Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YY80

Protein Details
Accession C7YY80    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-39RAAKVQKNGRTEQRQQKRKREQEDLQQLEQHydrophilic
421-442IQRVNVKEKKKKNIKDHLQSMCHydrophilic
523-542LDGKKKSKKNEVRTKYDRMFBasic
612-638VDSKRREKALKSKKKMAKFKGNSTKLVHydrophilic
683-711VDDKALAKQKRREKKEKRKAAERAERMGFBasic
744-786SSEEEREPPKKRAKKWFEDDSEDEEKKSRKKGKGKGKVIEMDQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
423-432RVNVKEKKKK
615-631KRREKALKSKKKMAKFK
689-705AKQKRREKKEKRKAAER
751-758PPKKRAKK
768-780EKKSRKKGKGKGK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG nhe:NECHADRAFT_95387  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17941  DEADc_DDX10  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MAPSARNSGRAAKVQKNGRTEQRQQKRKREQEDLQQLEQRVIDLDPKSDAIKNFSHLPLSVPTASGLEASHFQVLTDVQAQAIPLALKGNDVLGAAKTGSGKTLAFLIPVLEKLYRAQWTEYDGLGALILSPTRELAVQIFEVLRKVGRNHVFSAGLVIGGKSLKEEAERLDRMNILVCTPGRMLQHLDQTAGFDANNLQILVLDEADRIMDMGFQSAVDALVEHLPKSRQTLMFSATQSKKVSDLARLSLKDPEYVSVHEAAASATPTTLQQHYISTPLTEKLDTLYGFIKANLKSKIIVFLSSGKQVRFVYESFRHLQPGIPLLHLHGRQKQIARMEITSRFTAAKHSCLFATDVVARGIDFPAVDWVIQADCPEDVDTYIHRVGRTARYQSNGRAVLFLDPSEEPGMLKKLEQKKIPIQRVNVKEKKKKNIKDHLQSMCFQNPDLKYLGQKAFISYAKSIYIQKDKDVFKFDKLDLDGFAASLGLPGTPQIKFQKGDDIKRIKNAPRAGMSSDSESDEDLDGKKKSKKNEVRTKYDRMFERTNQDVLSSHYTKLVIDGDDKKGEDDEEGDFLSVKRVLRDDDLDEASKDAYKSTAKIIEGLGGEEPFIVDSKRREKALKSKKKMAKFKGNSTKLVFDEDGNAHAVYELQDEDDFRQEGPAEEQRRKFVEDESTRVKEADVDDKALAKQKRREKKEKRKAAERAERMGFVDDEDAPMLQAVDDGHDPLEFMRSLPIAGEDSSSEEEREPPKKRAKKWFEDDSEDEEKKSRKKGKGKGKVIEMDQEPETLEDLEALATGLLDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.69
3 0.68
4 0.7
5 0.72
6 0.74
7 0.76
8 0.78
9 0.8
10 0.83
11 0.86
12 0.9
13 0.91
14 0.91
15 0.9
16 0.89
17 0.87
18 0.87
19 0.88
20 0.84
21 0.79
22 0.74
23 0.66
24 0.58
25 0.49
26 0.39
27 0.29
28 0.23
29 0.23
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.2
34 0.22
35 0.25
36 0.26
37 0.25
38 0.26
39 0.28
40 0.32
41 0.32
42 0.32
43 0.28
44 0.29
45 0.27
46 0.3
47 0.27
48 0.22
49 0.21
50 0.19
51 0.19
52 0.17
53 0.14
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.15
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.12
70 0.1
71 0.07
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.12
96 0.13
97 0.15
98 0.11
99 0.12
100 0.13
101 0.18
102 0.2
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.26
107 0.28
108 0.26
109 0.22
110 0.18
111 0.16
112 0.14
113 0.12
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.23
135 0.28
136 0.31
137 0.33
138 0.36
139 0.36
140 0.33
141 0.34
142 0.25
143 0.18
144 0.15
145 0.12
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.11
154 0.14
155 0.22
156 0.23
157 0.24
158 0.26
159 0.25
160 0.25
161 0.27
162 0.23
163 0.15
164 0.18
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.2
169 0.17
170 0.18
171 0.22
172 0.22
173 0.29
174 0.28
175 0.28
176 0.24
177 0.25
178 0.24
179 0.2
180 0.16
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.09
186 0.07
187 0.07
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.13
214 0.14
215 0.18
216 0.22
217 0.21
218 0.24
219 0.27
220 0.27
221 0.31
222 0.31
223 0.36
224 0.33
225 0.35
226 0.33
227 0.31
228 0.3
229 0.29
230 0.3
231 0.27
232 0.28
233 0.27
234 0.32
235 0.33
236 0.33
237 0.33
238 0.32
239 0.28
240 0.26
241 0.23
242 0.2
243 0.2
244 0.2
245 0.17
246 0.16
247 0.14
248 0.13
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.07
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.17
279 0.16
280 0.21
281 0.22
282 0.22
283 0.21
284 0.21
285 0.26
286 0.21
287 0.2
288 0.17
289 0.19
290 0.2
291 0.25
292 0.26
293 0.21
294 0.24
295 0.23
296 0.23
297 0.21
298 0.2
299 0.21
300 0.23
301 0.27
302 0.27
303 0.28
304 0.28
305 0.25
306 0.26
307 0.21
308 0.22
309 0.19
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.2
314 0.21
315 0.23
316 0.23
317 0.25
318 0.28
319 0.3
320 0.32
321 0.31
322 0.32
323 0.31
324 0.27
325 0.28
326 0.28
327 0.29
328 0.25
329 0.23
330 0.19
331 0.17
332 0.23
333 0.21
334 0.22
335 0.2
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.21
340 0.14
341 0.15
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.06
350 0.05
351 0.04
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.09
369 0.11
370 0.12
371 0.11
372 0.12
373 0.15
374 0.2
375 0.24
376 0.25
377 0.26
378 0.28
379 0.3
380 0.32
381 0.36
382 0.32
383 0.28
384 0.24
385 0.22
386 0.2
387 0.18
388 0.16
389 0.11
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.09
394 0.07
395 0.08
396 0.1
397 0.08
398 0.09
399 0.15
400 0.23
401 0.28
402 0.3
403 0.34
404 0.41
405 0.5
406 0.58
407 0.55
408 0.51
409 0.54
410 0.6
411 0.66
412 0.65
413 0.65
414 0.65
415 0.68
416 0.74
417 0.76
418 0.76
419 0.76
420 0.8
421 0.81
422 0.81
423 0.82
424 0.79
425 0.71
426 0.64
427 0.58
428 0.5
429 0.4
430 0.31
431 0.28
432 0.21
433 0.21
434 0.21
435 0.18
436 0.16
437 0.21
438 0.22
439 0.19
440 0.19
441 0.18
442 0.2
443 0.21
444 0.21
445 0.17
446 0.16
447 0.15
448 0.16
449 0.18
450 0.19
451 0.24
452 0.22
453 0.25
454 0.3
455 0.32
456 0.33
457 0.37
458 0.34
459 0.31
460 0.34
461 0.32
462 0.29
463 0.28
464 0.26
465 0.2
466 0.2
467 0.16
468 0.12
469 0.12
470 0.07
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.03
475 0.03
476 0.04
477 0.06
478 0.06
479 0.1
480 0.13
481 0.17
482 0.18
483 0.19
484 0.29
485 0.32
486 0.37
487 0.42
488 0.47
489 0.45
490 0.5
491 0.55
492 0.49
493 0.52
494 0.5
495 0.45
496 0.41
497 0.41
498 0.38
499 0.36
500 0.32
501 0.27
502 0.25
503 0.22
504 0.19
505 0.16
506 0.15
507 0.12
508 0.12
509 0.1
510 0.13
511 0.13
512 0.18
513 0.25
514 0.28
515 0.34
516 0.44
517 0.52
518 0.6
519 0.7
520 0.73
521 0.76
522 0.79
523 0.82
524 0.75
525 0.72
526 0.66
527 0.61
528 0.59
529 0.53
530 0.52
531 0.47
532 0.43
533 0.37
534 0.33
535 0.27
536 0.25
537 0.29
538 0.24
539 0.21
540 0.21
541 0.21
542 0.2
543 0.21
544 0.19
545 0.13
546 0.16
547 0.19
548 0.21
549 0.23
550 0.23
551 0.22
552 0.21
553 0.2
554 0.15
555 0.13
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.12
566 0.13
567 0.15
568 0.17
569 0.2
570 0.2
571 0.22
572 0.24
573 0.23
574 0.22
575 0.21
576 0.18
577 0.17
578 0.15
579 0.11
580 0.11
581 0.12
582 0.13
583 0.16
584 0.21
585 0.19
586 0.21
587 0.2
588 0.22
589 0.2
590 0.2
591 0.17
592 0.12
593 0.12
594 0.1
595 0.1
596 0.06
597 0.07
598 0.06
599 0.08
600 0.14
601 0.22
602 0.26
603 0.29
604 0.32
605 0.39
606 0.5
607 0.58
608 0.64
609 0.65
610 0.71
611 0.76
612 0.83
613 0.86
614 0.85
615 0.85
616 0.81
617 0.83
618 0.84
619 0.81
620 0.76
621 0.7
622 0.65
623 0.54
624 0.52
625 0.42
626 0.31
627 0.31
628 0.26
629 0.24
630 0.21
631 0.2
632 0.14
633 0.14
634 0.13
635 0.09
636 0.1
637 0.09
638 0.08
639 0.08
640 0.1
641 0.11
642 0.14
643 0.14
644 0.13
645 0.14
646 0.14
647 0.15
648 0.19
649 0.26
650 0.28
651 0.35
652 0.38
653 0.41
654 0.44
655 0.45
656 0.41
657 0.37
658 0.41
659 0.39
660 0.43
661 0.46
662 0.46
663 0.44
664 0.43
665 0.39
666 0.32
667 0.3
668 0.31
669 0.25
670 0.25
671 0.25
672 0.27
673 0.29
674 0.33
675 0.35
676 0.35
677 0.41
678 0.48
679 0.58
680 0.67
681 0.76
682 0.8
683 0.87
684 0.9
685 0.93
686 0.92
687 0.92
688 0.92
689 0.92
690 0.91
691 0.86
692 0.83
693 0.75
694 0.67
695 0.58
696 0.51
697 0.4
698 0.3
699 0.25
700 0.18
701 0.16
702 0.15
703 0.13
704 0.1
705 0.1
706 0.09
707 0.06
708 0.07
709 0.06
710 0.08
711 0.08
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.09
717 0.12
718 0.1
719 0.1
720 0.12
721 0.12
722 0.12
723 0.13
724 0.14
725 0.12
726 0.13
727 0.13
728 0.11
729 0.14
730 0.18
731 0.18
732 0.18
733 0.17
734 0.22
735 0.28
736 0.36
737 0.38
738 0.43
739 0.53
740 0.61
741 0.7
742 0.76
743 0.79
744 0.81
745 0.85
746 0.87
747 0.83
748 0.83
749 0.78
750 0.74
751 0.72
752 0.62
753 0.54
754 0.5
755 0.49
756 0.47
757 0.53
758 0.54
759 0.56
760 0.65
761 0.74
762 0.79
763 0.84
764 0.88
765 0.86
766 0.86
767 0.84
768 0.77
769 0.75
770 0.66
771 0.59
772 0.5
773 0.42
774 0.33
775 0.26
776 0.25
777 0.17
778 0.14
779 0.1
780 0.1
781 0.09
782 0.08
783 0.07
784 0.06