Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7NYM5

Protein Details
Accession A0A1B7NYM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-162EDHARPSSRRSERKWSPLKKRKPDPLPAVPPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-153SSRRSERKWSPLKKRKP
409-418RRKRTLRREP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MADTMHSRPPTSSSTKVGASDLTDNEKNTPIPAPLSSQLPPPSPGSASFPPSRGSSLRIESQNEVPKEPSIPSPELPPSRIKTIHRVESEARRDSGLAPSRRGSRTTLATDELSAPSLKSPPSIPSIIIDEDHARPSSRRSERKWSPLKKRKPDPLPAVPPLPPVQSAPFRGITLDIPTGSFDDLTTDALESIAESPPKKVEDNSQTSVDGSQPKDNKDSKESITSGGANNGNTTLDVQSKATTATSLSSRRIRSNNSLRPRPASSAARVLSVDEEVLSQRVRLMYEKGDEDVDDAEVNELLGLYTEEATLNETFTATPAASSDAGKTERAITPAASVAGHSSRRGSFIQREPHELAGGLEDWENIQVGDVDRYGFIIPRRKEGDTPEAAPPVLQRVSTSLLLASTAPRRKRTLRREPSIAPSSRSFAGRSPPRKSTDQSRPTSSQSSYQINLHRSSSRIRYAANRLPYNKDRKFVDEASDMLTLPGQIAEEDDDSPRALAIKKKEWEREDKWKKMAKVVSKPQDGAGMTFEFDVKSSKLAERTWKGIPDRWRATAWYAFLRASAKKRKDSPTDTELIRSFNELQEEASPDDVQIDIDVPRTINSHIMFRRRYRGGQRLLFRVLHAMSLYFPDTGYVQGMAALAATLLAYYDEEHAFVMLVRLWQLRGLDRLYRSGFSGLMEALGNFEKEWLDGGEVAEKLTELGIPPTAYGTRWYLTLFNYSIPFPAQLRVWDVFMLLGDSDEPTTSVSASRPPTSSHIDTGTVNGKATPFQPHASPFGKSLDVLHATSAALIDGMRDIILESDFENAMKVLTSWVPIKDVEIFMRVARAEYKVHHRKKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.42
3 0.42
4 0.39
5 0.34
6 0.3
7 0.3
8 0.28
9 0.31
10 0.31
11 0.3
12 0.32
13 0.33
14 0.3
15 0.27
16 0.27
17 0.22
18 0.22
19 0.22
20 0.25
21 0.25
22 0.28
23 0.27
24 0.31
25 0.34
26 0.33
27 0.35
28 0.32
29 0.32
30 0.3
31 0.3
32 0.31
33 0.32
34 0.35
35 0.36
36 0.35
37 0.34
38 0.35
39 0.37
40 0.31
41 0.31
42 0.31
43 0.33
44 0.39
45 0.41
46 0.43
47 0.42
48 0.49
49 0.54
50 0.49
51 0.46
52 0.4
53 0.37
54 0.36
55 0.34
56 0.32
57 0.29
58 0.31
59 0.3
60 0.34
61 0.4
62 0.42
63 0.43
64 0.45
65 0.43
66 0.46
67 0.51
68 0.49
69 0.5
70 0.55
71 0.62
72 0.57
73 0.58
74 0.57
75 0.62
76 0.66
77 0.6
78 0.53
79 0.45
80 0.43
81 0.39
82 0.42
83 0.41
84 0.37
85 0.36
86 0.4
87 0.46
88 0.48
89 0.48
90 0.43
91 0.4
92 0.43
93 0.44
94 0.42
95 0.38
96 0.37
97 0.36
98 0.34
99 0.28
100 0.23
101 0.18
102 0.15
103 0.14
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.22
110 0.23
111 0.21
112 0.21
113 0.25
114 0.24
115 0.23
116 0.21
117 0.2
118 0.2
119 0.22
120 0.21
121 0.19
122 0.19
123 0.23
124 0.32
125 0.38
126 0.45
127 0.49
128 0.59
129 0.67
130 0.77
131 0.83
132 0.83
133 0.84
134 0.86
135 0.9
136 0.9
137 0.91
138 0.91
139 0.89
140 0.89
141 0.87
142 0.87
143 0.84
144 0.78
145 0.71
146 0.62
147 0.56
148 0.48
149 0.4
150 0.3
151 0.24
152 0.25
153 0.26
154 0.28
155 0.28
156 0.27
157 0.26
158 0.25
159 0.25
160 0.21
161 0.19
162 0.19
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.13
