Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YM49

Protein Details
Accession C7YM49    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-66AARAIRKKLKYGNVHRQIRAHydrophilic
204-226FGGSKDKKKEKDKAKGKRKPFNLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-223KDKKKEKDKAKGKRKP
382-386PRSKP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR004152  GAT_dom  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR038425  GAT_sf  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
KEGG nhe:NECHADRAFT_77760  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50909  GAT  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MFQQKPYSAVTVTIENLTSESYEEEDLSGIPELVEVIKLQASGPGEAARAIRKKLKYGNVHRQIRALVILDGLIQNAGERFQRTFVDEPLLERLRVCGTSQLSDIAVRNKCRELFRGWTQYAGTPGLDKIARLHKELPKRKQAVTQERSKVLRETEENPFVDDEQEEAAKAARQAASSSHAPPTAAESFSHAHTKSSSGSGSFFGGSKDKKKEKDKAKGKRKPFNLEAEKETMKVVIADSSFAATNLMNALQSINREVERISENPAAVERFEACKLLRRKVLRYIHHVEEEQWLGGLLHANDELVHALMSFEQFDRSIDADSDSDDELAEQAHLYRMATIKGKEAMAKAANAQSPTGSQPPDLSELIISHSPTHAAPPRPAPRSKPAHSAPPPPPPQPPRPVAAPVVTNMDDDEDDDDPFGDKHELDTPGVERDQPRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.17
4 0.15
5 0.13
6 0.11
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.08
20 0.07
21 0.08
22 0.06
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.11
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.15
34 0.17
35 0.21
36 0.24
37 0.28
38 0.34
39 0.36
40 0.43
41 0.5
42 0.58
43 0.61
44 0.67
45 0.74
46 0.77
47 0.82
48 0.76
49 0.71
50 0.62
51 0.53
52 0.45
53 0.35
54 0.25
55 0.17
56 0.15
57 0.13
58 0.12
59 0.1
60 0.08
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.11
68 0.14
69 0.15
70 0.19
71 0.22
72 0.22
73 0.26
74 0.24
75 0.25
76 0.31
77 0.31
78 0.27
79 0.25
80 0.25
81 0.21
82 0.22
83 0.2
84 0.18
85 0.18
86 0.2
87 0.21
88 0.2
89 0.18
90 0.2
91 0.21
92 0.23
93 0.26
94 0.27
95 0.29
96 0.32
97 0.35
98 0.36
99 0.38
100 0.36
101 0.38
102 0.44
103 0.5
104 0.46
105 0.44
106 0.42
107 0.4
108 0.37
109 0.3
110 0.22
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.22
118 0.23
119 0.26
120 0.33
121 0.36
122 0.46
123 0.56
124 0.6
125 0.62
126 0.65
127 0.64
128 0.64
129 0.68
130 0.69
131 0.66
132 0.67
133 0.62
134 0.63
135 0.63
136 0.57
137 0.49
138 0.4
139 0.38
140 0.32
141 0.31
142 0.32
143 0.36
144 0.34
145 0.32
146 0.31
147 0.26
148 0.23
149 0.19
150 0.13
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.17
167 0.16
168 0.16
169 0.15
170 0.19
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.17
177 0.21
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.14
183 0.15
184 0.14
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.12
193 0.14
194 0.19
195 0.26
196 0.31
197 0.38
198 0.45
199 0.53
200 0.59
201 0.68
202 0.72
203 0.75
204 0.81
205 0.82
206 0.84
207 0.83
208 0.8
209 0.77
210 0.71
211 0.71
212 0.67
213 0.61
214 0.55
215 0.51
216 0.45
217 0.38
218 0.33
219 0.23
220 0.15
221 0.12
222 0.1
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.13
247 0.13
248 0.17
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.19
253 0.17
254 0.14
255 0.14
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.19
262 0.23
263 0.28
264 0.33
265 0.34
266 0.38
267 0.46
268 0.55
269 0.52
270 0.56
271 0.57
272 0.55
273 0.54
274 0.5
275 0.42
276 0.37
277 0.32
278 0.24
279 0.17
280 0.13
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.1
306 0.12
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.09
323 0.1
324 0.13
325 0.17
326 0.17
327 0.2
328 0.22
329 0.23
330 0.24
331 0.24
332 0.26
333 0.24
334 0.24
335 0.23
336 0.25
337 0.26
338 0.24
339 0.23
340 0.19
341 0.18
342 0.21
343 0.22
344 0.19
345 0.17
346 0.18
347 0.2
348 0.24
349 0.22
350 0.19
351 0.16
352 0.15
353 0.18
354 0.19
355 0.17
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.14
360 0.21
361 0.24
362 0.26
363 0.3
364 0.39
365 0.47
366 0.52
367 0.57
368 0.56
369 0.59
370 0.64
371 0.65
372 0.65
373 0.6
374 0.65
375 0.66
376 0.69
377 0.66
378 0.68
379 0.69
380 0.63
381 0.68
382 0.65
383 0.68
384 0.67
385 0.64
386 0.58
387 0.57
388 0.58
389 0.52
390 0.48
391 0.41
392 0.34
393 0.37
394 0.33
395 0.28
396 0.24
397 0.22
398 0.18
399 0.17
400 0.18
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.13
408 0.12
409 0.11
410 0.14
411 0.2
412 0.22
413 0.21
414 0.25
415 0.24
416 0.27
417 0.28
418 0.3