Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7P8W8

Protein Details
Accession A0A1B7P8W8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-41TADSQRRKPCFSNRKLRHLQGISHydrophilic
362-385ATISAKKQLRQTRQHKEQIQKSLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040939  Vps38  
Gene Ontology GO:0034272  C:phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type II  
Pfam View protein in Pfam  
PF17649  VPS38  
Amino Acid Sequences MSLSASTDDLVQRLEQLSTADSQRRKPCFSNRKLRHLQGISVRNLVVNVPNNNNNNNNNDNINSNARSRGKTIDDDNAPNALQSPSKQLALHESRSSIHQSRSFTNLKRGDQFPSTGATALAFATGSENEMERRRDTQINRRRSTLPWAGTSPFIRQHRLENIAGNRMADSWFSLHCAGIDQPVYVSEVVEKAMNPNYKYVDLNVCGPLVSRLEQVTYKLWARTGSMTEYILLLRLEVNLRSLQYIGKTLESFHHPLPTNCVVFHFQDGVYTSLMDIPPVHRLPARITTPARFGDDSHLQSTSSYDALMRLANLDDCIQDALATREKLEAQINALLEKHHGDLNAISRKSQAVDKLSSVKRATISAKKQLRQTRQHKEQIQKSLEARRAAMTRGRASQEKTDSYLSEAQSSMSSSENLLRTTTEDSMGQIRRICEDLHTIYPIEPIPEKPLAFTICSCALPNSTFEDMDKESIAAALGYTAHLVYLLSFYLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.14
4 0.15
5 0.17
6 0.22
7 0.27
8 0.3
9 0.38
10 0.47
11 0.52
12 0.56
13 0.6
14 0.66
15 0.7
16 0.76
17 0.79
18 0.79
19 0.83
20 0.87
21 0.84
22 0.84
23 0.76
24 0.72
25 0.71
26 0.7
27 0.62
28 0.55
29 0.5
30 0.4
31 0.37
32 0.31
33 0.28
34 0.26
35 0.28
36 0.31
37 0.38
38 0.41
39 0.45
40 0.5
41 0.48
42 0.48
43 0.46
44 0.42
45 0.38
46 0.36
47 0.33
48 0.31
49 0.33
50 0.29
51 0.28
52 0.34
53 0.36
54 0.37
55 0.37
56 0.39
57 0.37
58 0.4
59 0.42
60 0.42
61 0.43
62 0.44
63 0.43
64 0.39
65 0.34
66 0.29
67 0.27
68 0.2
69 0.16
70 0.14
71 0.2
72 0.2
73 0.23
74 0.23
75 0.22
76 0.31
77 0.35
78 0.39
79 0.33
80 0.32
81 0.31
82 0.33
83 0.39
84 0.34
85 0.34
86 0.33
87 0.35
88 0.36
89 0.42
90 0.46
91 0.43
92 0.48
93 0.49
94 0.49
95 0.52
96 0.51
97 0.48
98 0.44
99 0.43
100 0.34
101 0.31
102 0.27
103 0.21
104 0.19
105 0.14
106 0.12
107 0.1
108 0.09
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.1
117 0.15
118 0.17
119 0.18
120 0.21
121 0.24
122 0.31
123 0.37
124 0.45
125 0.5
126 0.58
127 0.59
128 0.6
129 0.59
130 0.54
131 0.56
132 0.54
133 0.48
134 0.4
135 0.4
136 0.37
137 0.38
138 0.37
139 0.31
140 0.3
141 0.29
142 0.3
143 0.28
144 0.32
145 0.35
146 0.39
147 0.37
148 0.36
149 0.36
150 0.37
151 0.36
152 0.31
153 0.25
154 0.2
155 0.2
156 0.13
157 0.12
158 0.08
159 0.08
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.08
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.13
181 0.17
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.21
186 0.22
187 0.22
188 0.2
189 0.18
190 0.19
191 0.18
192 0.16
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.15
239 0.17
240 0.15
241 0.21
242 0.2
243 0.21
244 0.26
245 0.28
246 0.25
247 0.22
248 0.24
249 0.2
250 0.19
251 0.2
252 0.15
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.12
269 0.14
270 0.17
271 0.23
272 0.24
273 0.25
274 0.27
275 0.27
276 0.3
277 0.31
278 0.3
279 0.24
280 0.22
281 0.23
282 0.27
283 0.27
284 0.24
285 0.23
286 0.21
287 0.2
288 0.2
289 0.16
290 0.1
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.09
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.18
316 0.15
317 0.13
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.15
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.12
330 0.2
331 0.26
332 0.25
333 0.24
334 0.24
335 0.25
336 0.25
337 0.26
338 0.24
339 0.21
340 0.24
341 0.26
342 0.34
343 0.35
344 0.39
345 0.37
346 0.34
347 0.3
348 0.32
349 0.35
350 0.35
351 0.4
352 0.44
353 0.51
354 0.53
355 0.6
356 0.65
357 0.69
358 0.71
359 0.75
360 0.76
361 0.78
362 0.84
363 0.83
364 0.84
365 0.82
366 0.81
367 0.75
368 0.69
369 0.64
370 0.63
371 0.61
372 0.53
373 0.46
374 0.4
375 0.38
376 0.36
377 0.36
378 0.33
379 0.32
380 0.35
381 0.38
382 0.38
383 0.4
384 0.45
385 0.46
386 0.43
387 0.42
388 0.39
389 0.35
390 0.36
391 0.38
392 0.31
393 0.27
394 0.24
395 0.22
396 0.2
397 0.2
398 0.17
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.16
403 0.18
404 0.18
405 0.18
406 0.17
407 0.18
408 0.22
409 0.22
410 0.18
411 0.16
412 0.17
413 0.24
414 0.26
415 0.27
416 0.26
417 0.26
418 0.27
419 0.28
420 0.27
421 0.21
422 0.26
423 0.27
424 0.27
425 0.28
426 0.26
427 0.25
428 0.27
429 0.25
430 0.22
431 0.19
432 0.18
433 0.22
434 0.25
435 0.25
436 0.24
437 0.28
438 0.27
439 0.27
440 0.26
441 0.26
442 0.24
443 0.25
444 0.25
445 0.22
446 0.23
447 0.22
448 0.23
449 0.24
450 0.23
451 0.23
452 0.22
453 0.26
454 0.25
455 0.26
456 0.25
457 0.19
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.1
462 0.08
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07