FuNGI

I2JVM6

Protein Details

Accession

I2JVM6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
222-243	IDNEKIKKSKNKEKTLPTKDSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
289-307	RKKYKMAKAEKPPIKKQKK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MQPSAQNPLHGDVNDSIHFIITNFIEMNKLWVRWQHQGHSSEFEKRTEERKELQVLVGSNLVRISQLEAIKRVYYKKNILPLILEQIVKCRDVIAQEYLLDVIIQVFPDEFHLITMDELFNATLRLDPAVSSKKIILSLVERLIAFKKREPEYVSRVVAEDSVDIFGKFIEFIDKLLEWKPDLSADDYCKLLCGLCRLSVIYYSQKYENLDSVYEHAVKFYIDNEKIKKSKNXKEKTLPTKDSSKDNTSQSCWKDLLTCPVYQYSDVTTVLKLGDSYLKFVNAMSYEIRKKYKMAKAEKPPIKKQKKPIQTSGDILGGSPNTTAADLTENTEKAPEDXMEXQKNEEFLSKFIHTIYNKNPYKNFELLESAQKELAKGEQRVKYTYPALVSTTLKLIRKLYLVKHLQTDRQKKKVNRFFTFISAILSELSKHSYNAIDCFNMNLTTAEIADEIGMENISYDFFIESLVIYEQFFLDSRSQYQALMGLINKLIGAKNLMKTDNFDRLITRTTIYCSKLLRKTDQCRAIYMASHLWWIVDDTEKTEDADESEIPDLVSGVGHLSLKSDGKRVLECLQRALRTADSILDSNVSLELFIEILNQSLYFFIHGNNLITVRYLNGLIELIENNFSSLGKIEGPSLLTWNHFQRTLKYVSEQKAIDSRFDEVHA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.23
4	0.19
5	0.19
6	0.15
7	0.16
8	0.11
9	0.13
10	0.12
11	0.12
12	0.14
13	0.13
14	0.2
15	0.2
16	0.21
17	0.21
18	0.27
19	0.32
20	0.39
21	0.46
22	0.46
23	0.5
24	0.54
25	0.54
26	0.55
27	0.53
28	0.54
29	0.5
30	0.45
31	0.42
32	0.41
33	0.46
34	0.46
35	0.49
36	0.45
37	0.5
38	0.53
39	0.51
40	0.49
41	0.46
42	0.4
43	0.36
44	0.34
45	0.27
46	0.22
47	0.2
48	0.17
49	0.13
50	0.13
51	0.14
52	0.15
53	0.19
54	0.21
55	0.24
56	0.26
57	0.29
58	0.32
59	0.36
60	0.38
61	0.42
62	0.47
63	0.5
64	0.57
65	0.56
66	0.54
67	0.5
68	0.45
69	0.45
70	0.4
71	0.35
72	0.26
73	0.3
74	0.31
75	0.28
76	0.25
77	0.19
78	0.17
79	0.19
80	0.23
81	0.2
82	0.2
83	0.19
84	0.2
85	0.19
86	0.17
87	0.14
88	0.1
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.09
96	0.1
97	0.09
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.11
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.08
113	0.08
114	0.08
115	0.14
116	0.2
117	0.21
118	0.21
119	0.22
120	0.23
121	0.24
122	0.24
123	0.21
124	0.18
125	0.22
126	0.22
127	0.22
128	0.2
129	0.21
130	0.25
131	0.28
132	0.27
133	0.27
134	0.33
135	0.34
136	0.39
137	0.43
138	0.46
139	0.47
140	0.52
141	0.49
142	0.42
143	0.4
144	0.35
145	0.3
146	0.24
147	0.17
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.11
161	0.12
162	0.13
163	0.16
164	0.17
165	0.14
166	0.15
167	0.15
168	0.14
169	0.15
170	0.16
171	0.17
172	0.19
173	0.2
174	0.2
175	0.19
176	0.18
177	0.16
178	0.14
179	0.12
180	0.13
181	0.13
182	0.14
183	0.16
184	0.16
185	0.16
186	0.17
187	0.19
188	0.21
189	0.2
190	0.22
191	0.22
192	0.24
193	0.25
194	0.25
195	0.25
196	0.2
197	0.19
198	0.17
199	0.18
200	0.19
201	0.19
202	0.17
203	0.14
204	0.13
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.16
209	0.18
210	0.23
211	0.26
212	0.33
213	0.37
214	0.43
215	0.49
216	0.5
217	0.58
218	0.64
219	0.7
220	0.72
221	0.78
222	0.82
223	0.83
224	0.81
225	0.74
226	0.71
227	0.64
228	0.63
229	0.58
230	0.52
231	0.48
232	0.45
233	0.46
234	0.41
235	0.46
236	0.4
237	0.38
238	0.33
239	0.28
240	0.27
241	0.25
242	0.31
243	0.26
244	0.25
245	0.22
246	0.24
247	0.25
248	0.21
249	0.21
250	0.14
251	0.14
252	0.14
253	0.13
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.08
259	0.06
260	0.11
261	0.1
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.13
267	0.14
268	0.09
269	0.11
270	0.1
271	0.14
272	0.17
273	0.21
274	0.23
275	0.22
276	0.24
277	0.32
278	0.35
279	0.4
280	0.45
281	0.5
282	0.58
283	0.68
284	0.72
285	0.7
286	0.74
287	0.76
288	0.77
289	0.74
290	0.74
291	0.74
292	0.77
293	0.76
294	0.76
295	0.72
296	0.65
297	0.61
298	0.53
299	0.45
300	0.35
301	0.28
302	0.2
303	0.13
304	0.1
305	0.08
306	0.06
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.06
312	0.06
313	0.08
314	0.1
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.08
320	0.09
321	0.08
322	0.12
323	0.14
324	0.16
325	0.18
326	0.18
327	0.18
328	0.17
329	0.17
330	0.12
331	0.11
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.16
337	0.16
338	0.2
339	0.25
340	0.31
341	0.33
342	0.36
343	0.38
344	0.36
345	0.4
346	0.38
347	0.34
348	0.25
349	0.26
350	0.25
351	0.29
352	0.27
353	0.22
354	0.21
355	0.21
356	0.19
357	0.16
358	0.19
359	0.17
360	0.19
361	0.25
362	0.28
363	0.3
364	0.32
365	0.33
366	0.32
367	0.28
368	0.27
369	0.21
370	0.18
371	0.18
372	0.18
373	0.18
374	0.15
375	0.17
376	0.19
377	0.19
378	0.19
379	0.19
380	0.18
381	0.2
382	0.23
383	0.22
384	0.28
385	0.31
386	0.31
387	0.36
388	0.37
389	0.41
390	0.47
391	0.56
392	0.54
393	0.59
394	0.66
395	0.66
396	0.75
397	0.77
398	0.77
399	0.7
400	0.67
401	0.6
402	0.56
403	0.53
404	0.42
405	0.34
406	0.24
407	0.2
408	0.16
409	0.14
410	0.1
411	0.08
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.11
416	0.13
417	0.14
418	0.16
419	0.17
420	0.14
421	0.14
422	0.15
423	0.15
424	0.12
425	0.12
426	0.1
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.03
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.07
456	0.07
457	0.08
458	0.1
459	0.11
460	0.13
461	0.16
462	0.17
463	0.16
464	0.16
465	0.16
466	0.14
467	0.15
468	0.13
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.1
473	0.09
474	0.09
475	0.08
476	0.11
477	0.13
478	0.17
479	0.21
480	0.22
481	0.22
482	0.26
483	0.3
484	0.34
485	0.32
486	0.29
487	0.27
488	0.28
489	0.31
490	0.28
491	0.25
492	0.17
493	0.2
494	0.25
495	0.25
496	0.27
497	0.28
498	0.35
499	0.4
500	0.45
501	0.5
502	0.54
503	0.6
504	0.66
505	0.7
506	0.63
507	0.59
508	0.58
509	0.5
510	0.42
511	0.37
512	0.3
513	0.22
514	0.21
515	0.18
516	0.15
517	0.13
518	0.13
519	0.11
520	0.12
521	0.12
522	0.14
523	0.16
524	0.17
525	0.17
526	0.17
527	0.16
528	0.13
529	0.15
530	0.13
531	0.12
532	0.12
533	0.12
534	0.11
535	0.11
536	0.1
537	0.07
538	0.07
539	0.05
540	0.05
541	0.06
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.11
546	0.14
547	0.16
548	0.2
549	0.21
550	0.24
551	0.26
552	0.28
553	0.33
554	0.36
555	0.36
556	0.4
557	0.43
558	0.41
559	0.42
560	0.41
561	0.35
562	0.3
563	0.29
564	0.24
565	0.2
566	0.2
567	0.19
568	0.17
569	0.15
570	0.14
571	0.14
572	0.11
573	0.08
574	0.07
575	0.07
576	0.06
577	0.06
578	0.07
579	0.06
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.09
589	0.13
590	0.15
591	0.16
592	0.17
593	0.18
594	0.16
595	0.17
596	0.16
597	0.13
598	0.13
599	0.12
600	0.1
601	0.1
602	0.1
603	0.1
604	0.11
605	0.11
606	0.11
607	0.12
608	0.12
609	0.12
610	0.12
611	0.11
612	0.1
613	0.1
614	0.11
615	0.11
616	0.11
617	0.12
618	0.14
619	0.16
620	0.15
621	0.17
622	0.17
623	0.18
624	0.22
625	0.27
626	0.28
627	0.31
628	0.32
629	0.34
630	0.39
631	0.42
632	0.4
633	0.41
634	0.46
635	0.47
636	0.53
637	0.48
638	0.46
639	0.49
640	0.47
641	0.44
642	0.38
643	0.35

I2JVM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer