0.66
113 0.72
114 0.82
115 0.89
116 0.92
117 0.94
118 0.94
119 0.94
120 0.94
121 0.93
122 0.92
123 0.9
124 0.8
125 0.73
126 0.62
127 0.52
128 0.4
129 0.29
130 0.2
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.17
139 0.21
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.24
144 0.28
145 0.29
146 0.26
147 0.23
148 0.2
149 0.2
150 0.22
151 0.16
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.2
160 0.28
161 0.36
162 0.45
163 0.53
164 0.63
165 0.67
166 0.69
167 0.74
168 0.76
169 0.74
170 0.69
171 0.67
172 0.59
173 0.58
174 0.52
175 0.43
176 0.33
177 0.23
178 0.18
179 0.1
180 0.09
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.09
196 0.14
197 0.14
198 0.16
199 0.18
200 0.19
201 0.21
202 0.23
203 0.25
204 0.29
205 0.35
206 0.37
207 0.35
208 0.36
209 0.37
210 0.36
211 0.32
212 0.27
213 0.2
214 0.17
215 0.17
216 0.14
217 0.12
218 0.1
219 0.09
220 0.06
221 0.06
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.15
228 0.17
229 0.17
230 0.2
231 0.22
232 0.24
233 0.24
234 0.25
235 0.25
236 0.27
237 0.31
238 0.3
239 0.28
240 0.31
241 0.32
242 0.31
243 0.31
244 0.29
245 0.26
246 0.24
247 0.23
248 0.2
249 0.18
250 0.18
251 0.19
252 0.21
253 0.21
254 0.25
255 0.28
256 0.33
257 0.36
258 0.36
259 0.35
260 0.31
261 0.3
262 0.27
263 0.22
264 0.16
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.07
288 0.1
289 0.12
290 0.14
291 0.19
292 0.22
293 0.27
294 0.31
295 0.31
296 0.31
297 0.35
298 0.38
299 0.36
300 0.33
301 0.3
302 0.27
303 0.26
304 0.24
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.22
309 0.22
310 0.22
311 0.23
312 0.23
313 0.25
314 0.21
315 0.18
316 0.15
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.09
321 0.07
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.15
330 0.24
331 0.35
332 0.45
333 0.52
334 0.56
335 0.58
336 0.61
337 0.67
338 0.66
339 0.63
340 0.56
341 0.54
342 0.48
343 0.45
344 0.4
345 0.31
346 0.22
347 0.14
348 0.14
349 0.1
350 0.08
351 0.08
352 0.1
353 0.17
354 0.22
355 0.3
356 0.34
357 0.4
358 0.42
359 0.45
360 0.47
361 0.46
362 0.44
363 0.41
364 0.4
365 0.35
366 0.33
367 0.3
368 0.27
369 0.21
370 0.18
371 0.13
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.06
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.13
406 0.19
407 0.24
408 0.24
409 0.26
410 0.24
411 0.3
412 0.35
413 0.35
414 0.33
415 0.33
416 0.36
417 0.38
418 0.39
419 0.34
420 0.32
421 0.32
422 0.33
423 0.37
424 0.4
425 0.42
426 0.47
427 0.46
428 0.46
429 0.46
430 0.46
431 0.38
432 0.32
433 0.27
434 0.2
435 0.22
436 0.21
437 0.18
438 0.16
439 0.15
440 0.16
441 0.17
442 0.16
443 0.13
444 0.14
445 0.15
446 0.18
447 0.19
448 0.18
449 0.17
450 0.19
451 0.22
452 0.21
453 0.23
454 0.27
455 0.31
456 0.35
457 0.37