Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1B8DL56

Protein Details
Accession A0A1B8DL56    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-501KAAPATKPKKLRSLRQNPWTAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
476-491LKEKAAPATKPKKLRS
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MDMLSFLTRFEKLTRTSVEPLQAVEYITQYFEGAALTWWTNFQFQIERRLTSRQAPINAQQLCNELQQAFGDIHSIERRREKYEAMKQTKSVRDFANSLKHQVLFLDPTPTEYEILRRFQTGLRTDIRAKMEENHGDIRDLDSYINKADDVDRALFRVKQLQKSSNETQGQNYGMGSNMPSAQNDPAGFKKWCQENKACFNCDLQGQLGDALQEASIPYEYPTTENDEQQDSSKAASSECLGSLNSIGSSMMVVSGETLQGQPQTLKMLLDCGADRVYIARRVAMKIGGIKQGQTTRVDLPDGGAVTSNEYIRLKTLHRTVKRDRVEPTETAKNRFEDMFTARPKKPKTQTHGGFDDESESDDDKILGDVGAMVKGIDAECDIAANSGRLSLFAMSRPGSSSSKVSGSSSKSRPAVKSKAVNLSDGDETNYEMLAKPSLQKAHAPQPFDQDLDSFVSDDDDLPVAVSKAATTKPALKEKAAPATKPKKLRSLRQNPWTAKAYAAKQAKIKITAPDVNEDVTESPVGPGKAGQAAEQAQTHVKHVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.42
4 0.45
5 0.47
6 0.42
7 0.39
8 0.35
9 0.31
10 0.26
11 0.23
12 0.2
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.11
17 0.1
18 0.09
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.21
31 0.23
32 0.33
33 0.35
34 0.37
35 0.38
36 0.44
37 0.45
38 0.45
39 0.51
40 0.47
41 0.49
42 0.51
43 0.54
44 0.56
45 0.56
46 0.5
47 0.43
48 0.39
49 0.36
50 0.33
51 0.29
52 0.21
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.14
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.13
61 0.19
62 0.21
63 0.24
64 0.33
65 0.36
66 0.4
67 0.43
68 0.45
69 0.49
70 0.57
71 0.63
72 0.62
73 0.63
74 0.62
75 0.68
76 0.7
77 0.63
78 0.57
79 0.49
80 0.45
81 0.45
82 0.46
83 0.47
84 0.41
85 0.42
86 0.4
87 0.38
88 0.34
89 0.31
90 0.28
91 0.22
92 0.21
93 0.23
94 0.19
95 0.21
96 0.23
97 0.24
98 0.22
99 0.18
100 0.24
101 0.23
102 0.27
103 0.25
104 0.24
105 0.25
106 0.27
107 0.34
108 0.3
109 0.31
110 0.31
111 0.34
112 0.36
113 0.4
114 0.4
115 0.34
116 0.32
117 0.32
118 0.35
119 0.34
120 0.35
121 0.34
122 0.32
123 0.31
124 0.29
125 0.27
126 0.21
127 0.18
128 0.15
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.26
145 0.28
146 0.33
147 0.38
148 0.44
149 0.47
150 0.54
151 0.57
152 0.56
153 0.56
154 0.49
155 0.45
156 0.41
157 0.38
158 0.3
159 0.26
160 0.17
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.19
175 0.19
176 0.19
177 0.25
178 0.31
179 0.35
180 0.39
181 0.45
182 0.49
183 0.58
184 0.64
185 0.59
186 0.52
187 0.48
188 0.43
189 0.36
190 0.28
191 0.19
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.15
211 0.17
212 0.18
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.21
217 0.21
218 0.14
219 0.13
220 0.14
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.15
272 0.14
273 0.14
274 0.17
275 0.19
276 0.18
277 0.18
278 0.19
279 0.21
280 0.22
281 0.2
282 0.2
283 0.17
284 0.18
285 0.18
286 0.15
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.12
301 0.12
302 0.15
303 0.23
304 0.3
305 0.35
306 0.43
307 0.49
308 0.57
309 0.6
310 0.59
311 0.55
312 0.53
313 0.52
314 0.47
315 0.46
316 0.46
317 0.43
318 0.44
319 0.43
320 0.37
321 0.35
322 0.32
323 0.27
324 0.21
325 0.24
326 0.26
327 0.29
328 0.35
329 0.36
330 0.43
331 0.46
332 0.52
333 0.56
334 0.58
335 0.6
336 0.65
337 0.68
338 0.68
339 0.68
340 0.61
341 0.53
342 0.44
343 0.38
344 0.27
345 0.22
346 0.16
347 0.13
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.13
382 0.12
383 0.13
384 0.15
385 0.18
386 0.18
387 0.19
388 0.2
389 0.2
390 0.22
391 0.22
392 0.22
393 0.24
394 0.28
395 0.34
396 0.35
397 0.39
398 0.41
399 0.45
400 0.49
401 0.52
402 0.54
403 0.53
404 0.57
405 0.57
406 0.62
407 0.58
408 0.54
409 0.47
410 0.43
411 0.37
412 0.3
413 0.25
414 0.16
415 0.16
416 0.14
417 0.13
418 0.1
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.12
424 0.17
425 0.2
426 0.21
427 0.25
428 0.3
429 0.38
430 0.41
431 0.42
432 0.39
433 0.44
434 0.44
435 0.4
436 0.35
437 0.25
438 0.24
439 0.23
440 0.22
441 0.14
442 0.12
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.1
456 0.11
457 0.13
458 0.15
459 0.22
460 0.29
461 0.38
462 0.41
463 0.4
464 0.47
465 0.51
466 0.58
467 0.55
468 0.51
469 0.53
470 0.6
471 0.65
472 0.67
473 0.66
474 0.66
475 0.7
476 0.77
477 0.78
478 0.79
479 0.81
480 0.82
481 0.87
482 0.81
483 0.79
484 0.73
485 0.63
486 0.57
487 0.53
488 0.47
489 0.46
490 0.48
491 0.46
492 0.46
493 0.52
494 0.52
495 0.5
496 0.5
497 0.46
498 0.48
499 0.49
500 0.46
501 0.45
502 0.41
503 0.37
504 0.34
505 0.3
506 0.23
507 0.2
508 0.18
509 0.13
510 0.13
511 0.16
512 0.16
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.19
517 0.19
518 0.19
519 0.2
520 0.22
521 0.25
522 0.25
523 0.25
524 0.26
525 0.26