Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YQG7

Protein Details
Accession C7YQG7    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-192DKEAKAIRAKERTKKPTPKKSIMEESDHydrophilic
813-832ELEAKFKKENKTKKVEAEGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-185KKAAIERRADKEAKAIRAKERTKKPTPKK
212-254AKRKSNGVKKAESDSDAPISKKVKSAPAKKGAKADSKTDSKKA
789-809EKLKANKERPMPEKELKERLQ
811-826VKELEAKFKKENKTKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR025834  TopoI_C_dom  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR014727  TopoI_cat_a/b-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0031298  C:replication fork protection complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
GO:0006265  P:DNA topological change  
GO:0007076  P:mitotic chromosome condensation  
GO:0007097  P:nuclear migration  
GO:0000183  P:rDNA heterochromatin formation  
GO:0000019  P:regulation of mitotic recombination  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0009303  P:rRNA transcription  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG nhe:NECHADRAFT_68424  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14370  Topo_C_assoc  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
Amino Acid Sequences MSSSSDDDRPLARVNGNRRNLFLSHIVSSSKISRAEDDAMDRSMPRDAAKLVGLSVRNGPVQDDPMDVDGPVTNGATKRKSRTSITKVNYKDNDSDSEDGAPLAKRQRQNKRVAESDSDDEPIMKARGKKLPPSYKETALPESSDDDQPLGQKLVQKKAAIERRADKEAKAIRAKERTKKPTPKKSIMEESDDDDVPLAKSTNRRQSNGTAAKRKSNGVKKAESDSDAPISKKVKSAPAKKGAKADSKTDSKKAKESGEEEEEFAWWLEPKKEDDSIKWNTLEHNGVLFPPEYEPMPKHIKLIYDGKPVNLAPEVEEVATFWVAMMTPASSHHMENPVFRKNFFEDFQEYCKKYGVTDADGKKVQIKSLDKCDFTKLADYWLAKAEQNKTKNMTKEEKEAAKAKKEALEAPFTHCMWDGRKQKVGNFRVEPPSLFRGRGEHPKTGKVKNRVTPEQITINIGKGAKIPDPPKGHQWKAVQHDQKATWLAMWQENINNNYKYVMLGAASDIKGQSDFKKFEKARELKKHIDRIRKDYTKELKSEVMADRQRATAMYLIDRLALRAGNEKDTENEADTVGCCSLKYEHITLEPPNKVTFDFLGKDSIPYRETAHVEPQVFKNLKLFKKAPKTKGDDLFDRLTTTQLNKHLTNYMPGLTAKVFRTYNASFTMSELLKGLSKDPRSRGSVAEKVKLYNDCNREVAILCNHKRTVGAGHEQQMQKLGDRIKGLRYQQWRTKKMILDIDPTQKKKKGAAWFELDEDLDEEWIKEHQQFLIEEQRTKITKKFEKDNEKLKANKERPMPEKELKERLQVVKELEAKFKKENKTKKVEAEGRGPTVDKFIKAIEKLDERVKVLETQAEDRDGNKEVALGTSKINYIDPRLTVVFSKKFDVPIEKFFSKTLRDKFRWAIKSVEDEDDWTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.51
3 0.58
4 0.57
5 0.56
6 0.57
7 0.52
8 0.49
9 0.45
10 0.4
11 0.33
12 0.33
13 0.31
14 0.28
15 0.3
16 0.29
17 0.28
18 0.27
19 0.26
20 0.27
21 0.3
22 0.33
23 0.33
24 0.34
25 0.32
26 0.31
27 0.3
28 0.27
29 0.24
30 0.23
31 0.21
32 0.18
33 0.18
34 0.17
35 0.19
36 0.21
37 0.2
38 0.18
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.24
