Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YPF5

Protein Details
Accession C7YPF5    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-132AKDWLMGQKKRQKKIAKTRKLEEELAHydrophilic
282-310YLDPSKIKVKKPKKSKKNKGTRQKPVDEDBasic
353-380ASLAIQRKKALKKRKKTRPEDIAKQLKEHydrophilic
597-621KGSGKGKTEKRLKKIEDEKRREAQSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-80KRKREEKAAAIRK
115-125KKRQKKIAKTR
287-304KIKVKKPKKSKKNKGTRQ
359-371RKKALKKRKKTRP
416-422RKPRKPK
597-616KGSGKGKTEKRLKKIEDEKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.333, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG nhe:NECHADRAFT_92512  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAATIEETNRIRISLGMKPLPVPGADTSNKQESNDADSDGEVASTLESRQAQAYDNYNKAMEAENAKRKREEKAAAIRKARDQAQLHAVIEGKGFGEAEEGGDVSAKDWLMGQKKRQKKIAKTRKLEEELAAAEAAAAAAVQYTSKDLAGIKVAHDTADFLDGDDQILTLKDTTIEENEAEGDELENLNMREAEKLSERLDLKKKKPGYNPHDDEEEGERSILAQYDDEIGGKKTKKFTLDMDGAIAELSDILDKPTEKARKIQSVSLDDIVGDAPVSSDYLDPSKIKVKKPKKSKKNKGTRQKPVDEDDIFPIDTAPADSNAMDVDSSNGAASKKRKTGDDTFVDDDDLQASLAIQRKKALKKRKKTRPEDIAKQLKEQEDEPEHAEQEEGGLVLGEVSEFVAGLSKPGENEERKPRKPKTVSKSPEPDEDHPMEDNAHEPEDEKPATSALDEVDETGVEEEKAVGEGMGAALALLRERGLVEDARGDTEYSNLRDREEFLARKRRLEEELDDQARHQRERDRMSGKLDRMSVRDREEWARQQNTWRDQQQSRRMAELFSSGYKPNVELKYTDEHGRALDQKEAFKHLSHQFHGKGSGKGKTEKRLKKIEDEKRREAQSMFDASQSAGMSLAAQQQLKKRREAGVRLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.3
10 0.27
11 0.21
12 0.24
13 0.26
14 0.29
15 0.32
16 0.39
17 0.4
18 0.37
19 0.39
20 0.33
21 0.39
22 0.36
23 0.33
24 0.25
25 0.24
26 0.24
27 0.2
28 0.18
29 0.1
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.11
35 0.11
36 0.13
37 0.15
38 0.16
39 0.18
40 0.21
41 0.29
42 0.32
43 0.34
44 0.35
45 0.33
46 0.31
47 0.3
48 0.29
49 0.25
50 0.25
51 0.32
52 0.4
53 0.46
54 0.49
55 0.54
56 0.53
57 0.56
58 0.58
59 0.55
60 0.55
61 0.6
62 0.67
63 0.69
64 0.74
65 0.71
66 0.68
67 0.67
68 0.62
69 0.59
70 0.52
71 0.49
72 0.5
73 0.5
74 0.45
75 0.4
76 0.37
77 0.29
78 0.26
79 0.21
80 0.14
81 0.1
82 0.09
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.09
97 0.15
98 0.23
99 0.28
100 0.38
101 0.45
102 0.54
103 0.62
104 0.69
105 0.73
106 0.75
107 0.82
108 0.84
109 0.85
110 0.84
111 0.85
112 0.86
113 0.82
114 0.73
115 0.63
116 0.55
117 0.45
118 0.38
119 0.3
120 0.19
121 0.13
122 0.11
123 0.09
124 0.05
125 0.03
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.03
130 0.03
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.13
138 0.14
139 0.13
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.11
146 0.12
147 0.11
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.12
182 0.13
183 0.16
184 0.16
185 0.22
186 0.23
187 0.28
188 0.38
189 0.44
190 0.46
191 0.52
192 0.58
193 0.6
194 0.67
195 0.71
196 0.7
197 0.72
198 0.72
199 0.67
200 0.62
201 0.55
202 0.48
203 0.41
204 0.35
205 0.24
206 0.19
207 0.16
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.08
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.14
220 0.17
221 0.19
222 0.22
223 0.25
224 0.27
225 0.29
226 0.31
227 0.33
228 0.34
229 0.31
230 0.28
231 0.24
232 0.22
233 0.19
234 0.15
235 0.07
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.07
