Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8B5H1

Protein Details
Accession A0A1B8B5H1    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-187HDPEERRRKNNDNRSRYRERDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-175RK
182-182R
184-184R
191-198RGDGGRRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDLDIEMDDAVDTVQDLPITDIGRDDILQPDELEEPGEVAEDELVTDDSKSLVPTKIHIKGVDSLHTNDIKAYVKSHFGDVERVEWIDDSSANLLFPSEPTARDAIVALSSVPVADATALAVGETLPAKPFESKPEISLQVRFAVSSDKKEVGAALRSRYYLLHPEHDPEERRRKNNDNRSRYRERDGGYRGDGGRRRRASDDDVETFEASMYDDAPRPARRRRDSDIEERPRSYVRENQGKELFVGRKKQRDRSASPRRDGDNDDLMSERASSSRNRSRARDLRDRISSGNNSKELFPTKKSIKQFGGGNLDTLEQAIGSARLKDEDRPKIVSVPGARGDGSSFNIRGMANQRGDGDGFTIKGAAGANARELFPTKLGGNNAGKELFGGGRSKQRQKAEDLFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.07
4 0.09
5 0.12
6 0.13
7 0.12
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.17
16 0.17
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.12
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.07
26 0.06
27 0.07
28 0.05
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.12
39 0.16
40 0.16
41 0.2
42 0.28
43 0.34
44 0.37
45 0.36
46 0.36
47 0.38
48 0.41
49 0.42
50 0.37
51 0.33
52 0.35
53 0.35
54 0.32
55 0.26
56 0.26
57 0.24
58 0.21
59 0.21
60 0.18
61 0.22
62 0.23
63 0.25
64 0.25
65 0.23
66 0.28
67 0.26
68 0.26
69 0.22
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.15
74 0.11
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.08
116 0.11
117 0.12
118 0.17
119 0.23
120 0.24
121 0.25
122 0.3
123 0.33
124 0.32
125 0.33
126 0.29
127 0.26
128 0.25
129 0.23
130 0.18
131 0.21
132 0.21
133 0.22
134 0.24
135 0.21
136 0.22
137 0.22
138 0.22
139 0.17
140 0.22
141 0.2
142 0.2
143 0.2
144 0.21
145 0.21
146 0.21
147 0.2
148 0.21
149 0.21
150 0.23
151 0.22
152 0.24
153 0.26
154 0.3
155 0.31
156 0.32
157 0.41
158 0.43
159 0.47
160 0.51
161 0.59
162 0.65
163 0.72
164 0.75
165 0.75
166 0.77
167 0.81
168 0.83
169 0.76
170 0.71
171 0.65
172 0.57
173 0.54
174 0.49
175 0.43
176 0.37
177 0.36
178 0.32
179 0.32
180 0.35
181 0.32
182 0.37
183 0.35
184 0.36
185 0.35
186 0.38
187 0.36
188 0.38
189 0.38
190 0.31
191 0.31
192 0.3
193 0.27
194 0.24
195 0.19
196 0.13
197 0.08
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.11
204 0.15
205 0.19
206 0.26
207 0.35
208 0.4
209 0.46
210 0.51
211 0.57
212 0.59
213 0.64
214 0.68
215 0.68
216 0.66
217 0.6
218 0.55
219 0.47
220 0.43
221 0.37
222 0.33
223 0.31
224 0.38
225 0.38
226 0.43
227 0.44
228 0.42
229 0.4
230 0.39
231 0.36
232 0.3
233 0.38
234 0.37
235 0.43
236 0.48
237 0.56
238 0.59
239 0.62
240 0.66
241 0.68
242 0.74
243 0.73
244 0.73
245 0.7
246 0.64
247 0.6
248 0.56
249 0.5
250 0.46
251 0.38
252 0.34
253 0.29
254 0.26
255 0.23
256 0.19
257 0.14
258 0.08
259 0.09
260 0.11
261 0.19
262 0.27
263 0.35
264 0.4
265 0.44
266 0.53
267 0.6
268 0.65
269 0.67
270 0.65
271 0.65
272 0.65
273 0.63
274 0.55
275 0.54
276 0.52
277 0.47
278 0.47
279 0.42
280 0.38
281 0.36
282 0.38
283 0.38
284 0.35
285 0.32
286 0.35
287 0.38
288 0.44
289 0.48
290 0.51
291 0.48
292 0.49
293 0.5
294 0.49
295 0.51
296 0.44
297 0.4
298 0.33
299 0.31
300 0.26
301 0.22
302 0.15
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.11
311 0.13
312 0.19
313 0.28
314 0.35
315 0.38
316 0.41
317 0.42
318 0.43
319 0.43
320 0.42
321 0.36
322 0.33
323 0.32
324 0.3
325 0.28
326 0.25
327 0.25
328 0.21
329 0.22
330 0.21
331 0.18
332 0.17
333 0.19
334 0.19
335 0.21
336 0.24
337 0.29
338 0.26
339 0.28
340 0.28
341 0.28
342 0.28
343 0.24
344 0.22
345 0.16
346 0.14
347 0.12
348 0.12
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.16
356 0.17
357 0.17
358 0.17
359 0.19
360 0.19
361 0.18
362 0.2
363 0.17
364 0.21
365 0.23
366 0.3
367 0.33
368 0.33
369 0.35
370 0.33
371 0.31
372 0.27
373 0.27
374 0.2
375 0.17
376 0.18
377 0.18
378 0.28
379 0.37
380 0.46
381 0.51
382 0.58
383 0.6
384 0.66