Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8GD39

Protein Details
Accession A0A1B8GD39    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-67PSSVRTISSRRNNPPQKTPITHydrophilic
168-187SPSTRIAKPVRAKQKRQAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 10, nucl 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MNPSRFCDDKTQTARLMPPLRPPISALGRGYVCPSCITKLQHPRYFPSSVRTISSRRNNPPQKTPITPKLEPRLNKEAVSFRQFEQDEHGRLAPLDIREDDHILEGLDLKQKDHEDELARLSETVEGSHEGTLEEKLKFVESLRRALGKDLGVELKAPAIESSATIDSPSTRIAKPVRAKQKRQAAAIEPIEVEDVDVSIPRHSFPREGQAYISRLNEALEKASAAPLKNRKELWRWYSLSRKTLCAAWGEVPMSTWQLLWKELSVEALDNPDRMPHVIQLGNDMEAANRPLKPEQTLLYIEALFVEGNQKDALARWESVRSSLTLVEATAIQYWALGVVMLAKSKQPARAQEAADVLLNDLKAVKESRALIPLIRTWSEYPDSSAIQMAWALYVRLKFWMGSSMEMQDYDAVAGIFLTSNRTDLALAVFRDMMLTDDPVAKSYDSLALYPRFVGLKGTRPLESFQLGPEETSWTRSNPLTVLPPKFRNKFFFGSWIKKLVGDDEIDWASQVVELMSQRDIRPDATYLNGIIGAWFRTGSAENQKKGTTMAWKMIAARLEFVRYRSHRYTSTLEGPVRARFDQTSKDDFIRPSSIAVSAQASLETFSVLIHHYQQLGQKDRVQELLGAIKATEIKPNTAFLNSLLELGSAMHHRPWVWSLYVRFVEQERVVPSQYTFALLWKSMKDHVDPLINRSKAGYPSPRFLFAEMNKSSTWKNEKLAREMYDQIILCFGLADDQIGTAVALRAMQRLYGMYPNEATVRSIVLQIAKAGVKNVAGYRPRRLNLNKDTQRRISDVGKVLKTLKDDRTKQLEDQGVDVEGMSIEDKSEESLKLLCLLLRSTAEVRMASEASELRMEAGVGGVDYLARSAAHEMGVPENLPWAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.55
3 0.56
4 0.48
5 0.51
6 0.55
7 0.54
8 0.5
9 0.49
10 0.48
11 0.48
12 0.5
13 0.42
14 0.38
15 0.38
16 0.37
17 0.39
18 0.32
19 0.26
20 0.24
21 0.25
22 0.23
23 0.27
24 0.33
25 0.39
26 0.48
27 0.58
28 0.61
29 0.63
30 0.66
31 0.65
32 0.65
33 0.57
34 0.53
35 0.5
36 0.46
37 0.46
38 0.44
39 0.44
40 0.49
41 0.57
42 0.6
43 0.62
44 0.71
45 0.76
46 0.79
47 0.83
48 0.82
49 0.79
50 0.78
51 0.78
52 0.77
53 0.76
54 0.73
55 0.72
56 0.73
57 0.74
58 0.7
59 0.69
60 0.68
61 0.62
62 0.59
63 0.55
64 0.54
65 0.52
66 0.53
67 0.48
68 0.4
69 0.46
70 0.45
71 0.41
72 0.4
73 0.41
74 0.38
75 0.38
76 0.38
77 0.29
78 0.29
79 0.3
80 0.26
81 0.2
82 0.21
83 0.18
84 0.2
85 0.22
86 0.23
87 0.22
88 0.18
89 0.17
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.18
95 0.18
96 0.17
97 0.21
98 0.22
99 0.25
100 0.25
101 0.28
102 0.26
103 0.28
104 0.31
105 0.29
106 0.27
107 0.25
108 0.23
109 0.2
110 0.16
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.1
118 0.11
119 0.14
120 0.16
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.17
127 0.23
128 0.22
129 0.28
130 0.31
131 0.34
132 0.33
133 0.35
134 0.37
135 0.29
136 0.28
137 0.26
138 0.24
139 0.2
140 0.2
141 0.18
142 0.15
143 0.13
144 0.12
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.2
160 0.24
161 0.32
162 0.4
163 0.48
164 0.57
165 0.63
166 0.7
167 0.73
168 0.8
169 0.77
170 0.73
171 0.69
172 0.62
173 0.61
174 0.55
175 0.48
176 0.38
177 0.32
178 0.28
179 0.22
180 0.17
181 0.08
182 0.07
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.12
