FuNGI

A0A1B8AYM5

Protein Details

Accession

A0A1B8AYM5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-49	APPHPNGSSRNKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPAPR	Hydrophilic
182-208	APVAKDPNPKRPKKQKEDKTTFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-51	GSSRNKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPAPRPA
186-200	KDPNPKRPKKQKEDK
478-504	KGTNTPSGKKPESSKKGKSLKRAGSPA
514-519	SRKKLK

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPPPGNPPANAPPHPNGSSRNKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPAPRPAAPSGSGTQNGAKPNIEEIRRQNGGWSEPPPAAYSDIPIMTTKKALLDGIRYHMMKFTQSKVGDRSIDPADQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKVEAPEAPQPDEQEAERMAQVKAEKEAQRAIDQAKIAPVAKDPNPKRPKKQKEDKTTFNRAPKTEAAKKESDIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGNYVSALSESNVAFMIDQSVFRMVPLEKWYRFTSKPPFQPYTIDEAEALMNRKVTVARWAMKNAERIAEQDDKEETRKMFYGGGQMIKTESATFKAASRSEKLDHDDIDFSGDEFQDDDETPMFEKNNDDEDAKDAKDRIRREQLGANLFGDGDEQEVDKELKEKLDEEELRRELGKTTKKALIKRDQENIYESDDSAENPWSSSSEDNSSDEEEDEEKKEEEKKEAGKDDKAQSGSGSKGTNTPSGKKPESSKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKLKKNVTSAAASRSGTPLPQGAAARRAMGAGSGSDGEATAGEMSDGTMGKSKKLKLVSHSARGTPSASRAGSPNPQGAASPGSPGGSIVEPSEILDKIPPEGIAISELIKAFNHRLGDRPGQMPKSEWIQLVKRLCDYGNDKRLRRRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.49
3	0.53
4	0.54
5	0.51
6	0.5
7	0.53
8	0.61
9	0.62
10	0.68
11	0.65
12	0.72
13	0.79
14	0.81
15	0.81
16	0.81
17	0.84
18	0.84
19	0.9
20	0.91
21	0.91
22	0.89
23	0.89
24	0.89
25	0.87
26	0.84
27	0.83
28	0.84
29	0.83
30	0.81
31	0.76
32	0.74
33	0.72
34	0.7
35	0.69
36	0.64
37	0.61
38	0.61
39	0.57
40	0.53
41	0.48
42	0.47
43	0.4
44	0.36
45	0.33
46	0.31
47	0.33
48	0.3
49	0.28
50	0.24
51	0.3
52	0.35
53	0.33
54	0.36
55	0.38
56	0.45
57	0.46
58	0.45
59	0.43
60	0.4
61	0.42
62	0.4
63	0.37
64	0.32
65	0.31
66	0.32
67	0.28
68	0.26
69	0.24
70	0.2
71	0.19
72	0.19
73	0.18
74	0.18
75	0.19
76	0.19
77	0.17
78	0.18
79	0.17
80	0.15
81	0.16
82	0.17
83	0.17
84	0.22
85	0.24
86	0.27
87	0.32
88	0.31
89	0.3
90	0.32
91	0.3
92	0.29
93	0.3
94	0.29
95	0.32
96	0.33
97	0.37
98	0.38
99	0.42
100	0.4
101	0.37
102	0.37
103	0.32
104	0.32
105	0.28
106	0.26
107	0.22
108	0.2
109	0.2
110	0.18
111	0.15
112	0.14
113	0.15
114	0.12
115	0.17
116	0.25
117	0.31
118	0.36
119	0.4
120	0.47
121	0.52
122	0.62
123	0.64
124	0.65
125	0.64
126	0.63
127	0.68
128	0.66
129	0.61
130	0.54
131	0.52
132	0.47
133	0.45
134	0.41
135	0.33
136	0.32
137	0.33
138	0.33
139	0.31
140	0.26
141	0.24
142	0.23
143	0.23
144	0.19
145	0.18
146	0.17
147	0.15
148	0.15
149	0.16
150	0.14
151	0.16
152	0.17
153	0.16
154	0.18
155	0.24
156	0.25
157	0.26
158	0.29
159	0.29
160	0.29
161	0.3
162	0.29
163	0.25
164	0.23
165	0.22
166	0.19
167	0.2
168	0.18
169	0.16
170	0.17
171	0.18
172	0.22
173	0.32
174	0.33
175	0.42
176	0.52
177	0.58
178	0.67
179	0.73
180	0.79
181	0.8
182	0.88
183	0.87
184	0.89
185	0.91
186	0.9
187	0.88
188	0.87
189	0.82
190	0.79
191	0.74
192	0.64
193	0.6
194	0.56
195	0.56
196	0.54
197	0.53
198	0.51
199	0.47
200	0.47
201	0.52
202	0.49
203	0.43
204	0.38
205	0.35
206	0.32
207	0.31
208	0.31
209	0.24
210	0.23
211	0.2
212	0.17
213	0.15
214	0.13
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.12
221	0.13
222	0.13
223	0.13
224	0.14
225	0.11
226	0.08
227	0.09
228	0.09
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.07
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.09
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.1
248	0.08
249	0.1
