Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8B4N2

Protein Details
Accession A0A1B8B4N2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-58SPSPSMSAKKPPPSAKQPPHSASHydrophilic
375-394HPKHSHAPPQPKTRKRTRAEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 10.833, mito 6.5, cyto_mito 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAPVGPVVQQNVAHKVKRPIPPGIQTNGAMTPSKSSPSPSMSAKKPPPSAKQPPHSASDRAITASSVRPVNRARRETASQLQGRHSRNSAGLRSASMVADQIAHDAQPRPYVVTDSYILNKFAGQPPSLIIHLHPTHFRFDNQDGMFSYKSPMKLFIEHIRARTVPHDLLPYFNEAGVLFYDGCLIVQIHDHKSLAQAKDVAKPKSAKGSAMLSSIHNYNQWLTPSPNVPFPQENLSTTDGKAKAGSTAEKENSPMPPPEDQKEKSKKPAVYTVVLHQTPESLQTDLFIKASTPHGTSDVSGQPPPTPMSLIPPTPTATSMPPPAKRQKREKTELDGSNIHEAEGQILLATNAPLTLEPTRTIEENIILLEAMSHPKHSHAPPQPKTRKRTRAELAAYEAQAAGAERFMLVADPRAASSANGAQNGGTADVDASTGASTFEPRFERFKVLDEIKAKHNEKKEQEKAKQQEADRKLQQQRAQQNEAVQNAQNAQKQAQEDRNRREAAAREASMRQAEQQRQAQAQAQAQAQAQQARAQAASQTTQANQNGQRLNGNQQRHAHPQNNAITNAVNTASVGTPQMANNMPSQVQPRFQAQISQPPASSPVARQGTPQHMSSPMVGSVPMQQTNSGMANSPPRPSSVVQNPAAMSVPMAHNMSSRGSQQSHPSGTPRMPHSTPNMTQGTPINRSAMIATPRMTQVSPPPAMMAQNSQPGQGIMMNNQGMNQQNPQFAQQLAQQRALQQQQQQQQQQLAAMQNSISNGNMSQMSPQQQQQMMQLMQRQLIAQQQQQQQQQQQGNMMSPQQQQQQQQIAAQYAQQMQNMSGNQMRQFPPQMQAQLQQMMRMNQMNGQVGNSPMQRQVSEQMMNGNNINMQAFQAMQQAQQQQAQQQQQQQQQQQQQQQQNQHQMGQMGQSIQAQIQQQARIAYQRMMSQAVIKHGSPDKFPPDLLQKIKSASMTQATGLVQQNFQRRQQAQQQQQQQMMMHQQQHQQQHQMQQMQQQQMQQQQMQQQQMQQQMQQQHLQQQQQMQGMNGMMGGQGGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.48
3 0.53
4 0.59
5 0.6
6 0.6
7 0.62
8 0.68
9 0.69
10 0.64
11 0.6
12 0.53
13 0.51
14 0.44
15 0.38
16 0.31
17 0.25
18 0.25
19 0.22
20 0.25
21 0.22
22 0.24
23 0.27
24 0.31
25 0.35
26 0.39
27 0.45
28 0.47
29 0.57
30 0.61
31 0.65
32 0.68
33 0.72
34 0.73
35 0.75
36 0.81
37 0.81
38 0.82
39 0.83
40 0.78
41 0.76
42 0.72
43 0.65
44 0.57
45 0.52
46 0.44
47 0.36
48 0.33
49 0.27
50 0.25
51 0.26
52 0.27
53 0.27
54 0.26
55 0.3
56 0.37
57 0.47
58 0.54
59 0.55
60 0.55
61 0.57
62 0.62
63 0.64
64 0.65
65 0.64
66 0.59
67 0.57
68 0.6
69 0.61
70 0.59
71 0.57
72 0.51
73 0.45
74 0.46
75 0.5
76 0.45
77 0.42
78 0.4
79 0.36
80 0.36
81 0.34
82 0.28
83 0.21
84 0.18
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.13
92 0.16
93 0.17
94 0.2
95 0.2
96 0.21
97 0.21
98 0.24
99 0.22
100 0.22
101 0.23
102 0.22
103 0.26
104 0.26
105 0.26
106 0.23
107 0.23
108 0.23
109 0.28
110 0.29
111 0.24
112 0.22
113 0.24
114 0.26
115 0.26
116 0.23
117 0.17
118 0.22
119 0.23
120 0.25
121 0.28
122 0.27
123 0.32
124 0.34
125 0.34
126 0.32
127 0.32
128 0.39
129 0.34
130 0.36
131 0.32
132 0.34
133 0.33
134 0.27
135 0.28
136 0.23
137 0.25
138 0.23
139 0.26
140 0.25
141 0.28
142 0.33
143 0.38
144 0.43
145 0.44
146 0.44
147 0.44
148 0.41
149 0.4
150 0.37
151 0.34
152 0.26
153 0.26
154 0.3
155 0.26
156 0.28
157 0.28
158 0.3
159 0.25
160 0.23
161 0.21
162 0.15
163 0.16
164 0.13
165 0.14
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.11
175 0.15
176 0.17
177 0.19
178 0.2
179 0.19
180 0.25
181 0.32
182 0.29
183 0.28
184 0.3
185 0.3
186 0.38
187 0.45
188 0.4
189 0.39
190 0.41
191 0.4
192 0.45
193 0.45
194 0.38
195 0.34
196 0.37
197 0.33
198 0.32
199 0.31
200 0.22
201 0.23
202 0.23
203 0.21
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.2
211 0.22
212 0.25
213 0.26
214 0.3
215 0.29
216 0.31
217 0.29
218 0.29
219 0.32
220 0.3
221 0.3
222 0.27
223 0.29
224 0.27
225 0.26
226 0.31
227 0.25
228 0.24
229 0.23
230 0.2
231 0.19
232 0.2
233 0.22
234 0.18
235 0.25
236 0.26
237 0.26
238 0.27
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.26
243 0.22
244 0.27
245 0.3
246 0.33
247 0.39
248 0.39
249 0.47
250 0.54
251 0.57
252 0.6
253 0.64
254 0.63
255 0.59
256 0.66
257 0.6
258 0.54
259 0.51
260 0.47
261 0.47
262 0.44
263 0.39
264 0.3
265 0.26
266 0.22
267 0.23
268 0.19
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.1
276 0.09
277 0.1
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.19
286 0.2
287 0.2
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.2
292 0.21
293 0.17
294 0.14
295 0.12
296 0.18
297 0.2
298 0.2
299 0.2
300 0.2
301 0.21
302 0.2
303 0.21
304 0.17
305 0.16
306 0.18
307 0.23
308 0.27
309 0.3
310 0.36
311 0.46
312 0.53
313 0.59
314 0.67
315 0.71
316 0.75
317 0.79
318 0.78
319 0.77
320 0.77
321 0.72
322 0.66
323 0.58
324 0.5
325 0.47
326 0.41
327 0.32
328 0.24
329 0.2
330 0.16
331 0.13
332 0.11
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.03
340 0.04
341 0.04
342 0.06
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.15
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.09
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.11
364 0.16
365 0.17
366 0.26
367 0.32
368 0.43
369 0.49
370 0.6
371 0.69
372 0.72
373 0.78
374 0.79
375 0.8
376 0.74
377 0.76
378 0.71
379 0.7
380 0.66
381 0.61
382 0.56
383 0.49
384 0.45
385 0.35
386 0.29
387 0.2
388 0.15
389 0.13
390 0.07
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.09
406 0.13
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.13
414 0.07
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.04
425 0.06
426 0.06
427 0.09
428 0.12
429 0.14
430 0.17
431 0.18
432 0.22
433 0.21
434 0.25
435 0.27
436 0.27
437 0.31
438 0.31
439 0.32
440 0.33
441 0.4
442 0.39
443 0.38
444 0.42
445 0.44
446 0.47
447 0.55
448 0.59
449 0.61
450 0.64
451 0.69
452 0.68
453 0.67
454 0.66
455 0.58
456 0.59
457 0.54
458 0.55
459 0.5
460 0.53
461 0.52
462 0.52
463 0.54
464 0.52
465 0.55
466 0.55
467 0.54
468 0.47
469 0.46
470 0.44
471 0.4
472 0.34
473 0.27
474 0.2
475 0.19
476 0.21
477 0.19
478 0.16
479 0.15
480 0.16
481 0.17
482 0.21
483 0.27
484 0.33
485 0.38
486 0.43
487 0.48
488 0.46
489 0.45
490 0.45
491 0.39
492 0.36
493 0.34
494 0.29
495 0.25
496 0.25
497 0.26
498 0.23
499 0.21
500 0.18
501 0.19
502 0.21
503 0.24
504 0.27
505 0.28
506 0.28
507 0.29
508 0.29
509 0.26
510 0.25
511 0.23
512 0.2
513 0.19
514 0.19
515 0.21
516 0.19
517 0.18
518 0.17
519 0.16
520 0.16
521 0.15
522 0.15
523 0.12
524 0.12
525 0.1
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.14
531 0.15
532 0.18
533 0.19
534 0.23
535 0.23
536 0.22
537 0.24
538 0.21
539 0.29
540 0.31
541 0.31
542 0.3
543 0.33
544 0.37
545 0.42
546 0.46
547 0.42
548 0.39
549 0.44
550 0.45
551 0.44
552 0.4
553 0.33
554 0.28
555 0.24
556 0.22
557 0.15
558 0.09
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.05
565 0.06
566 0.06
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.12
574 0.16
575 0.15
576 0.16
577 0.16
578 0.18
579 0.19
580 0.19
581 0.23
582 0.21
583 0.28
584 0.3
585 0.3
586 0.27
587 0.25
588 0.28
589 0.24
590 0.23
591 0.15
592 0.19
593 0.2
594 0.2
595 0.22
596 0.24
597 0.29
598 0.31
599 0.31
600 0.24
601 0.23
602 0.24
603 0.23
604 0.2
605 0.13
606 0.11
607 0.1
608 0.09
609 0.13
610 0.14
611 0.14
612 0.13
613 0.13
614 0.13
615 0.15
616 0.16
617 0.11
618 0.09
619 0.09
620 0.16
621 0.17
622 0.18
623 0.17
624 0.17
625 0.2
626 0.2
627 0.26
628 0.27
629 0.33
630 0.33
631 0.34
632 0.33
633 0.31
634 0.3
635 0.23
636 0.16
637 0.1
638 0.09
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.12
645 0.11
646 0.13
647 0.14
648 0.16
649 0.18
650 0.23
651 0.27
652 0.28
653 0.28
654 0.29
655 0.29
656 0.28
657 0.31
658 0.29
659 0.3
660 0.29
661 0.31
662 0.34
663 0.37
664 0.37
665 0.39
666 0.38
667 0.32
668 0.33
669 0.34
670 0.33
671 0.29
672 0.28
673 0.23
674 0.2
675 0.21
676 0.2
677 0.2
678 0.18
679 0.17
680 0.17
681 0.17
682 0.18
683 0.19
684 0.18
685 0.15
686 0.18
687 0.23
688 0.23
689 0.21
690 0.21
691 0.21
692 0.21
693 0.21
694 0.18
695 0.14
696 0.19
697 0.19
698 0.19
699 0.18
700 0.18
701 0.17
702 0.17
703 0.15
704 0.1
705 0.14
706 0.15
707 0.14
708 0.15
709 0.16
710 0.15
711 0.16
712 0.19
713 0.18
714 0.19
715 0.2
716 0.22
717 0.21
718 0.2
719 0.2
720 0.21
721 0.27
722 0.28
723 0.3
724 0.29
725 0.3
726 0.35
727 0.37
728 0.36
729 0.33
730 0.38
731 0.42
732 0.49
733 0.5
734 0.48
735 0.46
736 0.43
737 0.38
738 0.34
739 0.29
740 0.22
741 0.18
742 0.16
743 0.14
744 0.14
745 0.14
746 0.1
747 0.08
748 0.08
749 0.09
750 0.1
751 0.09
752 0.1
753 0.14
754 0.18
755 0.2
756 0.23
757 0.26
758 0.27
759 0.28
760 0.29
761 0.31
762 0.28
763 0.28
764 0.3
765 0.26
766 0.26
767 0.25
768 0.22
769 0.17
770 0.21
771 0.23
772 0.22
773 0.29
774 0.34
775 0.4
776 0.45
777 0.49
778 0.49
779 0.53
780 0.53
781 0.46
782 0.44
783 0.39
784 0.36
785 0.31
786 0.29
787 0.26
788 0.25
789 0.28
790 0.3
791 0.34
792 0.36
793 0.41
794 0.44
795 0.4
796 0.4
797 0.37
798 0.33
799 0.28
800 0.26
801 0.23
802 0.22
803 0.22
804 0.21
805 0.2
806 0.19
807 0.23
808 0.22
809 0.21
810 0.19
811 0.2
812 0.2
813 0.26
814 0.27
815 0.27
816 0.3
817 0.29
818 0.31
819 0.33
820 0.35
821 0.31
822 0.33
823 0.33
824 0.36
825 0.34
826 0.33
827 0.32
828 0.3
829 0.31
830 0.29
831 0.26
832 0.23
833 0.27
834 0.26
835 0.23
836 0.22
837 0.2
838 0.19
839 0.23
840 0.21
841 0.19
842 0.19
843 0.21
844 0.2
845 0.21
846 0.24
847 0.25
848 0.26
849 0.24
850 0.28
851 0.29
852 0.3
853 0.29
854 0.25
855 0.2
856 0.19
857 0.19
858 0.12
859 0.1
860 0.09
861 0.08
862 0.09
863 0.13
864 0.13
865 0.14
866 0.19
867 0.22
868 0.23
869 0.26
870 0.27
871 0.27
872 0.35
873 0.4
874 0.4
875 0.44
876 0.5
877 0.54
878 0.61
879 0.63
880 0.64
881 0.66
882 0.69
883 0.7
884 0.71
885 0.72
886 0.71
887 0.74
888 0.74
889 0.75
890 0.69
891 0.63
892 0.56
893 0.48
894 0.42
895 0.35
896 0.29
897 0.2
898 0.19
899 0.17
900 0.15
901 0.14
902 0.17
903 0.16
904 0.19
905 0.22
906 0.23
907 0.24
908 0.25
909 0.26
910 0.27
911 0.28
912 0.26
913 0.24
914 0.26
915 0.26
916 0.26
917 0.25
918 0.26
919 0.26
920 0.29
921 0.3
922 0.26
923 0.3
924 0.34
925 0.36
926 0.34
927 0.38
928 0.38
929 0.37
930 0.37
931 0.37
932 0.39
933 0.45
934 0.47
935 0.44
936 0.41
937 0.42
938 0.44
939 0.41
940 0.34
941 0.31
942 0.3
943 0.27
944 0.25
945 0.25
946 0.23
947 0.27
948 0.3
949 0.27
950 0.26
951 0.3
952 0.39
953 0.41
954 0.45
955 0.48
956 0.45
957 0.51
958 0.58
959 0.64
960 0.65
961 0.69
962 0.75
963 0.72
964 0.74
965 0.69
966 0.6
967 0.54
968 0.52
969 0.49
970 0.45
971 0.44
972 0.47
973 0.5
974 0.58
975 0.58
976 0.58
977 0.56
978 0.59
979 0.61
980 0.62
981 0.58
982 0.57
983 0.6
984 0.59
985 0.57
986 0.53
987 0.51
988 0.52
989 0.55
990 0.49
991 0.47
992 0.48
993 0.52
994 0.53
995 0.5
996 0.49
997 0.49
998 0.55
999 0.53
1000 0.48
1001 0.48
1002 0.48
1003 0.5
1004 0.5
1005 0.47
1006 0.48
1007 0.52
1008 0.53
1009 0.51
1010 0.51
1011 0.52
1012 0.51
1013 0.49
1014 0.41
1015 0.36
1016 0.31
1017 0.27
1018 0.21
1019 0.15
1020 0.1