Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B8DNT8

Protein Details
Accession A0A1B8DNT8    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSSIKEVKVKKDKSGKKSKSADKIDAPHydrophilic
39-78EDAPAEVKPKKDKKEKKEKKEKSEKSSKKRKSTGEEPIADBasic
138-162TLPQPPSKKDLRRLKKGKSLSKAKTHydrophilic
406-430DYAEAATKKKEKKKVPMKRVYVNMIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-19KVKKDKSGKKSK
46-73KPKKDKKEKKEKKEKSEKSSKKRKSTGE
81-85PKKSK
144-172SKKDLRRLKKGKSLSKAKTVSDVKPAPKP
413-423KKKEKKKVPMK
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSIKEVKVKKDKSGKKSKSADKIDAPAPVESSEDVVLEDAPAEVKPKKDKKEKKEKKEKSEKSSKKRKSTGEEPIADSTPKKSKRTRSTEEDTATKSASPQPEAMEVDADETAADEPPSKKRKSTTVDGEELEVDVTLPQPPSKKDLRRLKKGKSLSKAKTVSDVKPAPKPKADGEEGADGSGAEDAAAPQKPEQEKRSEHGIWVGNLPWSVSKEDLKSFLINQGPMPEEAITRIHMPSPDDKKSANKVESRFTRTQHNKGFAYVDFSTAEHTLAAVALSEELLGGRRVLIKNNKSFEGRPLVVKDAVAKKEMKAPSKRVFLGNLRFDTTEESLKEHFERCGPIETCMVATFEDSGKCKGYAWITFADLEASARAVRGFVLEEEENSDVDTDDEEDSEVDEDPEDYAEAATKKKEKKKVPMKRVYVNMIQRRPVRIEFAEDAQVRYKKRYGAGGTKNPLNADGEVAEKKEKVVSGVIVPSKKAQNIEYRTDYAPRLTGGIVESKGTKVAFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.81
3 0.81
4 0.87
5 0.87
6 0.87
7 0.85
8 0.82
9 0.78
10 0.75
11 0.68
12 0.63
13 0.56
14 0.46
15 0.39
16 0.32
17 0.26
18 0.2
19 0.19
20 0.15
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.08
26 0.08
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.1
31 0.12
32 0.18
33 0.28
34 0.37
35 0.47
36 0.58
37 0.68
38 0.75
39 0.84
40 0.9
41 0.91
42 0.94
43 0.94
44 0.94
45 0.95
46 0.94
47 0.93
48 0.93
49 0.92
50 0.92
51 0.93
52 0.91
53 0.9
54 0.89
55 0.88
56 0.85
57 0.84
58 0.84
59 0.83
60 0.77
61 0.7
62 0.66
63 0.59
64 0.51
65 0.42
66 0.37
67 0.36
68 0.39
69 0.42
70 0.46
71 0.55
72 0.65
73 0.74
74 0.77
75 0.76
76 0.78
77 0.79
78 0.75
79 0.69
80 0.62
81 0.54
82 0.46
83 0.37
84 0.31
85 0.29
86 0.28
87 0.25
88 0.23
89 0.23
90 0.26
91 0.27
92 0.26
93 0.21
94 0.17
95 0.16
96 0.15
97 0.12
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.09
104 0.11
105 0.2
106 0.28
107 0.29
108 0.32
109 0.36
110 0.45
111 0.49
112 0.56
113 0.58
114 0.57
115 0.6
116 0.57
117 0.54
118 0.45
119 0.38
120 0.29
121 0.18
122 0.11
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.09
128 0.12
129 0.14
130 0.19
131 0.28
132 0.35
133 0.43
134 0.54
135 0.62
136 0.7
137 0.77
138 0.8
139 0.8
140 0.82
141 0.81
142 0.8
143 0.8
144 0.74
145 0.75
146 0.71
147 0.62
148 0.62
149 0.58
150 0.51
151 0.49
152 0.5
153 0.43
154 0.47
155 0.52
156 0.47
157 0.45
158 0.46
159 0.4
160 0.41
161 0.4
162 0.35
163 0.33
164 0.33
165 0.29
166 0.26
167 0.23
168 0.16
169 0.14
170 0.11
171 0.08
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.14
180 0.17
181 0.23
182 0.26
183 0.31
184 0.33
185 0.36
186 0.43
187 0.38
188 0.35
189 0.36
190 0.35
191 0.28
192 0.26
193 0.24
194 0.17
195 0.16
196 0.16
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.14
203 0.15
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.16
208 0.19
209 0.19
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.15
215 0.15
216 0.11
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.18
227 0.24
228 0.26
229 0.26
230 0.27
231 0.3
232 0.36
233 0.4
234 0.38
235 0.36
236 0.36
237 0.42
238 0.46
239 0.49
240 0.46
241 0.41
242 0.47
243 0.48
244 0.54
245 0.51
246 0.51
247 0.44
248 0.42
249 0.43
250 0.32
251 0.32
252 0.24
253 0.2
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.08
276 0.09
277 0.15
278 0.23
279 0.29
280 0.35
281 0.38
282 0.4
283 0.39
284 0.39
285 0.38
286 0.37
287 0.31
288 0.28
289 0.27
290 0.27
291 0.25
292 0.24
293 0.26
294 0.24
295 0.25
296 0.25
297 0.23
298 0.22
299 0.29
300 0.33
301 0.36
302 0.36
303 0.42
304 0.47
305 0.52
306 0.53
307 0.47
308 0.47
309 0.46
310 0.48
311 0.46
312 0.41
313 0.37
314 0.36
315 0.34
316 0.33
317 0.28
318 0.24
319 0.18
320 0.19
321 0.18
322 0.2
323 0.21
324 0.19
325 0.18
326 0.16
327 0.18
328 0.18
329 0.25
330 0.24
331 0.24
332 0.24
333 0.23
334 0.22
335 0.2
336 0.18
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.12
342 0.12
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.17
348 0.19
349 0.19
350 0.21
351 0.2
352 0.2
353 0.2
354 0.2
355 0.17
356 0.13
357 0.11
358 0.08
359 0.08
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.06
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.14
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.09
396 0.1
397 0.12
398 0.16
399 0.23
400 0.32
401 0.41
402 0.5
403 0.56
404 0.66
405 0.75
406 0.82
407 0.86
408 0.87
409 0.87
410 0.85
411 0.83
412 0.78
413 0.75
414 0.74
415 0.72
416 0.67
417 0.66
418 0.62
419 0.6
420 0.59
421 0.53
422 0.49
423 0.41
424 0.42
425 0.38
426 0.37
427 0.41
428 0.36
429 0.36
430 0.37
431 0.4
432 0.35
433 0.38
434 0.38
435 0.35
436 0.38
437 0.44
438 0.45
439 0.51
440 0.59
441 0.63
442 0.66
443 0.65
444 0.64
445 0.56
446 0.49
447 0.42
448 0.32
449 0.24
450 0.19
451 0.19
452 0.19
453 0.21
454 0.22
455 0.19
456 0.2
457 0.2
458 0.2
459 0.18
460 0.19
461 0.19
462 0.21
463 0.27
464 0.32
465 0.31
466 0.32
467 0.35
468 0.37
469 0.38
470 0.37
471 0.35
472 0.4
473 0.44
474 0.51
475 0.52
476 0.51
477 0.5
478 0.52
479 0.49
480 0.41
481 0.37
482 0.29
483 0.25
484 0.21
485 0.2
486 0.18
487 0.22
488 0.2
489 0.2
490 0.2
491 0.19
492 0.22