250	0.16
251	0.21
252	0.21
253	0.25
254	0.28
255	0.3
256	0.32
257	0.36
258	0.4
259	0.43
260	0.49
261	0.53
262	0.53
263	0.49
264	0.51
265	0.47
266	0.44
267	0.36
268	0.3
269	0.22
270	0.2
271	0.19
272	0.17
273	0.17
274	0.1
275	0.09
276	0.09
277	0.1
278	0.09
279	0.09
280	0.14
281	0.17
282	0.2
283	0.22
284	0.24
285	0.27
286	0.3
287	0.33
288	0.28
289	0.25
290	0.21
291	0.21
292	0.24
293	0.25
294	0.22
295	0.19
296	0.2
297	0.19
298	0.21
299	0.22
300	0.18
301	0.15
302	0.15
303	0.14
304	0.14
305	0.13
306	0.17
307	0.16
308	0.18
309	0.16
310	0.16
311	0.15
312	0.14
313	0.13
314	0.09
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.1
320	0.13
321	0.15
322	0.17
323	0.18
324	0.19
325	0.21
326	0.22
327	0.25
328	0.23
329	0.22
330	0.21
331	0.2
332	0.16
333	0.16
334	0.14
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.09
352	0.12
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.16
357	0.18
358	0.17
359	0.17
360	0.15
361	0.18
362	0.23
363	0.25
364	0.28
365	0.35
366	0.37
367	0.38
368	0.41
369	0.43
370	0.41
371	0.4
372	0.32
373	0.23
374	0.21
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.19
392	0.22
393	0.24
394	0.3
395	0.3
396	0.3
397	0.3
398	0.28
399	0.22
400	0.27
401	0.31
402	0.27
403	0.31
404	0.36
405	0.4
406	0.45
407	0.51
408	0.54
409	0.54
410	0.57
411	0.6
412	0.57
413	0.54
414	0.52
415	0.45
416	0.39
417	0.31
418	0.26
419	0.19
420	0.17
421	0.15
422	0.14
423	0.14
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.14
432	0.15
433	0.17
434	0.18
435	0.19
436	0.18
437	0.17
438	0.16
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.15
443	0.14
444	0.15
445	0.21
446	0.21
447	0.24
448	0.27
449	0.31
450	0.35
451	0.42
452	0.44
453	0.43
454	0.48
455	0.48
456	0.48
457	0.44
458	0.38
459	0.32
460	0.31
461	0.28
462	0.24
463	0.2
464	0.16
465	0.18
466	0.2
467	0.26
468	0.26
469	0.3
470	0.33
471	0.41
472	0.43
473	0.43
474	0.49
475	0.53
476	0.6
477	0.64
478	0.65
479	0.67
480	0.75
481	0.76
482	0.78
483	0.77
484	0.76
485	0.75
486	0.73
487	0.66
488	0.6
489	0.56
490	0.48
491	0.41
492	0.33
493	0.25
494	0.21
495	0.23
496	0.22
497	0.21
498	0.22
499	0.22
500	0.27
501	0.36
502	0.42
503	0.4
504	0.47
505	0.57
506	0.63
507	0.7
508	0.72
509	0.69
510	0.68
511	0.65
512	0.61
513	0.55
514	0.45
515	0.37
516	0.32
517	0.26
518	0.21
519	0.2
520	0.17
521	0.13
522	0.17
523	0.18
524	0.18
525	0.22
526	0.22
527	0.22
528	0.2
529	0.19
530	0.15
531	0.14
532	0.12
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.08
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.05
547	0.06
548	0.07
549	0.07
550	0.12
551	0.13
552	0.18
553	0.23
554	0.26
555	0.3
556	0.37
557	0.41
558	0.42
559	0.53
560	0.56
561	0.6
562	0.62
563	0.58
564	0.53
565	0.5
566	0.46
567	0.37
568	0.33
569	0.3
570	0.27
571	0.25
572	0.26
573	0.3
574	0.34
575	0.36
576	0.36
577	0.3
578	0.3
579	0.29
580	0.28
581	0.28
582	0.21
583	0.2
584	0.17
585	0.16
586	0.16
587	0.16
588	0.16
589	0.12
590	0.12
591	0.1
592	0.11
593	0.11
594	0.12
595	0.14
596	0.12
597	0.12
598	0.14
599	0.14
600	0.14
601	0.16
602	0.14
603	0.13
604	0.13
605	0.13
606	0.12
607	0.12
608	0.12
609	0.13
610	0.13
611	0.13
612	0.13
613	0.16
614	0.17
615	0.2
616	0.24
617	0.23
618	0.28
619	0.34
620	0.42
621	0.43
622	0.47
623	0.51
624	0.5
625	0.5
626	0.48
627	0.45
628	0.43
629	0.42
630	0.39
631	0.38
632	0.4
633	0.46
634	0.5
635	0.49
636	0.45
637	0.44
638	0.41
639	0.43
640	0.45
641	0.48
642	0.51
643	0.57
644	0.6

A0A1B8AYM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer