Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0WD39

Protein Details
Accession G0WD39    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-362PSIFLNRKRGPPRTNSKSPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-234RKRVNKGNQERLKKG
331-360VKSPLRKRGRDQPSIFLNRKRGPPRTNSKS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ndi:NDAI_0F03820  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MKTLFELAKLSLMRNINVLEDIGDVPFRLIADVLNIVSKEQLNKLEERSLFLVFEDDELWLKFIQKYYPTHVHEQFVSKKDTIIHYYMNFIRKNHPDILPMGSLEDSNMKELIDSFFKDLIKKDIKKNKYRVPYRMLYFKYLNDDIKKQERSAEKLRLQMNQLKTEREQNKTIEVGSVYIPRDSSRNYRKPVFTNVGSSKILNRTLQEESQRLRKLNEERKRVNKGNQERLKKGIIRTPVSRRAFGGGVGVGVGVGIGSGHIEEVNQLRPVSSKFQKPEPSSSSIRSSHDCDTTPREQNDRSVRPNSGSSSLSPSGPSPSTQDTIKRGSAVKSPLRKRGRDQPSIFLNRKRGPPRTNSKSPENPPNIPVIPSPPRRERIKDRTNTASSIEEASKRKLSLKDYLKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.22
4 0.21
5 0.2
6 0.15
7 0.14
8 0.14
9 0.12
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.1
14 0.09
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.09
19 0.1
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.14
25 0.16
26 0.17
27 0.19
28 0.25
29 0.25
30 0.29
31 0.32
32 0.37
33 0.36
34 0.37
35 0.36
36 0.31
37 0.28
38 0.25
39 0.23
40 0.16
41 0.16
42 0.12
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.11
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.19
52 0.23
53 0.27
54 0.34
55 0.43
56 0.45
57 0.51
58 0.53
59 0.51
60 0.48
61 0.52
62 0.51
63 0.46
64 0.46
65 0.38
66 0.36
67 0.37
68 0.38
69 0.36
70 0.31
71 0.31
72 0.27
73 0.32
74 0.34
75 0.38
76 0.36
77 0.33
78 0.38
79 0.39
80 0.44
81 0.43
82 0.41
83 0.37
84 0.36
85 0.39
86 0.32
87 0.27
88 0.23
89 0.18
90 0.16
91 0.14
92 0.15
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.12
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.17
104 0.18
105 0.19
106 0.2
107 0.26
108 0.32
109 0.36
110 0.43
111 0.5
112 0.59
113 0.67
114 0.74
115 0.75
116 0.76
117 0.79
118 0.77
119 0.74
120 0.72
121 0.66
122 0.66
123 0.6
124 0.54
125 0.48
126 0.43
127 0.41
128 0.38
129 0.38
130 0.32
131 0.33
132 0.33
133 0.39
134 0.4
135 0.34
136 0.37
137 0.37
138 0.41
139 0.45
140 0.49
141 0.44
142 0.49
143 0.51
144 0.48
145 0.47
146 0.47
147 0.43
148 0.43
149 0.41
150 0.37
151 0.36
152 0.42
153 0.44
154 0.42
155 0.41
156 0.34
157 0.36
158 0.33
159 0.32
160 0.24
161 0.19
162 0.16
163 0.13
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.13
170 0.14
171 0.22
172 0.29
173 0.36
174 0.4
175 0.45
176 0.48
177 0.5
178 0.54
179 0.51
180 0.42
181 0.41
182 0.39
183 0.38
184 0.35
185 0.32
186 0.27
187 0.25
188 0.26
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.19
193 0.22
194 0.22
195 0.22
196 0.22
197 0.29
198 0.31
199 0.29
200 0.27
201 0.31
202 0.38
203 0.45
204 0.51
205 0.53
206 0.57
207 0.64
208 0.71
209 0.7
210 0.68
211 0.67
212 0.68
213 0.7
214 0.71
215 0.69
216 0.63
217 0.62
218 0.59
219 0.53
220 0.46
221 0.4
222 0.39
223 0.37
224 0.4
225 0.44
226 0.49
227 0.48
228 0.47
229 0.43
230 0.38
231 0.35
232 0.29
233 0.23
234 0.13
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.01
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.04
251 0.06
252 0.08
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.15
258 0.21
259 0.24
260 0.29
261 0.31
262 0.39
263 0.47
264 0.49
265 0.55
266 0.52
267 0.53
268 0.5
269 0.5
270 0.49
271 0.44
272 0.43
273 0.38
274 0.37
275 0.34
276 0.34
277 0.32
278 0.3
279 0.33
280 0.38
281 0.42
282 0.41
283 0.42
284 0.4
285 0.47
286 0.53
287 0.53
288 0.52
289 0.49
290 0.48
291 0.46
292 0.48
293 0.43
294 0.37
295 0.32
296 0.27
297 0.3
298 0.29
299 0.27
300 0.25
301 0.22
302 0.23
303 0.22
304 0.22
305 0.18
306 0.21
307 0.23
308 0.24
309 0.29
310 0.29
311 0.33
312 0.33
313 0.32
314 0.31
315 0.31
316 0.35
317 0.38
318 0.42
319 0.47
320 0.52
321 0.6
322 0.66
323 0.68
324 0.68
325 0.71
326 0.72
327 0.73
328 0.7
329 0.68
330 0.7
331 0.74
332 0.74
333 0.7
334 0.69
335 0.65
336 0.7
337 0.71
338 0.7
339 0.67
340 0.72
341 0.76
342 0.76
343 0.8
344 0.77
345 0.78
346 0.79
347 0.79
348 0.8
349 0.76
350 0.7
351 0.62
352 0.63
353 0.55
354 0.47
355 0.42
356 0.39
357 0.41
358 0.45
359 0.51
360 0.52
361 0.58
362 0.63
363 0.7
364 0.73
365 0.75
366 0.78
367 0.78
368 0.77
369 0.8
370 0.77
371 0.7
372 0.62
373 0.54
374 0.45
375 0.4
376 0.37
377 0.34
378 0.34
379 0.37
380 0.39
381 0.37
382 0.42
383 0.44
384 0.45
385 0.49