168 0.12
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.16
185 0.19
186 0.19
187 0.2
188 0.26
189 0.33
190 0.4
191 0.43
192 0.42
193 0.4
194 0.39
195 0.38
196 0.32
197 0.28
198 0.23
199 0.27
200 0.28
201 0.31
202 0.38
203 0.41
204 0.42
205 0.42
206 0.45
207 0.4
208 0.43
209 0.42
210 0.36
211 0.34
212 0.32
213 0.27
214 0.27
215 0.26
216 0.19
217 0.19
218 0.17
219 0.15
220 0.13
221 0.14
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.08
232 0.09
233 0.13
234 0.16
235 0.2
236 0.26
237 0.29
238 0.34
239 0.38
240 0.42
241 0.47
242 0.55
243 0.6
244 0.63
245 0.68
246 0.65
247 0.65
248 0.63
249 0.57
250 0.53
251 0.47
252 0.41
253 0.41
254 0.39
255 0.35
256 0.32
257 0.29
258 0.23
259 0.19
260 0.15
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.12
272 0.14
273 0.17
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.13
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.14
316 0.14
317 0.16
318 0.16
319 0.12
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.15
332 0.17
333 0.19
334 0.23
335 0.29
336 0.38
337 0.37
338 0.43
339 0.41
340 0.41
341 0.37
342 0.3
343 0.23
344 0.15
345 0.14
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.11
364 0.18
365 0.19
366 0.24
367 0.28
368 0.28
369 0.3
370 0.33
371 0.37
372 0.31
373 0.33
374 0.3
375 0.27
376 0.26
377 0.24
378 0.2
379 0.16
380 0.13
381 0.1
382 0.08
383 0.1
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.12
393 0.18
394 0.2
395 0.23
396 0.28
397 0.35
398 0.45
399 0.54
400 0.59
401 0.64
402 0.67
403 0.7
404 0.69
405 0.68
406 0.65
407 0.56
408 0.47
409 0.38
410 0.34
411 0.3
412 0.28
413 0.21
414 0.16
415 0.23
416 0.28
417 0.34
418 0.36
419 0.4
420 0.43
421 0.46
422 0.47
423 0.48
424 0.5
425 0.53
426 0.52
427 0.53
428 0.52
429 0.52
430 0.52
431 0.44
432 0.38
433 0.33
434 0.32
435 0.28
436 0.29
437 0.3
438 0.3
439 0.3
440 0.27
441 0.24
442 0.23
443 0.25
444 0.26
445 0.25
446 0.24
447 0.24
448 0.27
449 0.33
450 0.37
451 0.4
452 0.4
453 0.38
454 0.44
455 0.5
456 0.54
457 0.49
458 0.48
459 0.43
460 0.43
461 0.46
462 0.41
463 0.38
464 0.3
465 0.28
466 0.26
467 0.25
468 0.2
469 0.15
470 0.14
471 0.09
472 0.07
473 0.07
474 0.04
475 0.03
476 0.04
477 0.05
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.12
488 0.17
489 0.24
490 0.29
491 0.35
492 0.42
493 0.45
494 0.52
495 0.54
496 0.6
497 0.63
498 0.64
499 0.66
500 0.65
501 0.62
502 0.6
503 0.59
504 0.56
505 0.56
506 0.6
507 0.61
508 0.58
509 0.57
510 0.5
511 0.49
512 0.4
513 0.31
514 0.24
515 0.16
516 0.13
517 0.13
518 0.13
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.07
523 0.08
524 0.1
525 0.12
526 0.14
527 0.17
528 0.25
529 0.26
