Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0W4C8

Protein Details
Accession G0W4C8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
408-428VTALRHRRSSHKNKRPSVTESHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ndi:NDAI_0A05110  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MAVDEFDETIGQMIELFKEYKPGVITIDNITKLCHTLGLESFIDDVDATTLRLSTASKIIVIDIDFNKSDGKVKDVKLVLASNFDNFNYFNDDKDRSSTSTTKNILLNSLTLYQDLQVFHHNLQYLYLLDTFSQIDVDTGASASNDVGTGYSETSLSNNNGSINAAITTGKLDLFKYFTELSHYLKQYFNDNSIDSEIKTNLNDKFGIYIISKDDAEVPIAKLYFEKSNDPQHRLYEYIYSTETKSWINESSESFTCGINLIMELITKNPTDEYNSNIWFPQDFISTELIIQKNNTNVNDSSRSSIPIHNGLKPIILLESLAYNFTNSPYQYDQKIQFMNDFTTNLIPITRFNINNDNLELISEIFNWISWMTKILLTTFQLITKIQELGEDNGNEFFTRGTVRHPSVTALRHRRSSHKNKRPSVTESTMFKDERFQQFNLHEIMAEPVIIEEQDSDVVMEVDENDGPTDININNNNNILENSGDQNDQTNTTSNTAIGIDNLGINLNQEMDIDKPEETNIKKGENTISNTGKDNVTEFIMSEDHVSLGKLYTCSFYDDIKEWDLFVEKLKTFLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.11
3 0.13
4 0.12
5 0.18
6 0.18
7 0.2
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.22
12 0.25
13 0.25
14 0.31
15 0.3
16 0.29
17 0.29
18 0.26
19 0.26
20 0.24
21 0.21
22 0.15
23 0.17
24 0.19
25 0.23
26 0.22
27 0.21
28 0.21
29 0.18
30 0.17
31 0.13
32 0.11
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.16
49 0.19
50 0.17
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.21
55 0.19
56 0.25
57 0.2
58 0.25
59 0.28
60 0.29
61 0.37
62 0.37
63 0.38
64 0.35
65 0.37
66 0.33
67 0.31
68 0.3
69 0.24
70 0.24
71 0.22
72 0.2
73 0.17
74 0.18
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.24
79 0.27
80 0.27
81 0.3
82 0.32
83 0.27
84 0.32
85 0.37
86 0.37
87 0.43
88 0.44
89 0.44
90 0.43
91 0.41
92 0.38
93 0.32
94 0.28
95 0.22
96 0.23
97 0.19
98 0.16
99 0.16
100 0.14
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.16
105 0.18
106 0.18
107 0.21
108 0.22
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.15
113 0.14
114 0.14
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.19
167 0.2
168 0.24
169 0.29
170 0.3
171 0.29
172 0.3
173 0.31
174 0.31
175 0.31
176 0.29
177 0.24
178 0.23
179 0.22
180 0.23
181 0.23
182 0.17
183 0.18
184 0.16
185 0.14
186 0.15
187 0.17
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.16
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.13
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.09
210 0.11
211 0.14
212 0.14
213 0.18
214 0.2
215 0.3
216 0.35
217 0.39
218 0.39
219 0.38
220 0.38
221 0.35
222 0.32
223 0.26
224 0.22
225 0.2
226 0.19
227 0.18
228 0.17
229 0.16
230 0.16
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.19
239 0.19
240 0.2
241 0.19
242 0.16
243 0.14
244 0.13
245 0.11
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.11
259 0.12
260 0.16
261 0.18
262 0.19
263 0.2
264 0.19
265 0.19
266 0.15
267 0.15
268 0.12
269 0.09
270 0.08
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.14
276 0.13
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.14
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.2
286 0.23
287 0.22
288 0.22
289 0.2
290 0.22
291 0.21
292 0.22
293 0.2
294 0.24
295 0.25
296 0.25
297 0.26
298 0.23
299 0.22
300 0.2
301 0.18
302 0.1
303 0.08
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.08
315 0.12
316 0.14
317 0.17
318 0.18
319 0.23
320 0.24
321 0.26
322 0.27
323 0.25
324 0.24
325 0.23
326 0.23
327 0.19
328 0.18
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.11
333 0.1
334 0.08
335 0.07
336 0.1
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.23
341 0.24
342 0.26
343 0.25
344 0.23
345 0.19
346 0.18
347 0.16
348 0.1
349 0.09
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.13
364 0.12
365 0.15
366 0.14
367 0.14
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.1
374 0.12
375 0.13
376 0.14
377 0.18
378 0.17
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.14
383 0.12
384 0.1
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.11
389 0.17
390 0.2
391 0.21
392 0.22
393 0.24
394 0.28
395 0.33
396 0.39
397 0.42
398 0.44
399 0.49
400 0.52
401 0.58
402 0.63
403 0.69
404 0.71
405 0.71
406 0.78
407 0.79
408 0.84
409 0.81
410 0.76
411 0.74
412 0.68
413 0.64
414 0.57
415 0.54
416 0.52
417 0.46
418 0.4
419 0.37
420 0.39
421 0.41
422 0.42
423 0.38
424 0.39
425 0.39
426 0.43
427 0.38
428 0.31
429 0.22
430 0.19
431 0.2
432 0.13
433 0.12
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.04
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.09
457 0.08
458 0.13
459 0.18
460 0.2
461 0.22
462 0.24
463 0.25
464 0.22
465 0.22
466 0.18
467 0.15
468 0.14
469 0.15
470 0.15
471 0.15
472 0.14
473 0.17
474 0.17
475 0.18
476 0.18
477 0.19
478 0.19
479 0.21
480 0.21
481 0.18
482 0.18
483 0.17
484 0.15
485 0.12
486 0.11
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.14
504 0.2
505 0.22
506 0.28
507 0.29
508 0.31
509 0.32
510 0.35
511 0.41
512 0.41
513 0.44
514 0.45
515 0.47
516 0.45
517 0.47
518 0.47
519 0.4
520 0.34
521 0.3
522 0.23
523 0.2
524 0.18
525 0.15
526 0.15
527 0.15
528 0.14
529 0.14
530 0.13
531 0.11
532 0.11
533 0.12
534 0.1
535 0.11
536 0.14
537 0.13
538 0.14
539 0.16
540 0.17
541 0.21
542 0.22
543 0.22
544 0.24
545 0.26
546 0.29
547 0.3
548 0.29
549 0.24
550 0.24
551 0.25
552 0.21
553 0.24
554 0.27
555 0.23