Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7ZA47

Protein Details
Accession C7ZA47    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-56ADADEKARLKKEKKERKEKKRKTEEEAAEASBasic
65-94AERAAEKERKKAKKEKKKEKKLKAAEAEVEBasic
103-130VSEEAPKEKKSKKDKKKSKSSSVSNGDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-48KKTKIADADEKARLKKEKKERKEKKRKT
66-87ERAAEKERKKAKKEKKKEKKLK
108-121PKEKKSKKDKKKSK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.333, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000464  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 upstream of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG nhe:NECHADRAFT_43102  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd00268  DEADc  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MAATKHLLAESEENGVDRPSKKTKIADADEKARLKKEKKERKEKKRKTEEEAAEASAEKAEDSEAERAAEKERKKAKKEKKKEKKLKAAEAEVEESTEQNGDVSEEAPKEKKSKKDKKKSKSSSVSNGDASGKGAYSQTISLSSVPQADIDNFLSTNQIVITDPKSETVSLRPVLEFSHLPATNLLEKKPSPFANYKTPTPIQAASWPFTLSARDVIGVAETGSGKTMAFALPCVEAVSAIGGKSTKAVIVSPTRELAMQTHTQMAQVAALNGLKCVCLFGGASKDDQRAQLRRGADIIVATPGRLKDFMSDDTVDLSQAAFVVLDEADRMLDKGFEEDIKQILGSCPPREQRQTLMFTATWPQSVQALASSFMVSPVKITIGSSGKETAGGAVELQANARISQSVEVLEPREKEFRLLQLLKEHQQGKQKNDRILVFCLYKKEATRVENFLSRKGVRVCGIHGDLRQEQRTKSLEAFKTGVTPVLVATDVAARGLDIPEVKLVINVTFPLTIEDYVHRIGRTGRAGKTGQAITFFTVEDKSHSGSLVNILRGANQPVPEDLLKFGTTVKKKAHDMYGAFFKDVDMNQKATKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.22
4 0.21
5 0.27
6 0.31
7 0.37
8 0.42
9 0.47
10 0.55
11 0.6
12 0.65
13 0.68
14 0.67
15 0.69
16 0.72
17 0.72
18 0.66
19 0.63
20 0.64
21 0.6
22 0.63
23 0.66
24 0.69
25 0.75
26 0.83
27 0.87
28 0.9
29 0.95
30 0.96
31 0.96
32 0.96
33 0.93
34 0.91
35 0.9
36 0.85
37 0.82
38 0.74
39 0.64
40 0.53
41 0.45
42 0.37
43 0.27
44 0.2
45 0.12
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.22
56 0.28
57 0.27
58 0.34
59 0.44
60 0.52
61 0.6
62 0.7
63 0.75
64 0.79
65 0.88
66 0.9
67 0.92
68 0.94
69 0.96
70 0.96
71 0.96
72 0.95
73 0.94
74 0.91
75 0.86
76 0.8
77 0.73
78 0.65
79 0.53
80 0.45
81 0.34
82 0.26
83 0.2
84 0.14
85 0.1
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.1
92 0.11
93 0.14
94 0.17
95 0.2
96 0.27
97 0.33
98 0.42
99 0.5
100 0.6
101 0.68
102 0.77
103 0.85
104 0.88
105 0.93
106 0.94
107 0.93
108 0.92
109 0.9
110 0.88
111 0.84
112 0.78
113 0.67
114 0.6
115 0.5
116 0.4
117 0.33
118 0.23
119 0.16
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.21
157 0.2
158 0.21
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.2
163 0.17
164 0.14
165 0.21
166 0.19
167 0.2
168 0.2
169 0.22
170 0.26
171 0.27
172 0.25
173 0.21
174 0.21
175 0.24
176 0.29
177 0.28
178 0.27
179 0.31
180 0.35
181 0.41
182 0.45
183 0.45
184 0.45
185 0.45
186 0.41
187 0.39
188 0.35
189 0.26
190 0.29
191 0.29
192 0.24
193 0.24
194 0.22
195 0.19
196 0.19
197 0.18
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.09
237 0.14
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.12
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.18
275 0.22
276 0.22
277 0.23
278 0.26
279 0.24
280 0.23
281 0.23
282 0.2
283 0.16
284 0.13
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.12
303 0.1
304 0.08
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.03
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.12
332 0.14
333 0.14
334 0.19
335 0.22
336 0.26
337 0.3
338 0.31
339 0.32
340 0.36
341 0.39
342 0.35
343 0.35
344 0.3
345 0.28
346 0.3
347 0.25
348 0.19
349 0.14
350 0.14
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.1
369 0.12
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.14
374 0.15
375 0.14
376 0.1
377 0.08
378 0.08
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.08
393 0.09
394 0.1
395 0.12
396 0.14
397 0.15
398 0.17
399 0.2
400 0.19
401 0.21
402 0.22
403 0.23
404 0.29
405 0.3
406 0.29
407 0.33
408 0.38
409 0.38
410 0.43
411 0.41
412 0.36
413 0.44
414 0.48
415 0.48
416 0.54
417 0.57
418 0.55
419 0.59
420 0.59
421 0.53
422 0.51
423 0.47
424 0.4
425 0.36
426 0.35
427 0.32
428 0.31
429 0.29
430 0.31
431 0.32
432 0.33
433 0.36
434 0.37
435 0.38
436 0.42
437 0.41
438 0.39
439 0.4
440 0.36
441 0.37
442 0.35
443 0.35
444 0.31
445 0.32
446 0.31
447 0.3
448 0.33
449 0.31
450 0.29
451 0.31
452 0.33
453 0.37
454 0.4
455 0.37
456 0.35
457 0.38
458 0.4
459 0.37
460 0.37
461 0.41
462 0.38
463 0.39
464 0.4
465 0.34
466 0.34
467 0.31
468 0.28
469 0.19
470 0.16
471 0.12
472 0.12
473 0.11
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.06
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.11
495 0.1
496 0.1
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.14
501 0.15
502 0.16
503 0.18
504 0.21
505 0.18
506 0.18
507 0.2
508 0.24
509 0.31
510 0.34
511 0.34
512 0.38
513 0.39
514 0.4
515 0.45
516 0.42
517 0.34
518 0.31
519 0.3
520 0.26
521 0.26
522 0.23
523 0.18
524 0.17
525 0.16
526 0.17
527 0.18
528 0.18
529 0.18
530 0.18
531 0.17
532 0.16
533 0.23
534 0.24
535 0.23
536 0.23
537 0.22
538 0.24
539 0.27
540 0.3
541 0.26
542 0.24
543 0.24
544 0.23
545 0.27
546 0.26
547 0.24
548 0.22
549 0.21
550 0.2
551 0.19
552 0.22
553 0.27
554 0.3
555 0.35
556 0.41
557 0.44
558 0.49
559 0.55
560 0.58
561 0.56
562 0.54
563 0.54
564 0.57
565 0.52
566 0.48
567 0.42
568 0.35
569 0.32
570 0.31
571 0.32
572 0.26
573 0.28
574 0.29
575 0.33
576 0.34