190 0.14
191 0.17
192 0.18
193 0.27
194 0.29
195 0.3
196 0.32
197 0.34
198 0.35
199 0.35
200 0.34
201 0.25
202 0.22
203 0.21
204 0.21
205 0.16
206 0.15
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.14
211 0.16
212 0.15
213 0.21
214 0.28
215 0.33
216 0.38
217 0.4
218 0.43
219 0.48
220 0.56
221 0.54
222 0.55
223 0.53
224 0.54
225 0.61
226 0.61
227 0.61
228 0.54
229 0.5
230 0.43
231 0.42
232 0.38
233 0.3
234 0.27
235 0.21
236 0.22
237 0.2
238 0.18
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.13
265 0.15
266 0.15
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.15
272 0.11
273 0.1
274 0.13
275 0.11
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.15
280 0.17
281 0.18
282 0.18
283 0.2
284 0.21
285 0.2
286 0.2
287 0.18
288 0.16
289 0.14
290 0.12
291 0.08
292 0.07
293 0.09
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.15
305 0.16
306 0.17
307 0.17
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.03
325 0.02
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.09
332 0.11
333 0.17
334 0.18
335 0.23
336 0.29
337 0.35
338 0.36
339 0.36
340 0.35
341 0.31
342 0.27
343 0.22
344 0.16
345 0.11
346 0.1
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.09
354 0.12
355 0.13
356 0.15
357 0.16
358 0.15
359 0.16
360 0.18
361 0.17
362 0.16
363 0.16
364 0.14
365 0.17
366 0.18
367 0.17
368 0.16
369 0.16
370 0.15
371 0.14
372 0.14
373 0.11
374 0.09
375 0.09
376 0.07
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.13
388 0.12
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.08
396 0.08
397 0.06
398 0.06
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.12
435 0.12
436 0.13
437 0.12
438 0.13
439 0.09
440 0.09
441 0.12
442 0.1
443 0.17
444 0.2
445 0.22
446 0.22
447 0.22
448 0.23
449 0.23
450 0.22
451 0.15
452 0.12
453 0.13
454 0.12
455 0.12
456 0.11
457 0.13
458 0.12
459 0.15
460 0.16
461 0.14
462 0.16
463 0.16
464 0.16
465 0.13
466 0.14
467 0.17
468 0.21
469 0.25
470 0.27
471 0.34
472 0.41
473 0.44
474 0.46
475 0.44
476 0.45
477 0.44
478 0.4
479 0.43
480 0.42
481 0.43
482 0.42
483 0.4
484 0.36
485 0.33
486 0.32
487 0.24
488 0.2
489 0.15
490 0.13
491 0.12
492 0.12
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.08
497 0.07
498 0.06
499 0.03
500 0.04
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.09
505 0.09
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.13
510 0.13
511 0.13
512 0.12
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.07
526 0.1
527 0.2
528 0.25
529 0.27
530 0.29
531 0.29
532 0.28
533 0.28
534 0.28
535 0.24
536 0.2
537 0.23
538 0.22
539 0.23
540 0.23
541 0.25
542 0.25
543 0.18
544 0.18
545 0.14
546 0.16
547 0.16
548 0.17
549 0.23
550 0.23
551 0.3
552 0.32
553 0.35
554 0.34
555 0.38
556 0.41
557 0.38
558 0.42
