Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7P6J1

Protein Details
Accession A0A1B7P6J1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-153DEEQAVSGRPRKRRRRRLNGFVDMEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-144RPRKRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041973  KOW_Spt5_1  
IPR005100  NGN-domain  
IPR006645  NGN-like_dom  
IPR036735  NGN_dom_sf  
IPR039385  NGN_Euk  
IPR039659  SPT5  
IPR022581  Spt5_N  
Gene Ontology GO:0032784  P:regulation of DNA-templated transcription elongation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0140673  P:transcription elongation-coupled chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF03439  Spt5-NGN  
PF11942  Spt5_N  
CDD cd06081  KOW_Spt5_1  
cd09888  NGN_Euk  
Amino Acid Sequences MSNPVSKFLNEDFGSEEEDDDFNPAPVEDSDDERPKKREATTYSDVARDDKPGVDGEDDEENQEEDEPPRRKEKAGASDNEEENYGDADENDGVGAVGGMEDAEEEEEADEEEAEEDEVDDDDDEDDDEEQAVSGRPRKRRRRRLNGFVDMEAEVDEDDDAEEEEEEMDDGFVAEHADDHDALPIGAVIDDRRHRELDRKRDLEATMDAEKQAQALKERYGRNRAAAADLVVVPKRLLLPSVDDPSIWAVKCRPGKEREAVFNIMKRIEDRPPGSRRPIRIMSAFERGGTMSGYIYVEARKQADVIDALEDMSNVYTKSKMILISVKEMPDLLRVTKSEELVPGGWVRIKRGKYQGDLAQLEDVETNGLDVTVRLVPRLDYGLNEDMSAPNGDMKRKRPGVNSAIARPPQRPFSEAEAKKSMPSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.24
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.16
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.17
15 0.15
16 0.2
17 0.26
18 0.35
19 0.4
20 0.43
21 0.46
22 0.45
23 0.5
24 0.5
25 0.52
26 0.49
27 0.54
28 0.54
29 0.57
30 0.55
31 0.52
32 0.48
33 0.42
34 0.37
35 0.31
36 0.27
37 0.22
38 0.21
39 0.19
40 0.2
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.2
45 0.2
46 0.19
47 0.18
48 0.16
49 0.15
50 0.16
51 0.15
52 0.12
53 0.21
54 0.25
55 0.28
56 0.35
57 0.37
58 0.37
59 0.43
60 0.5
61 0.51
62 0.55
63 0.57
64 0.56
65 0.61
66 0.6
67 0.54
68 0.45
69 0.34
70 0.26
71 0.22
72 0.16
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.03
84 0.03
85 0.02
86 0.02
87 0.02
88 0.02
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.08
121 0.15
122 0.21
123 0.3
124 0.41
125 0.52
126 0.63
127 0.73
128 0.82
129 0.87
130 0.92
131 0.93
132 0.93
133 0.91
134 0.83
135 0.72
136 0.63
137 0.51
138 0.41
139 0.3
140 0.2
141 0.1
142 0.07
143 0.06
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.08
177 0.11
178 0.13
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.27
183 0.35
184 0.42
185 0.49
186 0.48
187 0.48
188 0.49
189 0.49
190 0.42
191 0.35
192 0.28
193 0.2
194 0.19
195 0.17
196 0.14
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.15
204 0.21
205 0.25
206 0.29
207 0.35
208 0.35
209 0.34
210 0.35
211 0.32
212 0.27
213 0.23
214 0.19
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.11
227 0.15
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.18
233 0.2
234 0.15
235 0.13
236 0.11
237 0.18
238 0.23
239 0.25
240 0.29
241 0.32
242 0.37
243 0.43
244 0.47
245 0.46
246 0.46
247 0.47
248 0.43
249 0.41
250 0.38
251 0.31
252 0.27
253 0.23
254 0.21
255 0.21
256 0.26
257 0.26
258 0.32
259 0.38
260 0.43
261 0.5
262 0.52
263 0.51
264 0.52
265 0.53
266 0.49
267 0.46
268 0.46
269 0.41
270 0.42
271 0.39
272 0.31
273 0.27
274 0.24
275 0.21
276 0.16
277 0.12
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.18
310 0.19
311 0.24
312 0.27
313 0.26
314 0.24
315 0.24
316 0.22
317 0.2
318 0.2
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.21
323 0.24
324 0.25
325 0.22
326 0.22
327 0.23
328 0.2
329 0.22
330 0.18
331 0.16
332 0.18
333 0.17
334 0.21
335 0.26
336 0.28
337 0.33
338 0.42
339 0.46
340 0.47
341 0.54
342 0.54
343 0.55
344 0.54
345 0.48
346 0.41
347 0.35
348 0.31
349 0.24
350 0.19
351 0.11
352 0.09
353 0.08
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.07
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.13
364 0.15
365 0.18
366 0.16
367 0.14
368 0.2
369 0.23
370 0.23
371 0.23
372 0.22
373 0.19
374 0.2
375 0.2
376 0.14
377 0.16
378 0.18
379 0.25
380 0.31
381 0.35
382 0.44
383 0.51
384 0.56
385 0.57
386 0.64
387 0.64
388 0.68
389 0.69
390 0.65
391 0.67
392 0.66
393 0.63
394 0.57
395 0.55
396 0.53
397 0.5
398 0.45
399 0.41
400 0.45
401 0.52
402 0.52
403 0.54
404 0.53
405 0.51