Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YMQ2

Protein Details
Accession C7YMQ2    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-34ASTTDKVLPKRQKTKVTGPPDDEHydrophilic
118-140EFETKKPAKRSSKQSAVKKEAKDHydrophilic
464-484ERTGKKQHAAAKKKQIKDEDSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-127KR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10.5, cyto_mito 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG nhe:NECHADRAFT_77955  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MTTRTLRKRAAASTTDKVLPKRQKTKVTGPPDDEAEELPHNLGPVRPSRRNHQEDATSTKVTDGTVGHVKLENGSPEAKPLVDPMVKPPSTDGEAVTRRSLRPRRSAAKSSYLESDDEFETKKPAKRSSKQSAVKKEAKDEYEDAEVVPEIPARKPVKKTKDNPYGLTPGITPFPDWTAPSAEECEEVYRRLASIHGEAKAPDKIPAPSLEVSGCGEVPSVLDALIRTRLSANTSNRNSSAAFRGLVNAFGTVDEGIGKGSVDWNKVRTAPLTTIVEAIKTGGLAQVKGKDIKAILELVHEENVKRRDAFIQERKSGKMSGAFKADGKTQGQKDLEILKTEQDILSLDHIHGMHPDEAMQTLTKFPGIGVKTASCVILFCLQQPSFAVDTHVHRLTGWLKWMPPKATRDQTFSHLEVRIPNHLKYGLHKLFVQHGRNCIRCRANTSEGSEEWNNEECPLEGLVERTGKKQHAAAKKKQIKDEDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.56
3 0.55
4 0.52
5 0.54
6 0.58
7 0.61
8 0.66
9 0.69
10 0.74
11 0.77
12 0.84
13 0.84
14 0.84
15 0.82
16 0.77
17 0.72
18 0.65
19 0.59
20 0.49
21 0.4
22 0.34
23 0.27
24 0.23
25 0.2
26 0.17
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.23
32 0.31
33 0.38
34 0.42
35 0.52
36 0.62
37 0.67
38 0.68
39 0.66
40 0.65
41 0.62
42 0.67
43 0.62
44 0.52
45 0.45
46 0.41
47 0.35
48 0.27
49 0.24
50 0.16
51 0.16
52 0.22
53 0.22
54 0.22
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.25
59 0.22
60 0.17
61 0.2
62 0.18
63 0.19
64 0.2
65 0.18
66 0.15
67 0.15
68 0.2
69 0.2
70 0.21
71 0.25
72 0.34
73 0.33
74 0.33
75 0.33
76 0.31
77 0.31
78 0.31
79 0.26
80 0.25
81 0.29
82 0.31
83 0.34
84 0.32
85 0.31
86 0.41
87 0.48
88 0.46
89 0.52
90 0.59
91 0.64
92 0.69
93 0.75
94 0.71
95 0.72
96 0.67
97 0.6
98 0.55
99 0.48
100 0.4
101 0.33
102 0.3
103 0.21
104 0.2
105 0.19
106 0.15
107 0.18
108 0.23
109 0.27
110 0.3
111 0.38
112 0.48
113 0.55
114 0.65
115 0.7
116 0.75
117 0.79
118 0.83
119 0.83
120 0.82
121 0.81
122 0.73
123 0.7
124 0.66
125 0.59
126 0.54
127 0.45
128 0.38
129 0.33
130 0.31
131 0.24
132 0.18
133 0.16
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.08
138 0.09
139 0.17
140 0.2
141 0.26
142 0.33
143 0.42
144 0.51
145 0.6
146 0.67
147 0.7
148 0.77
149 0.76
150 0.71
151 0.67
152 0.61
153 0.51
154 0.44
155 0.33
156 0.24
157 0.21
158 0.18
159 0.13
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.13
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.17
186 0.19
187 0.2
188 0.19
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.13
218 0.2
219 0.23
220 0.29
221 0.31
222 0.33
223 0.33
224 0.33
225 0.3
226 0.25
227 0.24
228 0.17
229 0.15
230 0.13
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.06
248 0.08
249 0.11
250 0.12
251 0.13
252 0.15
253 0.16
254 0.17
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.18
262 0.17
263 0.16
264 0.13
265 0.12
266 0.08
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.09
273 0.11
274 0.13
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.12
285 0.11
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.16
290 0.19
291 0.19
292 0.18
293 0.18
294 0.2
295 0.25
296 0.35
297 0.39
298 0.44
299 0.48
300 0.51
301 0.51
302 0.49
303 0.44
304 0.36
305 0.34
306 0.29
307 0.27
308 0.28
309 0.28
310 0.27
311 0.28
312 0.29
313 0.25
314 0.24
315 0.27
316 0.25
317 0.31
318 0.3
319 0.29
320 0.29
321 0.31
322 0.3
323 0.26
324 0.25
325 0.2
326 0.2
327 0.21
328 0.18
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.12
333 0.11
334 0.1
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.14
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.17
357 0.17
358 0.18
359 0.19
360 0.19
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.14
365 0.14
366 0.14
367 0.21
368 0.21
369 0.21
370 0.22
371 0.24
372 0.21
373 0.21
374 0.22
375 0.17
376 0.22
377 0.27
378 0.28
379 0.23
380 0.22
381 0.26
382 0.26
383 0.25
384 0.26
385 0.23
386 0.25
387 0.33
388 0.39
389 0.4
390 0.43
391 0.47
392 0.5
393 0.57
394 0.58
395 0.56
396 0.53
397 0.54
398 0.53
399 0.49
400 0.45
401 0.37
402 0.35
403 0.35
404 0.35
405 0.4
406 0.38
407 0.36
408 0.35
409 0.36
410 0.36
411 0.35
412 0.43
413 0.37
414 0.36
415 0.36
416 0.35
417 0.42
418 0.49
419 0.52
420 0.45
421 0.5
422 0.56
423 0.61
424 0.62
425 0.61
426 0.6
427 0.56
428 0.59
429 0.59
430 0.58
431 0.57
432 0.59
433 0.56
434 0.49
435 0.52
436 0.47
437 0.4
438 0.36
439 0.34
440 0.29
441 0.24
442 0.24
443 0.18
444 0.18
445 0.17
446 0.15
447 0.12
448 0.13
449 0.17
450 0.22
451 0.23
452 0.25
453 0.31
454 0.32
455 0.34
456 0.38
457 0.43
458 0.48
459 0.56
460 0.62
461 0.68
462 0.75
463 0.79
464 0.82
465 0.81