Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8A5P3

Protein Details
Accession A0A1B8A5P3    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-59RYKNVCYNCIRRKIKCDKHHPSCTHCSGHydrophilic
66-90YERTVRRNSTSRKAKDRRRGGTKGNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-86SRKAKDRRRGG
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences SPQLQLLVARFNPVTDPGFNTISPSREGNNMRYKNVCYNCIRRKIKCDKHHPSCTHCSGIGLECTYERTVRRNSTSRKAKDRRRGGTKGNIWSESEDDCVMELKRKRLNWEEISKHVPDRSTSACRQRYQYLVRERGEKGAPSSDKWLPEEDTRVRELREKGIKWEDISKRLPGRSATACRLHYQNYLIRRKGRDEEHKNKLAIRYERHKPLRASSSLNTDFGEPNRALAQVQGWSGFPRINMLPGFRELINGVSPYSAPAGAPNFGNCPITTTGSRRPGSRGEYRQPVSRRAATAAPASQPCDFRLPHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.19
3 0.23
4 0.24
5 0.26
6 0.26
7 0.29
8 0.29
9 0.28
10 0.29
11 0.27
12 0.24
13 0.3
14 0.34
15 0.37
16 0.45
17 0.46
18 0.48
19 0.5
20 0.52
21 0.54
22 0.55
23 0.53
24 0.5
25 0.57
26 0.62
27 0.69
28 0.73
29 0.69
30 0.74
31 0.78
32 0.81
33 0.81
34 0.83
35 0.83
36 0.86
37 0.91
38 0.86
39 0.83
40 0.81
41 0.76
42 0.68
43 0.57
44 0.48
45 0.39
46 0.36
47 0.31
48 0.23
49 0.18
50 0.15
51 0.17
52 0.17
53 0.18
54 0.17
55 0.2
56 0.26
57 0.32
58 0.39
59 0.45
60 0.51
61 0.59
62 0.68
63 0.7
64 0.75
65 0.78
66 0.81
67 0.83
68 0.86
69 0.85
70 0.84
71 0.82
72 0.78
73 0.79
74 0.76
75 0.74
76 0.68
77 0.59
78 0.51
79 0.46
80 0.41
81 0.31
82 0.25
83 0.17
84 0.12
85 0.11
86 0.12
87 0.11
88 0.16
89 0.18
90 0.22
91 0.28
92 0.29
93 0.35
94 0.4
95 0.48
96 0.49
97 0.55
98 0.53
99 0.52
100 0.55
101 0.5
102 0.45
103 0.38
104 0.31
105 0.23
106 0.23
107 0.24
108 0.26
109 0.3
110 0.38
111 0.42
112 0.44
113 0.46
114 0.45
115 0.47
116 0.46
117 0.49
118 0.48
119 0.49
120 0.49
121 0.5
122 0.47
123 0.45
124 0.41
125 0.33
126 0.26
127 0.25
128 0.25
129 0.21
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.24
134 0.24
135 0.2
136 0.2
137 0.24
138 0.22
139 0.22
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.25
144 0.25
145 0.27
146 0.31
147 0.29
148 0.32
149 0.36
150 0.36
151 0.32
152 0.39
153 0.34
154 0.33
155 0.35
156 0.34
157 0.33
158 0.33
159 0.34
160 0.26
161 0.28
162 0.29
163 0.31
164 0.32
165 0.33
166 0.34
167 0.34
168 0.35
169 0.33
170 0.29
171 0.28
172 0.27
173 0.31
174 0.37
175 0.39
176 0.42
177 0.43
178 0.45
179 0.47
180 0.51
181 0.53
182 0.56
183 0.62
184 0.65
185 0.68
186 0.64
187 0.61
188 0.57
189 0.54
190 0.5
191 0.47
192 0.46
193 0.48
194 0.57
195 0.6
196 0.62
197 0.56
198 0.57
199 0.58
200 0.53
201 0.51
202 0.44
203 0.47
204 0.43
205 0.42
206 0.35
207 0.3
208 0.29
209 0.24
210 0.26
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.11
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.15
229 0.16
230 0.17
231 0.18
232 0.19
233 0.22
234 0.18
235 0.19
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.14
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.08
247 0.11
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.17
254 0.19
255 0.16
256 0.18
257 0.19
258 0.22
259 0.24
260 0.28
261 0.35
262 0.42
263 0.45
264 0.42
265 0.44
266 0.47
267 0.5
268 0.55
269 0.55
270 0.55
271 0.63
272 0.64
273 0.69
274 0.66
275 0.67
276 0.64
277 0.61
278 0.55
279 0.48
280 0.48
281 0.43
282 0.44
283 0.4
284 0.39
285 0.36
286 0.36
287 0.36
288 0.35
289 0.34
290 0.34