Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7NJD6

Protein Details
Accession A0A1B7NJD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-242EAYIKGKEEKARREKARKEKAFVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-48PRHGKREGPSEPPRAANPANARAPRS
223-238KGKEEKARREKARKEK
Subcellular Location(s) nucl 7.5, cyto_nucl 7.5, cyto 6.5, mito 5, pero 4, extr 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences NDPEEDSDREPEPPTSAITKSAPRHGKREGPSEPPRAANPANARAPRSARGGGPYGNEQAFRDRDASARANRSKPVDAPQPDIPTGVVKNRDVRGNLLREDRTNRSDRTATSKSKQVEQGWGATSGESAWEDERAGEATARKEGREGPAGEGNADAEAAAAAAAEAEDKAKSYAEYLAELAEQRREDLGVQEARKPNEGVKADKKWATAKELKRDEDEEAYIKGKEEKARREKARKEKAFVEVDMRFVEPSRGGRGGGEGGHRGTALPQIVENQGQAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.23
4 0.25
5 0.27
6 0.33
7 0.35
8 0.43
9 0.5
10 0.5
11 0.55
12 0.58
13 0.63
14 0.61
15 0.66
16 0.62
17 0.62
18 0.66
19 0.66
20 0.62
21 0.56
22 0.52
23 0.49
24 0.45
25 0.43
26 0.41
27 0.42
28 0.47
29 0.47
30 0.48
31 0.47
32 0.49
33 0.45
34 0.44
35 0.38
36 0.32
37 0.33
38 0.34
39 0.31
40 0.3
41 0.3
42 0.28
43 0.27
44 0.26
45 0.23
46 0.26
47 0.25
48 0.24
49 0.22
50 0.19
51 0.19
52 0.24
53 0.28
54 0.29
55 0.36
56 0.41
57 0.42
58 0.45
59 0.48
60 0.46
61 0.43
62 0.43
63 0.43
64 0.4
65 0.43
66 0.44
67 0.43
68 0.4
69 0.38
70 0.32
71 0.25
72 0.23
73 0.22
74 0.21
75 0.19
76 0.25
77 0.26
78 0.3
79 0.28
80 0.31
81 0.33
82 0.34
83 0.35
84 0.34
85 0.34
86 0.33
87 0.37
88 0.37
89 0.36
90 0.37
91 0.35
92 0.34
93 0.35
94 0.33
95 0.37
96 0.39
97 0.38
98 0.37
99 0.42
100 0.39
101 0.41
102 0.45
103 0.38
104 0.37
105 0.33
106 0.33
107 0.28
108 0.28
109 0.23
110 0.17
111 0.15
112 0.1
113 0.09
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.08
125 0.08
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.16
132 0.2
133 0.2
134 0.18
135 0.21
136 0.21
137 0.2
138 0.18
139 0.16
140 0.1
141 0.09
142 0.06
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.16
176 0.18
177 0.19
178 0.25
179 0.29
180 0.3
181 0.32
182 0.31
183 0.28
184 0.31
185 0.33
186 0.33
187 0.37
188 0.41
189 0.44
190 0.46
191 0.46
192 0.44
193 0.43
194 0.44
195 0.45
196 0.47
197 0.52
198 0.57
199 0.57
200 0.55
201 0.54
202 0.5
203 0.44
204 0.39
205 0.31
206 0.26
207 0.25
208 0.22
209 0.21
210 0.21
211 0.22
212 0.27
213 0.32
214 0.41
215 0.49
216 0.59
217 0.68
218 0.75
219 0.81
220 0.85
221 0.89
222 0.86
223 0.82
224 0.77
225 0.75
226 0.69
227 0.61
228 0.57
229 0.47
230 0.41
231 0.37
232 0.32
233 0.24
234 0.2
235 0.21
236 0.17
237 0.18
238 0.22
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.23
243 0.23
244 0.22
245 0.22
246 0.2
247 0.19
248 0.2
249 0.19
250 0.17
251 0.16
252 0.18
253 0.17
254 0.15
255 0.15
256 0.17
257 0.2
258 0.21