244 0.15
245 0.19
246 0.2
247 0.27
248 0.32
249 0.39
250 0.41
251 0.43
252 0.41
253 0.41
254 0.42
255 0.37
256 0.31
257 0.22
258 0.2
259 0.17
260 0.11
261 0.07
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.18
274 0.22
275 0.28
276 0.38
277 0.47
278 0.54
279 0.65
280 0.74
281 0.77
282 0.84
283 0.9
284 0.9
285 0.91
286 0.93
287 0.93
288 0.93
289 0.92
290 0.89
291 0.84
292 0.77
293 0.7
294 0.65
295 0.56
296 0.46
297 0.38
298 0.3
299 0.24
300 0.2
301 0.16
302 0.1
303 0.08
304 0.07
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.09
321 0.13
322 0.17
323 0.21
324 0.23
325 0.25
326 0.3
327 0.36
328 0.41
329 0.42
330 0.42
331 0.39
332 0.38
333 0.37
334 0.3
335 0.24
336 0.16
337 0.11
338 0.06
339 0.04
340 0.04
341 0.06
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.16
346 0.23
347 0.31
348 0.39
349 0.48
350 0.53
351 0.63
352 0.74
353 0.81
354 0.86
355 0.86
356 0.88
357 0.88
358 0.87
359 0.85
360 0.84
361 0.82
362 0.72
363 0.67
364 0.6
365 0.51
366 0.43
367 0.35
368 0.31
369 0.24
370 0.25
371 0.25
372 0.22
373 0.2
374 0.19
375 0.18
376 0.12
377 0.09
378 0.08
379 0.05
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.09
398 0.15
399 0.16
400 0.22
401 0.33
402 0.42
403 0.48
404 0.57
405 0.6
406 0.65
407 0.72
408 0.75
409 0.74
410 0.75
411 0.75
412 0.75
413 0.79
414 0.71
415 0.7
416 0.66
417 0.6
418 0.55
419 0.51
420 0.44
421 0.36
422 0.33
423 0.25
424 0.19
425 0.18
426 0.13
427 0.11
428 0.09
429 0.1
430 0.11
431 0.15
432 0.15
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.12
438 0.11
439 0.07
440 0.08
441 0.07
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.07
470 0.08
471 0.08
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.15
476 0.14
477 0.12
478 0.15
479 0.18
480 0.17
481 0.23
482 0.21
483 0.23
484 0.23
485 0.26
486 0.28
487 0.32
488 0.34
489 0.37
490 0.47
491 0.47
492 0.51
493 0.51
494 0.5
495 0.46
496 0.46
497 0.43
498 0.4
499 0.48
500 0.46
501 0.43
502 0.4
503 0.43
504 0.42
505 0.38
506 0.34
507 0.32
508 0.37
509 0.43
510 0.51
511 0.49
512 0.49
513 0.55
514 0.59
515 0.55
516 0.52
517 0.5
518 0.44
519 0.44
520 0.46
521 0.43
522 0.41
523 0.41
524 0.4
525 0.41
526 0.46
527 0.5
528 0.53
529 0.52
530 0.49
531 0.55
532 0.6
533 0.61
534 0.62
535 0.59
536 0.58
537 0.61
538 0.69
539 0.7
540 0.7
541 0.65
542 0.62
543 0.57
544 0.5
545 0.44
546 0.38
547 0.31
548 0.26
549 0.26
550 0.22
551 0.23
552 0.23
553 0.24
554 0.27
555 0.28
556 0.26
557 0.24
558 0.27
559 0.32
560 0.35
561 0.37
562 0.31
563 0.28
564 0.27
565 0.31
566 0.33
567 0.28
568 0.32
569 0.3
570 0.33
571 0.34
572 0.39
573 0.36
574 0.31
575 0.37
576 0.39
577 0.43
578 0.43
579 0.48
580 0.46
581 0.47
582 0.54
583 0.5
584 0.49
585 0.47
586 0.5
587 0.47
588 0.53
589 0.56
590 0.59
591 0.65
592 0.68
593 0.71
594 0.75
595 0.75
596 0.77
597 0.81
598 0.82
599 0.82
600 0.82
601 0.82
602 0.8
603 0.79
604 0.72
605 0.62
606 0.57
607 0.53
608 0.51
609 0.43
610 0.36
611 0.33
612 0.29
613 0.31
614 0.26
615 0.18
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.11
620 0.16
621 0.17
622 0.19
623 0.23
624 0.31
625 0.41
626 0.44
627 0.49
628 0.49
629 0.53
630 0.61