530 0.3
531 0.31
532 0.35
533 0.35
534 0.38
535 0.44
536 0.45
537 0.46
538 0.45
539 0.43
540 0.39
541 0.4
542 0.38
543 0.32
544 0.26
545 0.23
546 0.21
547 0.21
548 0.22
549 0.23
550 0.28
551 0.35
552 0.38
553 0.43
554 0.51
555 0.57
556 0.63
557 0.65
558 0.64
559 0.6
560 0.59
561 0.53
562 0.5
563 0.43
564 0.36
565 0.3
566 0.26
567 0.21
568 0.18
569 0.19
570 0.15
571 0.15
572 0.15
573 0.17
574 0.15
575 0.15
576 0.13
577 0.11
578 0.11
579 0.1
580 0.09
581 0.06
582 0.07
583 0.06
584 0.07
585 0.08
586 0.07
587 0.08
588 0.09
589 0.1
590 0.14
591 0.14
592 0.2
593 0.24
594 0.32
595 0.37
596 0.39
597 0.47
598 0.46
599 0.52
600 0.53
601 0.58
602 0.6
603 0.62
604 0.63
605 0.61
606 0.61
607 0.55
608 0.46
609 0.41
610 0.32
611 0.26
612 0.21
613 0.15
614 0.11
615 0.13
616 0.14
617 0.1
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.06
629 0.05
630 0.04
631 0.03
632 0.03
633 0.02
634 0.02
635 0.03
636 0.03
637 0.04
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.07
645 0.08
646 0.06
647 0.07
648 0.08
649 0.09
650 0.09
651 0.11
652 0.13
653 0.14
654 0.17
655 0.19
656 0.22
657 0.23
658 0.29
659 0.29
660 0.28
661 0.28
662 0.26
663 0.23
664 0.19
665 0.18
666 0.13
667 0.11
668 0.11
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.09
675 0.08
676 0.08
677 0.09
678 0.08
679 0.08
680 0.09
681 0.1
682 0.13
683 0.13
684 0.13
685 0.11
686 0.1
687 0.09
688 0.09
689 0.08
690 0.05
691 0.07
692 0.09
693 0.09
694 0.09
695 0.11
696 0.12
697 0.12
698 0.14
699 0.16
700 0.14
701 0.15
702 0.17
703 0.16
704 0.17
705 0.22
706 0.2
707 0.19
708 0.21
709 0.2
710 0.2
711 0.19
712 0.2
713 0.16
714 0.18
715 0.17
716 0.17
717 0.22
718 0.22
719 0.22
720 0.19
721 0.19
722 0.16
723 0.14
724 0.13
725 0.08
726 0.07
727 0.06
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.08
734 0.08
735 0.09
736 0.1
737 0.16
738 0.2
739 0.23
740 0.24
741 0.26
742 0.31
743 0.37
744 0.39
745 0.37
746 0.35
747 0.34
748 0.33
749 0.34
750 0.34
751 0.27
752 0.24
753 0.22
754 0.2
755 0.2
756 0.21
757 0.24
758 0.22
759 0.24
760 0.27
761 0.29
762 0.35
763 0.36
764 0.36
765 0.31
766 0.31
767 0.3
768 0.27
769 0.26
770 0.26
771 0.27
772 0.25
773 0.23
774 0.21
775 0.19
776 0.19
777 0.17
778 0.1
779 0.07
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.06
784 0.05
785 0.05
786 0.06
787 0.06
788 0.07
789 0.07
790 0.07
791 0.09
792 0.1
793 0.1
794 0.11
795 0.09
796 0.09
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.1
801 0.14
802 0.16
803 0.17
804 0.19
805 0.19
806 0.21
807 0.22
808 0.24
809 0.23
810 0.22
811 0.22
812 0.21
813 0.24
814 0.22
815 0.2
816 0.19
817 0.2
818 0.21
819 0.26
820 0.36
821 0.44