43 0.24
44 0.23
45 0.23
46 0.24
47 0.21
48 0.23
49 0.23
50 0.2
51 0.19
52 0.2
53 0.2
54 0.18
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.14
62 0.2
63 0.26
64 0.32
65 0.38
66 0.46
67 0.51
68 0.57
69 0.64
70 0.68
71 0.71
72 0.72
73 0.74
74 0.7
75 0.75
76 0.72
77 0.66
78 0.62
79 0.55
80 0.53
81 0.49
82 0.46
83 0.37
84 0.34
85 0.29
86 0.24
87 0.23
88 0.18
89 0.17
90 0.23
91 0.28
92 0.34
93 0.43
94 0.55
95 0.62
96 0.71
97 0.76
98 0.76
99 0.77
100 0.75
101 0.72
102 0.66
103 0.6
104 0.52
105 0.44
106 0.36
107 0.3
108 0.25
109 0.22
110 0.19
111 0.19
112 0.21
113 0.26
114 0.35
115 0.39
116 0.48
117 0.55
118 0.63
119 0.65
120 0.69
121 0.68
122 0.64
123 0.65
124 0.61
125 0.56
126 0.47
127 0.43
128 0.36
129 0.34
130 0.32
131 0.28
132 0.24
133 0.19
134 0.18
135 0.19
136 0.19
137 0.17
138 0.16
139 0.19
140 0.25
141 0.32
142 0.37
143 0.36
144 0.38
145 0.46
146 0.54
147 0.52
148 0.53
149 0.53
150 0.54
151 0.6
152 0.58
153 0.49
154 0.49
155 0.51
156 0.53
157 0.52
158 0.51
159 0.51
160 0.59
161 0.67
162 0.68
163 0.72
164 0.73
165 0.76
166 0.83
167 0.86
168 0.87
169 0.89
170 0.89
171 0.85
172 0.84
173 0.84
174 0.77
175 0.73
176 0.63
177 0.57
178 0.5
179 0.43
180 0.34
181 0.24
182 0.21
183 0.14
184 0.14
185 0.11
186 0.1
187 0.17
188 0.26
189 0.36
190 0.41
191 0.42
192 0.45
193 0.5
194 0.58
195 0.61
196 0.62
197 0.61
198 0.58
199 0.63
200 0.62
201 0.61
202 0.6
203 0.6
204 0.6
205 0.57
206 0.6
207 0.56
208 0.6
209 0.58
210 0.51
211 0.44
212 0.38
213 0.35
214 0.32
215 0.29
216 0.28
217 0.27
218 0.26
219 0.27
220 0.27
221 0.32
222 0.39
223 0.48
224 0.53
225 0.61
226 0.66
227 0.66
228 0.7
229 0.68
230 0.67
231 0.6
232 0.56
233 0.53
234 0.56
235 0.57
236 0.57
237 0.57
238 0.51
239 0.55
240 0.54
241 0.51
242 0.48
243 0.47
244 0.46
245 0.46
246 0.43
247 0.38
248 0.33
249 0.29
250 0.24
251 0.21
252 0.14
253 0.09
254 0.1
255 0.12
256 0.14
257 0.16
258 0.19
259 0.24
260 0.25
261 0.27
262 0.32
263 0.35
264 0.37
265 0.35
266 0.32
267 0.29
268 0.31
269 0.29
270 0.22
271 0.18
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.13
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.16
283 0.23
284 0.23
285 0.24
286 0.25
287 0.26
288 0.28
289 0.35
290 0.35
291 0.37
292 0.37
293 0.35
294 0.35
295 0.34
296 0.31
297 0.24
298 0.19
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.11
303 0.11
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.18
321 0.19
322 0.23
323 0.27
324 0.32
325 0.31
326 0.31
327 0.32
328 0.3
329 0.33
330 0.29
331 0.29
332 0.25
333 0.27
334 0.33
335 0.37
