Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8APB5

Protein Details
Accession A0A1B8APB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-257EVDRDERRRSPSRSRSRSRSRSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-153RKLRRRGR
241-257RRRSPSRSRSRSRSRSP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSRDKDTVHADARRFLDERGSNVSVAPNGLNPATIMEKAVRDRIVDSIYYKMQCFACNEADIVDRVVEDVKFIGGTYGTTQVPSPFLCLAFKLLELSPSDAVLLEYLKFGGEAFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYEMLEPFLEDRRKLRRRGREGVKLSYVDEFVDDLLTKERVCGTSLWKMPKREVLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEEEDEAEKENRTREESGETSEGDVMEVDRDERRRSPSRSRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.36
3 0.38
4 0.34
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.32
9 0.31
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.2
29 0.21
30 0.23
31 0.23
32 0.21
33 0.2
34 0.2
35 0.23
36 0.24
37 0.23
38 0.24
39 0.23
40 0.24
41 0.25
42 0.25
43 0.23
44 0.23
45 0.23
46 0.2
47 0.2
48 0.18
49 0.16
50 0.12
51 0.09
52 0.08
53 0.1
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.07
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.06
98 0.05
99 0.07
100 0.08
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.14
112 0.13
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.15
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.15
132 0.26
133 0.31
134 0.4
135 0.48
136 0.54
137 0.61
138 0.7
139 0.75
140 0.75
141 0.74
142 0.7
143 0.65
144 0.55
145 0.48
146 0.39
147 0.31
148 0.2
149 0.16
150 0.11
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.22
165 0.27
166 0.36
167 0.4
168 0.41
169 0.43
170 0.48
171 0.48
172 0.43
173 0.42
174 0.38
175 0.36
176 0.34
177 0.33
178 0.28
179 0.24
180 0.21
181 0.18
182 0.12
183 0.1
184 0.11
185 0.09
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.13
205 0.17
206 0.19
207 0.23
208 0.25
209 0.24
210 0.3
211 0.3
212 0.34
213 0.32
214 0.3
215 0.27
216 0.26
217 0.24
218 0.17
219 0.15
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.14
225 0.17
226 0.22
227 0.26
228 0.34
229 0.41
230 0.48
231 0.58
232 0.64
233 0.72
234 0.78
235 0.84
236 0.86
237 0.89