Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0WDD3

Protein Details
Accession G0WDD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-23DGQRSRPDDRRSYRSKPSNDHydrophilic
40-59NDNGYRRDDRRNDKRYDDHRBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ndi:NDAI_0G00180  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd21605  RRM1_HRB1_GBP2  
cd21606  RRM2_HRB1_GBP2  
cd21607  RRM3_HRB1_GBP2  
Amino Acid Sequences MSDDGQRSRPDDRRSYRSKPSNDSYVSSSRYDRPDRGYRNDNGYRRDDRRNDKRYDDHRGYHGSRDTGRFQRSGGRGRMDRRSDKGDYGPVLARELDSTYEEKVNRNYSNSIFVGNLTYDCTPEDLREYFSGIGEVVRADIITSKGHHRGMGTVEFTNSKDVEDAIRQYDGSYFLDRQIFVRQDNPPPDGGRSSRRSDESISSSRGYQDKSSSSYDRAPSTRQPNRQGYKVFIANLPFSINWQALKDMFKEFGDVLRADIELDSRGRSRGFGTVILREKSAMEKAIATLNGTEMEGRRIDVKEGYSNRQDPSDYKYGNDYRNDINTAPNHDQSRMDVDEDNQMPNIETEQNPVGARAIPTQPSYAPPILKNSTFTENVTGSGERNHLIYCNNLPASTARSDLYDLFESIGRISNAELKYNDKGEPTSEAVVEYINLEDADVCIERLNGYNYGGCELQISYGKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.76
3 0.79
4 0.8
5 0.8
6 0.78
7 0.77
8 0.76
9 0.71
10 0.67
11 0.62
12 0.59
13 0.54
14 0.48
15 0.46
16 0.42
17 0.47
18 0.5
19 0.49
20 0.5
21 0.57
22 0.61
23 0.65
24 0.67
25 0.64
26 0.68
27 0.72
28 0.7
29 0.66
30 0.66
31 0.67
32 0.65
33 0.7
34 0.69
35 0.71
36 0.76
37 0.78
38 0.77
39 0.76
40 0.8
41 0.78
42 0.79
43 0.75
44 0.69
45 0.66
46 0.68
47 0.63
48 0.6
49 0.57
50 0.51
51 0.49
52 0.48
53 0.5
54 0.49
55 0.5
56 0.44
57 0.4
58 0.44
59 0.46
60 0.5
61 0.48
62 0.49
63 0.51
64 0.56
65 0.64
66 0.64
67 0.64
68 0.6
69 0.62
70 0.57
71 0.55
72 0.53
73 0.49
74 0.42
75 0.4
76 0.38
77 0.31
78 0.29
79 0.26
80 0.22
81 0.17
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.19
88 0.2
89 0.22
90 0.26
91 0.32
92 0.32
93 0.34
94 0.35
95 0.32
96 0.37
97 0.34
98 0.3
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.16
103 0.15
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.15
112 0.13
113 0.16
114 0.16
115 0.18
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.12
120 0.11
121 0.08
122 0.07
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.14
132 0.18
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.2
137 0.23
138 0.25
139 0.23
140 0.19
141 0.19
142 0.19
143 0.2
144 0.2
145 0.16
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.13
161 0.15
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.23
169 0.24
170 0.29
171 0.32
172 0.32
173 0.28
174 0.28
175 0.28
176 0.26
177 0.26
178 0.27
179 0.28
180 0.31
181 0.32
182 0.33
183 0.34
184 0.33
185 0.35
186 0.34
187 0.32
188 0.31
189 0.28
190 0.27
191 0.27
192 0.27
193 0.24
194 0.2
195 0.19
196 0.18
197 0.21
198 0.25
199 0.24
200 0.24
201 0.27
202 0.28
203 0.28
204 0.27
205 0.27
206 0.3
207 0.38
208 0.42
209 0.45
210 0.5
211 0.57
212 0.58
213 0.6
214 0.55
215 0.48
216 0.45
217 0.4
218 0.33
219 0.26
220 0.24
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.11
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.13
257 0.13
258 0.16
259 0.17
260 0.23
261 0.27
262 0.27
263 0.26
264 0.23
265 0.22
266 0.2
267 0.2
268 0.15
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.21
290 0.24
291 0.28
292 0.31
293 0.33
294 0.33
295 0.32
296 0.32
297 0.26
298 0.29
299 0.33
300 0.28
301 0.26
302 0.32
303 0.36
304 0.4
305 0.41
306 0.37
307 0.32
308 0.35
309 0.36
310 0.29
311 0.29
312 0.26
313 0.31
314 0.31
315 0.33
316 0.31
317 0.3
318 0.31
319 0.27
320 0.3
321 0.25
322 0.23
323 0.19
324 0.19
325 0.25
326 0.26
327 0.25
328 0.19
329 0.18
330 0.17
331 0.16
332 0.17
333 0.13
334 0.12
335 0.14
336 0.15
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.14
342 0.15
343 0.16
344 0.18
345 0.18
346 0.19
347 0.21
348 0.21
349 0.21
350 0.26
351 0.25
352 0.25
353 0.24
354 0.3
355 0.32
356 0.33
357 0.34
358 0.32
359 0.33
360 0.32
361 0.32
362 0.29
363 0.26
364 0.26
365 0.25
366 0.22
367 0.17
368 0.19
369 0.19
370 0.15
371 0.16
372 0.15
373 0.14
374 0.14
375 0.17
376 0.17
377 0.23
378 0.23
379 0.22
380 0.22
381 0.22
382 0.26
383 0.24
384 0.22
385 0.16
386 0.17
387 0.19
388 0.19
389 0.22
390 0.2
391 0.18
392 0.18
393 0.19
394 0.18
395 0.17
396 0.2
397 0.15
398 0.14
399 0.15
400 0.21
401 0.21
402 0.25
403 0.25
404 0.25
405 0.3
406 0.32
407 0.33
408 0.28
409 0.28
410 0.25
411 0.29
412 0.28
413 0.25
414 0.23
415 0.22
416 0.2
417 0.19
418 0.17
419 0.13
420 0.1
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.13
433 0.17
434 0.15
435 0.17
436 0.2
437 0.2
438 0.22
439 0.21
440 0.18
441 0.17
442 0.15
443 0.17
444 0.21