Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8ABW4

Protein Details
Accession A0A1B8ABW4    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-126DESEKWDKRLKKKAARRDNNAFAHydrophilic
214-233RAEEQRLKKRKERMAQNGDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-119KRLKKKAAR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MAPGTPTKDSTVANDAAQQSASDNASKAQDRMARFKALQARAKTSSEKNLQEATLESQRLATDPSQLTALHRKHAIASHKLLKADVEESGGDFERKRAWDWTVDESEKWDKRLKKKAARRDNNAFADFTQEANKVYKRQLKNIDMNVEKYEKDKQALIEKAAASGGLDIVETEDGELIAIDKDGSFYSTADSTTFTQNKPDKAAVDRLVADLQRAEEQRLKKRKERMAQNGDDGDVTYINEKNKQFNQKLSRFYNQYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.26
4 0.25
5 0.21
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.14
10 0.13
11 0.15
12 0.19
13 0.21
14 0.2
15 0.24
16 0.27
17 0.3
18 0.38
19 0.39
20 0.4
21 0.39
22 0.45
23 0.48
24 0.51
25 0.54
26 0.51
27 0.54
28 0.52
29 0.55
30 0.54
31 0.5
32 0.5
33 0.51
34 0.49
35 0.46
36 0.45
37 0.41
38 0.37
39 0.34
40 0.3
41 0.28
42 0.25
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.19
47 0.2
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.2
55 0.27
56 0.28
57 0.25
58 0.25
59 0.25
60 0.26
61 0.31
62 0.34
63 0.31
64 0.36
65 0.4
66 0.41
67 0.41
68 0.39
69 0.34
70 0.29
71 0.25
72 0.19
73 0.13
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.12
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.22
87 0.25
88 0.29
89 0.3
90 0.3
91 0.28
92 0.3
93 0.35
94 0.31
95 0.31
96 0.32
97 0.33
98 0.41
99 0.52
100 0.58
101 0.6
102 0.68
103 0.76
104 0.81
105 0.83
106 0.83
107 0.81
108 0.8
109 0.74
110 0.66
111 0.56
112 0.44
113 0.4
114 0.32
115 0.24
116 0.18
117 0.13
118 0.13
119 0.15
120 0.17
121 0.14
122 0.19
123 0.27
124 0.27
125 0.33
126 0.41
127 0.44
128 0.5
129 0.51
130 0.52
131 0.46
132 0.45
133 0.4
134 0.34
135 0.28
136 0.23
137 0.24
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.25
143 0.27
144 0.26
145 0.25
146 0.23
147 0.22
148 0.2
149 0.18
150 0.1
151 0.08
152 0.07
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.11
179 0.11
180 0.18
181 0.21
182 0.2
183 0.28
184 0.32
185 0.34
186 0.36
187 0.36
188 0.31
189 0.33
190 0.39
191 0.33
192 0.32
193 0.31
194 0.28
195 0.28
196 0.26
197 0.23
198 0.16
199 0.15
200 0.17
201 0.17
202 0.19
203 0.23
204 0.29
205 0.39
206 0.48
207 0.53
208 0.56
209 0.65
210 0.71
211 0.75
212 0.79
213 0.8
214 0.8
215 0.78
216 0.77
217 0.69
218 0.6
219 0.5
220 0.4
221 0.3
222 0.2
223 0.16
224 0.12
225 0.14
226 0.15
227 0.22
228 0.23
229 0.29
230 0.37
231 0.47
232 0.49
233 0.56
234 0.64
235 0.65
236 0.72
237 0.72
238 0.72
239 0.67
240 0.65
241 0.64
242 0.57
243 0.55
244 0.5
245 0.48
246 0.43
247 0.39
248 0.38
249 0.33
250 0.32
251 0.27