Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B7NU99

Protein Details
Accession A0A1B7NU99    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-413QDIRNEERRARKRARRSANAILGHydrophilic
441-460QDDRKTTKKDSKKADSKVTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
398-406RRARKRARR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQTQYQQFASQAFSPPGSSPSPSAGVPSPVSGIAPPPKRQRLSPLPQSHSPYASPGFGTLQLPRTESPVNGNFPNGTSTLTMNAPPPGSMGPPSRPIEKATDTAELTDVLASSGIDVREEEEYLTHAYGQAPPAPQQPPRIQTNFNNSFVSQPSAGAVSSGNSFAESTLRKSTPSQGVFAIPTPSTAEPAPAETSEAAAEDEKLRHDTAASRRMQYPLQAPFLFTAMVEDRIQKRAYDLGVRIPAQGVYRPFPGRAAGPVEVTGPDGSSVIRTGKTLLTQDAPLGDILSLITLACEERLRSVIDHSYGLARNRRANSHGAFPLEWSDVAVTLTPPGEMVGGPSDMESSDNTTISKCAFADETAKGGEPSNKKTVTTGNIIAKRSRSLIEQDIRNEERRARKRARRSANAILGGDSSRAGSVGAGTPGTATPTTAPSERTQDDRKTTKKDSKKADSKVTEAVQHQQSVETARMATNNLTSGVRFGGKKKTYSWLTSGSPVASRSGFSTPPRSSTSTTVPVASAAKSSGSTVGGPNKSVGKQMGDWREDDKERGAGIQIRDILFVLEVDGKASKHLQKAYSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.24
4 0.27
5 0.25
6 0.24
7 0.22
8 0.24
9 0.25
10 0.23
11 0.26
12 0.24
13 0.26
14 0.25
15 0.24
16 0.21
17 0.19
18 0.2
19 0.16
20 0.2
21 0.25
22 0.3
23 0.37
24 0.45
25 0.54
26 0.57
27 0.6
28 0.64
29 0.66
30 0.69
31 0.72
32 0.72
33 0.7
34 0.74
35 0.78
36 0.71
37 0.64
38 0.55
39 0.49
40 0.41
41 0.36
42 0.29
43 0.23
44 0.22
45 0.21
46 0.22
47 0.21
48 0.24
49 0.24
50 0.26
51 0.25
52 0.27
53 0.27
54 0.26
55 0.3
56 0.31
57 0.34
58 0.32
59 0.33
60 0.3
61 0.29
62 0.3
63 0.23
64 0.18
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.16
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.18
78 0.21
79 0.22
80 0.29
81 0.32
82 0.34
83 0.34
84 0.35
85 0.37
86 0.36
87 0.36
88 0.32
89 0.34
90 0.3
91 0.3
92 0.28
93 0.22
94 0.18
95 0.15
96 0.12
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.08
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.14
118 0.16
119 0.16
120 0.18
121 0.23
122 0.25
123 0.28
124 0.33
125 0.37
126 0.39
127 0.45
128 0.47
129 0.46
130 0.49
131 0.56
132 0.56
133 0.52
134 0.49
135 0.42
136 0.4
137 0.37
138 0.34
139 0.23
140 0.17
141 0.15
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.09
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.11
154 0.11
155 0.14
156 0.19
157 0.2
158 0.21
159 0.23
160 0.3
161 0.34
162 0.35
163 0.33
164 0.28
165 0.3
166 0.29
167 0.29
168 0.24
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.11
177 0.13
178 0.14
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.17
196 0.22
197 0.3
198 0.31
199 0.32
200 0.33
201 0.35
202 0.35
203 0.32
204 0.31
205 0.27
206 0.3
207 0.27
208 0.26
209 0.25
210 0.25
211 0.21
212 0.15
213 0.13
214 0.09
215 0.11
216 0.11
217 0.14
218 0.16
219 0.19
220 0.19
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.19
228 0.23
229 0.23
230 0.22
231 0.2
232 0.2
233 0.16
234 0.18
235 0.15
236 0.14
237 0.17
238 0.18
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.15
243 0.15
244 0.17
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.02
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.09
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.17
297 0.2
298 0.21
299 0.25
300 0.27
301 0.28
302 0.28
303 0.31
304 0.3
305 0.3
306 0.3
307 0.26
308 0.25
309 0.23
310 0.22
311 0.18
312 0.16
313 0.11
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.13
354 0.19
355 0.19
356 0.23
357 0.28
358 0.29
359 0.29
360 0.3
361 0.32
362 0.3
363 0.31
364 0.31
365 0.32
366 0.36
367 0.38
368 0.38
369 0.36
370 0.33
371 0.31
372 0.26
373 0.21
374 0.21
375 0.27
376 0.31
377 0.34
378 0.35
379 0.4
380 0.42
381 0.43
382 0.4
383 0.38
384 0.43
385 0.46
386 0.53
387 0.56
388 0.63
389 0.7
390 0.79
391 0.83
392 0.82
393 0.82
394 0.82
395 0.79
396 0.73
397 0.63
398 0.53
399 0.44
400 0.35
401 0.27
402 0.18
403 0.11
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.1
416 0.08
417 0.07
418 0.08
419 0.1
420 0.13
421 0.14
422 0.16
423 0.17
424 0.23
425 0.24
426 0.29
427 0.34
428 0.37
429 0.44
430 0.5
431 0.55
432 0.56
433 0.63
434 0.67
435 0.7
436 0.72
437 0.74
438 0.77
439 0.8
440 0.79
441 0.81
442 0.75
443 0.69
444 0.67
445 0.59
446 0.53
447 0.45
448 0.46
449 0.39
450 0.36
451 0.33
452 0.27
453 0.26
454 0.23
455 0.23
456 0.16
457 0.14
458 0.13
459 0.14
460 0.15
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.13
467 0.13
468 0.14
469 0.16
470 0.17
471 0.19
472 0.28
473 0.31
474 0.34
475 0.36
476 0.43
477 0.45
478 0.47
479 0.48
480 0.44
481 0.42
482 0.43
483 0.42
484 0.35
485 0.31
486 0.28
487 0.26
488 0.2
489 0.18
490 0.17
491 0.19
492 0.22
493 0.24
494 0.32
495 0.31
496 0.35
497 0.39
498 0.41
499 0.4
500 0.41
501 0.45
502 0.42
503 0.42
504 0.39
505 0.34
506 0.32
507 0.3
508 0.26
509 0.2
510 0.14
511 0.13
512 0.13
513 0.14
514 0.13
515 0.13
516 0.14
517 0.17
518 0.25
519 0.26
520 0.26
521 0.28
522 0.31
523 0.3
524 0.33
525 0.31
526 0.27
527 0.3
528 0.38
529 0.45
530 0.42
531 0.43
532 0.42
533 0.47
534 0.45
535 0.43
536 0.38
537 0.32
538 0.3
539 0.3
540 0.3
541 0.29
542 0.28
543 0.31
544 0.32
545 0.29
546 0.29
547 0.28
548 0.24
549 0.19
550 0.17
551 0.13
552 0.12
553 0.11
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.16
558 0.23
559 0.27
560 0.3
561 0.36