559 0.4
560 0.37
561 0.36
562 0.36
563 0.34
564 0.33
565 0.28
566 0.23
567 0.19
568 0.21
569 0.25
570 0.28
571 0.31
572 0.3
573 0.32
574 0.33
575 0.32
576 0.33
577 0.29
578 0.24
579 0.2
580 0.19
581 0.17
582 0.15
583 0.15
584 0.13
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.08
589 0.08
590 0.07
591 0.06
592 0.05
593 0.04
594 0.05
595 0.06
596 0.07
597 0.08
598 0.09
599 0.1
600 0.13
601 0.17
602 0.23
603 0.28
604 0.3
605 0.31
606 0.33
607 0.34
608 0.33
609 0.29
610 0.23
611 0.19
612 0.21
613 0.17
614 0.14
615 0.13
616 0.12
617 0.14
618 0.13
619 0.17
620 0.14
621 0.16
622 0.17
623 0.19
624 0.2
625 0.18
626 0.18
627 0.14
628 0.18
629 0.16
630 0.15
631 0.13
632 0.12
633 0.11
634 0.11
635 0.11
636 0.08
637 0.08
638 0.09
639 0.1
640 0.1
641 0.12
642 0.14
643 0.15
644 0.16
645 0.2
646 0.21
647 0.26
648 0.28
649 0.26
650 0.26
651 0.25
652 0.27
653 0.23
654 0.25
655 0.21
656 0.22
657 0.23
658 0.22
659 0.21
660 0.19
661 0.18
662 0.17
663 0.14
664 0.14
665 0.15
666 0.16
667 0.18
668 0.16
669 0.18
670 0.2
671 0.22
672 0.21
673 0.22
674 0.25
675 0.31
676 0.3
677 0.34
678 0.39
679 0.37
680 0.36
681 0.35
682 0.35
683 0.3
684 0.37
685 0.41
686 0.35
687 0.42
688 0.45
689 0.47
690 0.44
691 0.42
692 0.43
693 0.36
694 0.41
695 0.35
696 0.35
697 0.31
698 0.33
699 0.32
700 0.32
701 0.36
702 0.31
703 0.37
704 0.42
705 0.46
706 0.51
707 0.56
708 0.52
709 0.49
710 0.48
711 0.43
712 0.41
713 0.36
714 0.29
715 0.24
716 0.2
717 0.16
718 0.12
719 0.1
720 0.07
721 0.06
722 0.07
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.05
729 0.05
730 0.05
731 0.07
732 0.07
733 0.09
734 0.1
735 0.1
736 0.1
737 0.11
738 0.13
739 0.17
740 0.18
741 0.18
742 0.18
743 0.2
744 0.21
745 0.2
746 0.19
747 0.14
748 0.14
749 0.13
750 0.14
751 0.14
752 0.14
753 0.14
754 0.14
755 0.16
756 0.16
757 0.15
758 0.15
759 0.15
760 0.14
761 0.16
762 0.18
763 0.23
764 0.28
765 0.31
766 0.39
767 0.46
768 0.47
769 0.53
770 0.57
771 0.6
772 0.62
773 0.7
774 0.71
775 0.72
776 0.78
777 0.75
778 0.73
779 0.67
780 0.62
781 0.55
782 0.53
783 0.53
784 0.53
785 0.48
786 0.47
787 0.46
788 0.44
789 0.45
790 0.44
791 0.45
792 0.47
793 0.51
794 0.57
795 0.63
796 0.64
797 0.62
798 0.63
799 0.6
800 0.51
801 0.48
802 0.4
803 0.32
804 0.28
805 0.25
806 0.16
807 0.1
808 0.09
809 0.08
810 0.06
811 0.06
812 0.06
813 0.07
814 0.09
815 0.11
816 0.11
817 0.12
818 0.14
819 0.15
820 0.17
821 0.17
822 0.16
823 0.15
824 0.16
825 0.18
826 0.17
827 0.2
828 0.19
829 0.22
830 0.23
831 0.22
832 0.22
833 0.22
834 0.21
835 0.18
836 0.19
837 0.17
838 0.16
839 0.17
840 0.16
841 0.13
842 0.13
843 0.13
844 0.1
845 0.1
846 0.08
847 0.07
848 0.07
849 0.05
850 0.05
851 0.05
852 0.05
853 0.05
854 0.05
855 0.06
856 0.09
857 0.1
858 0.11
859 0.13
860 0.14
861 0.16
862 0.18
863 0.17
864 0.15