336 0.34
337 0.31
338 0.32
339 0.27
340 0.24
341 0.27
342 0.23
343 0.2
344 0.27
345 0.29
346 0.31
347 0.32
348 0.32
349 0.32
350 0.3
351 0.27
352 0.26
353 0.28
354 0.28
355 0.37
356 0.42
357 0.38
358 0.39
359 0.41
360 0.36
361 0.32
362 0.32
363 0.22
364 0.2
365 0.22
366 0.21
367 0.19
368 0.2
369 0.2
370 0.17
371 0.2
372 0.24
373 0.28
374 0.3
375 0.32
376 0.35
377 0.38
378 0.42
379 0.44
380 0.45
381 0.41
382 0.44
383 0.46
384 0.44
385 0.43
386 0.46
387 0.43
388 0.4
389 0.39
390 0.35
391 0.33
392 0.32
393 0.32
394 0.27
395 0.29
396 0.25
397 0.28
398 0.29
399 0.25
400 0.24
401 0.21
402 0.2
403 0.18
404 0.26
405 0.29
406 0.29
407 0.34
408 0.35
409 0.38
410 0.47
411 0.49
412 0.46
413 0.42
414 0.43
415 0.43
416 0.43
417 0.39
418 0.32
419 0.33
420 0.27
421 0.25
422 0.21
423 0.19
424 0.22
425 0.32
426 0.32
427 0.34
428 0.34
429 0.41
430 0.46
431 0.5
432 0.54
433 0.52
434 0.55
435 0.55
436 0.6
437 0.57
438 0.56
439 0.51
440 0.47
441 0.41
442 0.34
443 0.31
444 0.24
445 0.2
446 0.18
447 0.15
448 0.13
449 0.11
450 0.13
451 0.12
452 0.16
453 0.17
454 0.22
455 0.27
456 0.29
457 0.36
458 0.42
459 0.41
460 0.43
461 0.46
462 0.45
463 0.47
464 0.54
465 0.5
466 0.45
467 0.48
468 0.41
469 0.39
470 0.34
471 0.28
472 0.19
473 0.16
474 0.15
475 0.13
476 0.13
477 0.12
478 0.12
479 0.16
480 0.17
481 0.2
482 0.19
483 0.17
484 0.17
485 0.17
486 0.14
487 0.11
488 0.1
489 0.06
490 0.05
491 0.06
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.12
500 0.15
501 0.18
502 0.19
503 0.29
504 0.3
505 0.34
506 0.44
507 0.47
508 0.51
509 0.59
510 0.65
511 0.63
512 0.7
513 0.74
514 0.71
515 0.74
516 0.68
517 0.65
518 0.69
519 0.65
520 0.6
521 0.6
522 0.62
523 0.57
524 0.54
525 0.49
526 0.41
527 0.36
528 0.38
529 0.31
530 0.3
531 0.28
532 0.27
533 0.26
534 0.24
535 0.24
536 0.2
537 0.19
538 0.13
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.11
543 0.13
544 0.12
545 0.11
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.14
550 0.15
551 0.16
552 0.17
553 0.17
554 0.18
555 0.21
556 0.21
557 0.16
558 0.15
559 0.13
560 0.12
561 0.12
562 0.11
563 0.09
564 0.08
565 0.06
566 0.07
567 0.08
568 0.1
569 0.13
570 0.13
571 0.14
572 0.16
573 0.18
574 0.21
575 0.26
576 0.25
577 0.23
578 0.23
579 0.22
580 0.21
581 0.2
582 0.18
583 0.15
584 0.15
585 0.15
586 0.17
587 0.17
588 0.18
589 0.18
590 0.19
591 0.16
592 0.15
593 0.17
594 0.19
595 0.21
596 0.22
597 0.26
598 0.29
599 0.29
600 0.31
601 0.3
602 0.34
603 0.32
604 0.3
605 0.31
606 0.34
607 0.35
608 0.4
609 0.43
610 0.42
611 0.53
612 0.62
613 0.63
614 0.64
615 0.69
616 0.69
617 0.74
618 0.7
619 0.62
620 0.58
621 0.54
622 0.45
623 0.4
624 0.32
625 0.25
626 0.22
627 0.2
628 0.2
629 0.22
630 0.26
631 0.25
632 0.27
633 0.3
634 0.29
635 0.3
636 0.27
637 0.22
638 0.19
639 0.19
640 0.18
641 0.15
642 0.18
643 0.16
644 0.2
645 0.19
646 0.17
647 0.24
648 0.23
649 0.25
650 0.25
651 0.26
652 0.21
653 0.22
654 0.26
655 0.2
656 0.19
657 0.17
658 0.14
659 0.14
660 0.14
661 0.16
662 0.18
663 0.24
664 0.29
665 0.33
666 0.38
667 0.4
668 0.42
669 0.43
670 0.44
671 0.47
672 0.46
673 0.48
674 0.43
675 0.4
676 0.42
677 0.41
678 0.37
679 0.37
680 0.37
681 0.34
682 0.34
683 0.33
684 0.3
685 0.27
686 0.27
687 0.26
688 0.32
689 0.31
690 0.36
691 0.35
692 0.34
693 0.34
694 0.32
695 0.3
696 0.26
697 0.31
698 0.3
699 0.34
700 0.4
701 0.41
702 0.39
703 0.39
704 0.34
705 0.28
706 0.29
707 0.28
708 0.24
709 0.27
710 0.29
711 0.29
712 0.35
713 0.37
714 0.4
715 0.45
716 0.5
717 0.56
718 0.64
719 0.63
720 0.63
721 0.67
722 0.63
723 0.62
724 0.62
725 0.57
726 0.52
727 0.54
728 0.58
729 0.58
730 0.58
731 0.58
732 0.54
733 0.53
734 0.53
735 0.54
736 0.54
737 0.54
738 0.57
739 0.57
740 0.55
741 0.55
742 0.5
743 0.43
744 0.33
745 0.26
746 0.19
747 0.13
748 0.11
749 0.08
750 0.08
751 0.09
752 0.1
753 0.1
754 0.11
755 0.11
756 0.15
757 0.15
758 0.19
759 0.28
760 0.3
761 0.31
762 0.31
763 0.37
764 0.36
765 0.38
766 0.39
767 0.39
768 0.44
769 0.49
770 0.57
771 0.61
772 0.69
773 0.75
774 0.8
775 0.78
776 0.77
777 0.76
778 0.74
779 0.75
780 0.69
781 0.67
782 0.66
783 0.67
784 0.65
785 0.68
786 0.68
787 0.65
788 0.7
789 0.7
790 0.71
791 0.65
792 0.66
793 0.65
794 0.63
795 0.59
796 0.53
797 0.49
798 0.47
799 0.51
800 0.47
801 0.49
802 0.47
803 0.47
804 0.51
805 0.56
806 0.58
807 0.61
808 0.69
809 0.7
810 0.75
811 0.78
812 0.78
813 0.81
814 0.8
815 0.75
816 0.74
817 0.7
818 0.63
819 0.58
820 0.5
821 0.4
822 0.39
823 0.36
824 0.28
825 0.24
826 0.24
827 0.29
828 0.29
829 0.32
830 0.31
831 0.33
832 0.36
833 0.41
834 0.41
835 0.36
836 0.37
837 0.36
838 0.32
839 0.29
840 0.3
841 0.27
842 0.28
843 0.29
844 0.3
845 0.29
846 0.27
847 0.29
848 0.27
849 0.24
850 0.2
851 0.18
852 0.15
853 0.18
854 0.2
855 0.18
856 0.17
857 0.18
858 0.19
859 0.19
860 0.22
861 0.21
862 0.22
863 0.25
864 0.24
865 0.27
866 0.27
867 0.27
868 0.29
869 0.35
870 0.36
871 0.34
872 0.38
873 0.36
874 0.38
875 0.41
876 0.46
877 0.43
878 0.45
879 0.51
880 0.48
881 0.47
882 0.46
883 0.46
884 0.45
885 0.49
886 0.5
887 0.52
888 0.55
889 0.61
890 0.67
891 0.73
892 0.71
893 0.65
894 0.62
895 0.56
896 0.6
897 0.57
898 0.53
899 0.43