FuNGI

A0A1B7P1K6

Protein Details

Accession

A0A1B7P1K6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-49	APLMKVRRPRADPLVRPKKRPIPRPPGAGP	Basic
526-545	GTDTPRKKSKSKHADAQPES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-48	PAPRRAPGPNAPLMKVRRPRADPLVRPKKRPIPRPPGAG
414-430	KEALKNFGKRVRKALQR
506-517	KVAPRAARKRPG
530-541	PRKKSKSKHADA
546-546	R
552-558	PSGQRKP
567-568	KK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTPPNPPPAPRRAPGPNAPLMKVRRPRADPLVRPKKRPIPRPPGAGPAANGTVAAPTPRHPQAIPRSHPSGTKSKPVIPSADDLAVNGFSGPLLSESYVDYPLVTTKRAWREGLKHHVAKFASKKSIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRASNIGPAVEKDDQPPRRPGELNEAEREELEAKKAAREKERAENLAQIAPSAAVTQKKTNAPKPRTQQVFKSEMTPEEIAKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETYAMFVLQNDGKMRMVPIDKWYKFTTKSPFKTLTIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKEQDRAQKKALEEYAKQSKLFTGRREGFSGAGEGFEADDLDFEEDRFADDEEHVGIFDEDEDAKTAEKRIKEDQLKANIFDLKDEKMYDEEENQEKKEKEALKNFGKRVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSEDSETEQQKEEQQKLEEERLKKEKGKDSDRNSVSSTKGTNTPSGWPKNTDSLNKKVAPRAARKRPGSPNLSDASGTDTPRKKSKSKHADAQPESRPMSPGPSGQRKPSAAADQSSKKRVRSGPAGSGSGSDGERGAASGGEMSDSTAGGAMSLKLKSKTGTPRDSRAASPAGLLQTRKGTGSGASSPARTSTPGPGATTSMLTFPTALEIHSAIPATGIASAELLRIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDRLLRPGVLKEGAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.67
3	0.67
4	0.66
5	0.64
6	0.61
7	0.61
8	0.61
9	0.58
10	0.6
11	0.6
12	0.61
13	0.62
14	0.63
15	0.68
16	0.71
17	0.76
18	0.75
19	0.78
20	0.81
21	0.79
22	0.8
23	0.82
24	0.82
25	0.81
26	0.82
27	0.81
28	0.81
29	0.82
30	0.85
31	0.79
32	0.77
33	0.72
34	0.64
35	0.54
36	0.48
37	0.41
38	0.32
39	0.28
40	0.19
41	0.16
42	0.14
43	0.15
44	0.11
45	0.13
46	0.2
47	0.23
48	0.26
49	0.25
50	0.34
51	0.42
52	0.52
53	0.55
54	0.55
55	0.57
56	0.56
57	0.6
58	0.56
59	0.56
60	0.5
61	0.54
62	0.51
63	0.53
64	0.57
65	0.56
66	0.55
67	0.47
68	0.46
69	0.4
70	0.39
71	0.32
72	0.26
73	0.24
74	0.2
75	0.17
76	0.13
77	0.09
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.05
82	0.07
83	0.07
84	0.08
85	0.09
86	0.12
87	0.13
88	0.12
89	0.11
90	0.11
91	0.15
92	0.16
93	0.16
94	0.17
95	0.24
96	0.33
97	0.37
98	0.4
99	0.42
100	0.48
101	0.57
102	0.64
103	0.65
104	0.63
105	0.6
106	0.63
107	0.57
108	0.57
109	0.55
110	0.53
111	0.51
112	0.47
113	0.5
114	0.53
115	0.62
116	0.58
117	0.55
118	0.53
119	0.55
120	0.58
121	0.55
122	0.51
123	0.48
124	0.46
125	0.47
126	0.45
127	0.46
128	0.52
129	0.57
130	0.62
131	0.65
132	0.74
133	0.76
134	0.75
135	0.73
136	0.71
137	0.65
138	0.59
139	0.52
140	0.44
141	0.36
142	0.34
143	0.32
144	0.26
145	0.25
146	0.25
147	0.31
148	0.34
149	0.38
150	0.44
151	0.43
152	0.46
153	0.47
154	0.46
155	0.47
156	0.51
157	0.51
158	0.49
159	0.46
160	0.41
161	0.39
162	0.38
163	0.29
164	0.21
165	0.18
166	0.17
167	0.15
168	0.2
169	0.25
170	0.29
171	0.34
172	0.39
173	0.42
174	0.48
175	0.55
176	0.52
177	0.49
178	0.48
179	0.43
180	0.4
181	0.34
182	0.24
183	0.18
184	0.15
185	0.13
186	0.1
187	0.1
188	0.11
189	0.13
190	0.17
191	0.22
192	0.29
193	0.35
194	0.43
195	0.51
196	0.54
197	0.6
198	0.65
199	0.69
200	0.71
201	0.68
202	0.67
203	0.64
204	0.63
205	0.55
206	0.52
207	0.44
208	0.37
209	0.37
210	0.31
211	0.24
212	0.21
213	0.22
214	0.2
215	0.22
216	0.22
217	0.19
218	0.19
219	0.2
220	0.18
221	0.2
222	0.23
223	0.22
224	0.25
225	0.24
226	0.24
227	0.23
228	0.22
229	0.19
230	0.15
231	0.16
232	0.15
233	0.14
234	0.13
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.14
239	0.11
240	0.1
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.08
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.07
255	0.07
256	0.09
257	0.1
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.12
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.19
266	0.28
267	0.28
268	0.32
269	0.34
270	0.34
271	0.35
272	0.39
273	0.43
274	0.43
275	0.46
276	0.49
277	0.5
278	0.48
279	0.49
280	0.44
281	0.4
282	0.34
283	0.32
284	0.26
285	0.23
286	0.22
287	0.2
288	0.19
289	0.16
290	0.16
291	0.15
292	0.21
293	0.29
294	0.38
295	0.45
296	0.49
297	0.51
298	0.54
299	0.56
300	0.51
301	0.52
302	0.49
303	0.45
304	0.49
305	0.53
306	0.47
307	0.46
308	0.47
309	0.41
310	0.35
311	0.37
312	0.33
313	0.29
314	0.29
315	0.33
316	0.39
317	0.37
318	0.36
319	0.31
320	0.29
321	0.32
322	0.35
323	0.31
324	0.31
325	0.34
326	0.36
327	0.37
328	0.36
329	0.29
330	0.25
331	0.24
332	0.14
333	0.11
334	0.08
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.09
368	0.11
369	0.12
370	0.16
371	0.19
372	0.28
373	0.32
374	0.38
375	0.42
376	0.48
377	0.48
378	0.45
379	0.43
380	0.37
381	0.33
382	0.28
383	0.23
384	0.15
385	0.15
386	0.14
387	0.13
388	0.11
389	0.13
390	0.12
391	0.12
392	0.15
393	0.2
394	0.21
395	0.21
396	0.26
397	0.24
398	0.24
399	0.3
400	0.32
401	0.33
402	0.39
403	0.46
404	0.5
405	0.56
406	0.59
407	0.6
408	0.61
409	0.56
410	0.56
411	0.56
412	0.57
413	0.6
414	0.67
415	0.7
416	0.74
417	0.78
418	0.78
419	0.73
420	0.69
421	0.61
422	0.53
423	0.48
424	0.39
425	0.36
426	0.3
427	0.27
428	0.22
429	0.21
430	0.19
431	0.14
432	0.13
433	0.11
434	0.09
435	0.11
436	0.11
437	0.14
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.17
442	0.19
443	0.19
444	0.19
445	0.16
446	0.22
447	0.27
448	0.29
449	0.28
450	0.27
451	0.3
452	0.32
453	0.4
454	0.4
455	0.37
456	0.42
457	0.44
458	0.47
459	0.48
460	0.52
461	0.52
462	0.55
463	0.62
464	0.64
465	0.65
466	0.71
467	0.67
468	0.62
469	0.57
470	0.51
471	0.43
472	0.36
473	0.31
474	0.23
475	0.26
476	0.25
477	0.25
478	0.24
479	0.29
480	0.34
481	0.39
482	0.38
483	0.37
484	0.38
485	0.41
486	0.44
487	0.46
488	0.44
489	0.44
490	0.49
491	0.5
492	0.5
493	0.49
494	0.5
495	0.49
496	0.54
497	0.58
498	0.62
499	0.66
500	0.68
501	0.72
502	0.76
503	0.77
504	0.72
505	0.64
506	0.59
507	0.52
508	0.49
509	0.4
510	0.31
511	0.29
512	0.26
513	0.25
514	0.27
515	0.3
516	0.33
517	0.4
518	0.45
519	0.44
520	0.5
521	0.6
522	0.64
523	0.67
524	0.73
525	0.75
526	0.8
527	0.8
528	0.79
529	0.73
530	0.68
531	0.62
532	0.53
533	0.45
534	0.35
535	0.34
536	0.28
537	0.28
538	0.3
539	0.39
540	0.41
541	0.44
542	0.5
543	0.46
544	0.48
545	0.47
546	0.46
547	0.39
548	0.39
549	0.41
550	0.44
551	0.48
552	0.54
553	0.53
554	0.47
555	0.51
556	0.53
557	0.53
558	0.54
559	0.54
560	0.55
561	0.55
562	0.55
563	0.48
564	0.44
565	0.37
566	0.3
567	0.23
568	0.15
569	0.1
570	0.09
571	0.09
572	0.08
573	0.08
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.05
587	0.06
588	0.07
589	0.09
590	0.11
591	0.14
592	0.15
593	0.17
594	0.18
595	0.25
596	0.34
597	0.4
598	0.49
599	0.51
600	0.57
601	0.63
602	0.65
603	0.59
604	0.54
605	0.48
606	0.38
607	0.33
608	0.29
609	0.26
610	0.26
611	0.25
612	0.23
613	0.25
614	0.25
615	0.25
616	0.22
617	0.19
618	0.17
619	0.22
620	0.22
621	0.23
622	0.24
623	0.24
624	0.24
625	0.25
626	0.25
627	0.22
628	0.22
629	0.23
630	0.27
631	0.29
632	0.3
633	0.29
634	0.3
635	0.29
636	0.28
637	0.22
638	0.17
639	0.16
640	0.14
641	0.13
642	0.11
643	0.13
644	0.12
645	0.11
646	0.12
647	0.12
648	0.12
649	0.14
650	0.14
651	0.1
652	0.1
653	0.1
654	0.08
655	0.09
656	0.08
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.09
661	0.09
662	0.09
663	0.1
664	0.13
665	0.15
666	0.17
667	0.21
668	0.23
669	0.3
670	0.38
671	0.44
672	0.45
673	0.55
674	0.64
675	0.63
676	0.62
677	0.55
678	0.49
679	0.44
680	0.48
681	0.46
682	0.4
683	0.39
684	0.38
685	0.39
686	0.38
687	0.37
688	0.3
689	0.24
690	0.21
691	0.21
692	0.21
693	0.25
694	0.27
695	0.3
696	0.31
697	0.3
698	0.33
699	0.34
700	0.37

A0A1B7P1K6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer